#NEXUS
BEGIN DATA;
DIMENSIONS  NTAX=86 NCHAR=6924;
FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS=" 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 E I J Z" MISSING=? INTERLEAVE GAP=-;
OPTIONS GAPMODE=MISSING;
CHARLABELS
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	;
STATELABELS  
	1  wide narrow,
	2  boomerang strap block,
	3  wide narrow,
	4  no yes,
	5  wedge plate,
	6  mesial anterior,
	7  #11 #12,
	8  yes no,
	9  wide narrow,
	10  yes no,
	11  horizontal sloping_anteriorly,
	12  yes no,
	13  c > > t 'c>=t',
	14  not_prominent prominent,
	15  no yes,
	16  no yes,
	17  tall reduced_or_absent,
	18  amphicoelous procoelous,
	19  no yes,
	20  wide narrow,
	21  late_if_at_all early,
	22  yes no,
	23  thin wide,
	24  late_in_ontogeny early_in_ontogeny,
	25  narrow wide,
	26  straight concave,
	27  pointed rounded,
	28  'rounded,_smooth' 'rounded,_modest_waist' 'rounded,_strong_waist' 'narrow,_strong_waist' broad_post._tip,
	29  separate unified,
	30  no moderate severe,
	31  flat not_flat,
	32  narrow broad,
	33  no yes,
	34  prominent_antproc nonprominent_antproc,
	35  no yes,
	36  rectangular equant,
	37  four six,
	38  contiguous 'nc,_4' 'nc,_4+2' 'nc,_8_long',
	39  absent single_osteoderms bipartite_osteoderms,
	40  antwarp no_antwarp,
	41  yes no,
	42  no single double,
	43  yes no,
	44  no yes,
	45  surangular 's-a_suture' angular,
	46  posterior_half surrounds obliterates,
	47  s + a surangular,
	48  unequal subequal,
	49  marginal inset,
	50  posterior posterodorsal,
	51  end before_end,
	52  yes no,
	53  yes no,
	54  strong_slope horizontal,
	55  lapover no_lapover,
	56  no yes,
	57  yes no,
	58  no yes,
	59  yes no,
	60  yes no,
	61  yes no,
	62  absent present,
	63  'l=u' l > u,
	64  emf_small emf_large,
	69  present reduced,
	70  massive slender,
	71  palatines_anteriorly no_palatines,
	72  posteroventral anteroventral,
	73  no yes,
	74  extensive modest,
	75  quadratojugal jugal suture,
	76  absent present_to_qj descending_proc,
	77  yes no,
	78  all_lingual d8_in_line all_in_line,
	79  anterodorsal dorsal,
	80  yes no,
	81  deep_STF_entry modest_STF_entry no_STF_entry,
	82  small_exposure_on_table no_exposure_on_table large_exposure_on_table parietal_excluded,
	83  along_temporal_bar modest_extent,
	84  no yes,
	85  at_angle_of_PF far_from_angle_of_PF,
	86  concavoconvex straight,
	87  no yes stf_closes,
	88  no yes,
	89  #3 #5 #4 #4_and_#5 homodont,
	90  no yes,
	91  yes no,
	92  yes no,
	93  no yes_within_lac yes_btw_lac_and_prf,
	94  no yes,
	95  no yes,
	96  no yes,
	97  five four,
	98  no yes,
	99  [new] absence presence_pneumatic_cavity_in_prefrontal_pillar,
	100  no yes,
	101  no yes,
	103  no yes telescoped,
	104  no yes,
	105  straight bowed_medially,
	106  [new] surangular_continues_to_dorsal_tip_of_lateral_wall_of_glenoid_fossa truncated_and_not_continuing_dorsally,
	107  no yes,
	108  no yes,
	109  simple bipartite,
	110  yes no,
	111  no yes very_yes,
	112  yes no,
	113  modest prominent,
	114  low high,
	115  no yes,
	116  no yes,
	117  l > p p > l 'p=l',
	118  no yes,
	119  no yes,
	120  small large,
	121  medial dorsal,
	122  yes no,
	123  slopes_from_midline planar_from_midline,
	124  small very_large,
	125  no yes,
	126  no yes,
	127  yes no,
	128  lateral dorsal,
	129  no yes,
	130  laterally anteroposteriorly,
	131  no yes,
	132  yes no,
	133  yes no,
	134  yes no,
	135  no yes,
	136  no yes,
	137  no yes,
	138  yes no,
	139  smooth notched,
	140  shortbroad longparallel,
	142  no yes,
	143  not_prominent prominent,
	144  not_prominent prominent,
	146  yes no,
	147  dorsal lateral,
	148  imperf perf,
	149  all_the_way not,
	150  _no_proj._vent proj._vent,
	151  no_ventral_ext. ventral_ext.,
	152  choana_not_septate choana_with_shallow_septum choana_with_deep_septum,
	153  inc._for._far_from_toothrow near_toothrow between_toothrow,
	154  parietal_sinus no_parietal_sinus,
	155  follicle_glands no_follicle_glands,
	156  no_enlarged_VC single_row double_row,
	157  paired_caudal_keels single_caudal_keel 'Y-shaped_caudal_keel',
	158  small_lingual_pores large_lingual_pores,
	159  keratinized_tongue no_keratinized_tongue,
	160  single_head_of_caudfem double_head_of_caudfem,
	161  naris_circular_or_keyhole naris_wider_than_long,
	162  surangular_articular_suture-oriented_anteroposterior bowed_laterally_within_glenoid_fossa,
	163  postorbital_squamosal_suture_oriented_ventrally passes_medially_ventral_to_skulltable,
	164  antforamen_palatine_ramus_nerveVII_ventrolateral ventral_to_basisphenoid_rostrum,
;
[Most data from Brochu 8a matrix.  Characters 99 and 106 have been completely replaced. Dromaius outgroup from Brochu 7.1]

[For the source trees encoded in our crocodylian supermatrix dataset, there was only one case where the same characters were 
coded for two non-overlapping taxon sets.  Identical allozyme loci were scored for Alligatoroidea and for non-alligatoroid 
crocodylians (Gatesy et al. Fig. 2).  Densmore (1983) separately coded alleles in each of these two presumed groups.  Therefore, even 
though the same loci were examined for both "groups," the character codings were incompatible between matrices.  Analysis of 
our supermatrix dataset without the allozyme data supported these two monophyletic groups.  Thus, it was acceptable to 
concatenate the alligatoroid and non-alligatoroid allozyme datasets, end to end, in our supermatrix analysis (Gatesy et al. Fig. 3).  
This procedure yielded no duplications of character evidence.]

MATRIX
[morphology = 164; Paleognathae = Dromaeus novaehollandiae]
[                                        10        20        30        40        50        60       70         80        90        100       110       120       130       140       150       160 ]
[                                        .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .   ]
Paleognathae                    010100?101100???1?1??10100?00??010????0?0?111?00001?????01?1?1?0000?1??000????01?00?1120?0??000?????000?0?01?0001????00?100?00?101?0??????000000???0?101?1????10000?
Neognathae                      ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Testudines                      ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Caiman_yacare                   10001100011001011101110111111000011112211122011111011010011101000110111101021111230000112111101000010111101000010101001010100000012111011001100001001021201110110011
Caiman_latirostris              10001100011000011101110?11111000011112211122011111011010??1??1000110111101021011230001112111101000000111101000010101001010100000012111011001101001001021201210110011
Melanosuchus_niger              10001100011?01011101110111111000011112211122011111011010??1111000110111101021011230001112111101000000111101000010101001010101000012111011001101001001021201210110011
Paleosuchus_palpebrosus         1000111010010111110110011113121001111321122002111101111101???100011011110102101122000111211101111000011?001100010101001010100000012111011001100001001021101120110011
Paleosuchus_trigonatus          1000111000010111110110011113121001111321122002111101111101111100011011110102101122000111211101111000011?001100010101001010100000012111011001100001001021101120110011
Alligator_mississippiensis      10001100010101001101111011111000011121011120100111111100001111010000111101021010210001012111100000100110010000010110101010100000012111011001110001001002101100110011
Alligator_sinensis              10001110011101001101111011111000011121110120100111111?00??1111010000111101021010210000012111100000000110100000010110101010100000012111011001110001001002101110110011
Crocodylus_rhombifer            00100100111010001101010011111200011112011011101001011100100111000000011001100211201010011001101001001110010010030000000101100011110001011101100001111000110101010101
Crocodylus_acutus               00100100111010001101010011121200011102011011101001011100100111000000011001100211201010011001101001001110010010030000000101100011110001011101100001111000110101010101
Crocodylus_intermedius          00100100111010001101010011121200011112011011101001011100100111000000011001100211201010011001001001001110010010030000000101100011110001011101100001111000110101010101
Crocodylus_moreletii            00100100111010001101010011121200011112011011101001011100100111000000011001100211201010011001101001001110010010030000000101100011110001011101100001111000110101010101
Crocodylus_siamensis            11100100011110001101010010121200011112011011101001011100100111000000011001100211201010011001001001000110010010030000000101100011110001011101100101111000110101010101
Crocodylus_johnstoni            11100110110010001101010001121200011112011011101001011100100111000000011001100211201010011001001001000110010010030000010101100011110001011101100101111000110101010101
Crocodylus_mindorensis          11100110110010001101010001121200011112011011101001011100100111000000011001100211201010011001001001000110010010030000000101100011110001011101100101111000110101010101
Crocodylus_novaeguineae         11100110110010001101010001121200011112011011101001011100100111000000011000100210201010011001001001000110010010030000000101100011110001011101100101111000110101010101
Crocodylus_porosus              11100110110010001101010001121200011112011011101001011100100111000000011001100211201010011001001001000110010010030000000101100011110001011101100101111000110101010101
Crocodylus_palustris            10100101110010001101010011121211011112011011101001011100100111100000011001100211201010011001001001000110010010030000000101100011110001011101100101111000110101010101
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Crocodylus_cataphractus         100001000?001100?101010011121200011111011011101001011100100?01000000011001100211201010011001002001000110010010030000010101100011110001011101100001011000110101010101
Osteolaemus_tetraspis           ??1001100100100?1101010011111201011111111011101001011100100111000000011011100210201011111001010111000110100001030000001101100011110001011101100101001100110101010111
Tomistoma_schlegelii            02100100110010001101000011111100011013011040001001011000000001000002011000010210201011001001102001000110000001030000000101100111110001011101100011001000110101010101
Gavialis_gangeticus             0211010110000000011000000010010000?000000030000001111000010001000002001000010210100111004001103002000020000000001000010000000000000000?00011100010001010000000000000
Glen_Rose_Form                  ????????????0????1???00000?00??000000??0000????0???10???????10???0?0?0000??1000?00?010000000200?000000100?00000?0?000010?0?000???10?0?00?0000000010?000010??????0?0?
Bernissartia_fagesii            ??11?1210?010????00??0?0?0000??0001000100000????00100??????110???0?0000???0?00000??0?100301??0??00?0?000100?00?00??0?0??0??0?????????00???000000000?0?0?1???????00??
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Deinosuchus                     ?????????????????1????????????????00???1??0??01111?011?0?????1?00??001???022?0?00011?00????1???????0012000??0??1?10?0??01?1???0??001010110011?00?1???0??????????000?

[RAG-1 = 2002]
Struthio_camelus                TATCCATGGAAAATTCAGTAATGCCCTATGTGAAGTCTATTTCCCTAGGAACACCGCGATGGAGTGGCAACCCCACTCCCCAAACTGTGCTGTGTGCCGCACTGCCCGCCGGGGTGTCAAGAGAAAAAGCCAATCACCCAGTGTACAGCTTGGCAAACGAGTGAAGGCCACTGCAGGACGTGCTCGAATAAACAAAGGCCTAAAGAACCAAGCACAGATAAAGAACAAAAACTTAATGAAAGAGATTGCCAATTGCCAGAAGATACATCTCAGCACCAAACTCCTTGCAGTTGATTACCCAGTAGATTTCATTAAATCCATCTCTTGCCAGATTTGTGAGCACATTTTGGCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGACACTTGTTTTGCAGAACTTGCATTCTTAAATGTATCAAAGTTATGGGCAGCTATTGCCCCTCCTGCTGGTATCCTTGCTTTCCTACTGATCTGGTAAGCCCAGTGAAATCCTTCCTGAACATCCTTGATAGCCTGGGAATAAGATGCTCTGTAAAGGAATGTGATGAAGAGATTTTGCTAGGTAAATACAGCCAACACCTCTCCAGCCACAAGGAGATGAAAGAGCGAGAGCTTTACGCTCACATAAATAAAGGCGGCCGACCCAGGCAGCATCTCCTGTCTTTGACCAGGAGAGCTCAGAAACATCGTCTGAGAGAACTGAAATGTCAAGTCAAGGCTTTTGCTGAGAAAGAAGAGGGAGGAGATATAAAGGCTGTATGCATGACTTTGTTCCTCCTAGCTTTAAGAGCGAAAAATGAACACAGACAAGCAGATGAACTGGAGGCTATCATGCAAGGAAGAGGATCTGGACTTCACCCTGCTGTCTGCCTGGCAATCCGAGTCAATACATTTCTTAGCTGTAGCCAATATCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACTGGGAGGCAGATATTCCAGCCATTGCATGCTCTTCGCGCTGCTGAGAAAGCCCTCCTACCCGGTTATCACCCGTTCGAGTGGAGACCTCCCTTGAAAAACGTATCCACTAACACAGAAGTGGGTATTATAGACGGATTATCAGGGCTGCCACTCTCAATTGATGACTACCCAGTGGACACAATTGCAAAGAGATTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTGCCTTAATGGACATGGAGGAAGACATCTTGGAAGGTATGAAAGCAAAAAATCTGGATGACTATTTGAATGGTCCCTTCACTGTGGTGGTAAAAGAGTCCTGTGATGGAATGGGAGATGTCAGCGAGAAGCACGGAAGTGGGCCAGCTGTCCCAGAGAAGGCTGTGCGCTTTTCTTTCACAGTCATGAACGTTGCTATAGTCCATGGGAATGAAAACATAAGGATCTTTGAGGAGGCAAAGCCCAATTCAGAGTTGTGTTGCAAGCCCTTGTGCCTAATGCTGGCTGATGAATCAGATCATGAAACTCTGACGGCAATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCTATGAAAAACAGTGAACTGCTGCTTGAAATGGGAGGTATCCTGAGAACATTCAAATTCATCTTCAGGGGTACAGGATATGATGAGAAACTTGTCCGGGAAGTGGAAGGGCTGGAGGCCTCTGGTTCCACTTACATCTGTACTCTCTGTGATGCCACACGCCTGGAAGCATCCCAGAATTTGGTTTTCCATTCCATAACAAGGAGCCATGCTGAAAATTTGGAGAGGTATGAAGTATGGAGGTCCAACCCGTACCATGAGTCTGTTGATGAGCTCCGTGACAGAGTGAAGGGTGTTTCAGCCAAACCTTTTATTGAGACGGTTCCTTCCATAGATGCGTTGCATTGCGACATTGGCAATGCAACTGAATTCTACAGGATTTTCCAGCTGGAGATAGGTGAAGTTTATAAGAATCCCGATGTGTCTAAAGAGGAGAGGAAGAGATGGCAATTGACTCTTGACAAACACCTCAGGAAGAAGATGAACTTAAAGCCTATG   [2002]
Gallus_gallus                   TATCCACAGGAAATTCAGTAATACTCCATGTGAAGTTTATTTTCCTAGGAACAGCACGATGGAGTGGCAGCCCCACTCTGCAAACTGTGAAGTGTGCCACACGCCCAGCCGGGGAGTCAAGAGAAAGAGCCAACCACCCAACGTACAACATGGCAAACGTGTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAGTTAACAGAGGCATAAAGAACCAAGT---GATAAAGAACAAAAATGTAATGAAAGAGATTACAAACTGCAAGAACAGACATCTCAGCACCAAACTGCTTGCAGTTGATTATCCAGCAGATTTCATTAAATCCATCTCTTGCCAGATCTGTGAGCATATTTTGGCAGACCCAGTGGAAACAACGTGTAGACACTTGTTTTGCAGAACTTGCATTCTCAGTTGCATCAAAGTTATGGGATGCTATTGCCCTTCCTGCTGGTATCCTTGCTTCCCTACTGATCTGGTAACCCCAGTGAAATCCTTCCTGAACATCCTTGATAGCCTGAGCATAAGATGCCCTGTTCCAGAATGTGATGAAGAGATCTTGCACGGAAAATATGGCCAACACTTCTCTAACCACAAGGAGATGAAAGATAAAGAGCTCTATAACCCCATAAATAAAGGTGGCCGACCAAGGCAGCATCTTCTGTCTTTGACCAGGAGAGCTCAGAAACATCGTCTGAGAGAACTGAAACGTCAAGTCAAGGCTTTTGCTGAGAAAGAAGAGGGTGGTGATATAAAGGCTGTATGCATGACTTTGTTCCTGCTAGCTTTAAGAGCAAAAAACGAACACAAGCAAGCAGATGAATTGGAGGCTATAATGCAAGGCAGAGGATCTGGACTTCATCCCGCTGTTTGCCTGGCAATACGAATCAACACTTTTCTCAGCTGTAGCCAGTATCACAAAATGTACCGAACTGTAAAAGCTGTCACTGGGAGGCAGATTTTCCAGCCACTGCATGCTCTTCGCACCGCCGAGAAAGCCCTCTTACCAGGTTATCATCCTTTTGAATGGAAACCTCCCTTGAAAAATGTATCCACTAACACAGAAGTGGGAATTATAGATGGACTATCAGGACTACCCCTCTCGATTGATGACTACCCAATAGACACAATTGCAAAGAGATTTCGATATGATACAGCCTTGGTTTCTGCTTTAAAGGACATGGAGGAAGAAATCTTGGAGGGCATGAAGGCAAAAAACCTGGATGACTATCTGAATGGTCCCTTCACTGTGGTAGTAAAAGAGTGCTGTGACGGAATGGGAGATGTCAGCGAGAAGCATGGAAGTGGTCCTGCTGTCCCAGAGAAGGCTGTACGCTTTTCATTTACAGTCATGAACATTGCTATAGACCACGAGAACGAAAGGATAAGGATCTTTGAAGAAGTAAAGCCCAATTCAGAGTTGTGTTGCAAACCCTTGTGTCTTATGCTGGCTGATGAATCAGACCATGAAACTCTGACAGCAATCCTCAGCCCTCTCATAGCAGAGAGAGAGGCTATGAAGAACAGTGAACTGCTTCTTGAAATAGGAGGCATCCTGAGAACATTCAAATTCATCTTTCGAGGTACAGGCTATGATGAGAAACTTGTAAGGGAAGTGGAAGGGCTGGAGGCCTCAGGTTCCACTTATATCTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTAGAGGCCTCCCAGAATTTGGTCTTCCACTCCATCACCAGGAGCCACACTGAAAATCTGGAGCGATATGAAATATGGAGGTCCAACCCATATCACGAATCTGTTGATGAGCTCCGTGACAGAGTGAAGGGTGTTTCGGCCAAACCTTTTATAGAGACTGTTCCCTCCATAGACGCGTTGCACTGTGACATTGGCAACGCAACAGAATTTTACAGGATTTTCCAGATGGAGATTGGTGAAGTCTATAAGAATCCTGATGCGACTAAAGAGGAGAGGAAGAGGTGGCAGTTGACTCTTGACAAACATCTCAGGAAGAAGATGAAATTAAAACCTATG   [1999]
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M_niger                         CATTCAGAGAAAGTTTAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCAAGGAACAGTGCCATGGAATGGCAACCTCATTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCACACCAGCTGTCAGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCTGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGTAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAACTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTTGTTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGAGCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTATACCCTTGCTTCCCTACTGACTTAGTGACCCCAGTGAAATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTTTGAGATGTCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGCTGAAAGGGAAAGAGATTTATACACACATAAATAAAGGGGGACGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGCCTGAGAGAACTCAAGCTTCAGGTCAAAACGTTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTGGCTCTCAGAGCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGCTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTTAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACCGGGAGGCAGATCTTCCAGCCACTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGTTATCATCCATTTGAGTGGAAGCCTTCTTTGAAAAATGTGTCTGCTAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACATTCAGTTGATGACTACCCAATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTGCCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAACACATGATCTGGATGACTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAAGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACCGTCATGACCATCACTATAACTCATGGCAATACAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGTCAAGCCCAATTCAGAGCTATGTTGCAAGCCATTGTGTCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAAAACAGTGTACTACTTCTTGAAATGGGAGGCATCCTCAGAACATTCAAATTCATCTTTAGGGGTACTGGTTATGATGAGAAACTTGTGCGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCCTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTGGAAGCCTCTCAGAATTTGGTCCTCCACTCCATAACAAGGAGTCATACTGAAAATCTAGAGCGATATGAGGTGTGGAGGTCCAACCCATACCATGAATCAGTTGATGAGCTCCGTGATAGAGTGAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCATTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAATTTGAGATAGGTGAGGTCTACAAGAATCCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCACCTGAGGAAGAAGATGAACCTGAAACCAATA   [2002]
P_palpebrosus                   CATTCAGAGAAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCAAGGAACAGTGCCATGGAATGGCAACCTCATTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCACACCAGCTGTCAGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCCGCCCAATTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGTAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAACTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTTGTTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGAGCATATTCTGTCCGATCCAGTGGAAACAACATGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTATACCCTTGCTTCCCTACTGACTTAGTGACCCCAGTGAAATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTTTGAGATGTCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATTTTGCTGGGAAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGCTGAAAGGGAAAGAGATTTATACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAGGTCAAAACGTTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTGGCTCTCAGATCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGCTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTCAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACCGGGAGGCAGATCTTCCAGCCACTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGCTATCATCCATTTGAGTGGAAGCCTCTTTTGAAAAATGTGTCTGCTAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACATTCAGTTGATGACTATCCAATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTGCCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAACACATGACCTGGATGACTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAAGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACTGTCATGACCGTCACTATAACTCATGGCAATACAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGTCAAGCCCAATTCAGAGTTATGTTGCAAGCCATTGTGTCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAAAACAGTGTACTACTTCTTGAAATGGGAGGCATCCTCAGAACATTCAAATTCATCTTTAGGGGTACTGGTTATGATGAGAAACTTGTGCGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCCTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTGGAAGCCTCTCAGAATTTGGTCCTCCACTCCATAACAAGGAGTCACACTGAAAATCTAGAGCGATATGAGGTGTGGAGGTCCAACCCATACCATGAATCAGTTGATGAGCTCCGTGATAGAGTTAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCATTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAATTTGAGATAGGTGAGGTCTACAAGAACTCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCACCTGAGGAAGAAGATGAACCTGAAACCAATA   [2002]
P_trigonatus                    CATTCAGAGAAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCAAGGAACAGTGCCATGGAATGGCAACCTCATTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCACACCAGCTGTCAGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCCGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGTAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAACTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTTGTTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGAGCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACATGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTATACCCTTGCTTCCCTACTGACTTAGTGACCCCAGTGAAATCCTTCYTAAACATCCTTGACTCTCTGACTTTGAGATGTCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAKCATCTCTCCAGGCACAAGGAGCTGAAAGGGAAAGAGATTTATACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAGGTCAAAACGTTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTGGCTCTCAGAGCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGCTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTCAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACCGGGAGGCAGATCTTCCAGCCACTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGCTATCATCCATTTGAGTGGAAGCCTCTTTTGAAAAATGTGTCTGCTAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACATTCAGTTGATGACTATCCAATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTGCCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAACACATGACCTGGATGACTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAAGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACTGTCATGACCGTCACTATAACTCATGGCAATACAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGTCAAGCCCAATTCAGAGCTATGTTGCAAGCCATTGTGTCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAAAACAGTGTACTACTTCTTGAAATGGGAGGCATCCTCAGAACATTCAAATTCATCTTTAGGGGTACTGGTTATGATGAGAAACTTGTGCGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCCTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTGGAAGCCTCTCAGAATTTGGTCCTCCACTCTATAACAAGGAGTCACACTGAAAATCTAGAGCGATATGAGGTGTGGAGGTCCAACCCATACCATGAATCAGTTGATGAGCTCCGTGATAGAGTTAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCATTGCATTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAATTTGAGATAGGTGAGGTCTACAAGAACCCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCACCTGAGGAAGAAGATGAACCTGAAACCAATA   [2002]
A_mississippiensis              CATTCAGAGAAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCGAGGAACAGTGCCATGGAATGGCAACCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCACACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCCGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGTAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAACTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTTGTTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGAGCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGTAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTATACCCTTGCTTCCCTACTGACTTAGTGACCCCAGTGAAATCCTTCCTAAACATTCTTGACTCTCTGACTTTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCCCCAGCCACAAGGAGCTGAAAGGGAAAGAGATTTATACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAGGTCAAAACGTTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTGGCTCTCAGAGCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGCTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTCAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACCGGGAGGCAGATCTTCCAGCCATTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGTTATCATTCATTTGAGTGGAAGCCTCCTTTGAAAAATGTGTCTGCTAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACACACAGTTGATGACTACCCAATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTGCCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAGCACATGACCTGGATGACTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAAGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACTGTCATGACCATCGCTATAACTCATGGCAATACAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGTCAAGCCCAATTCAGAGCTATGTTGCAAGCCATTGTGTCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGACCATGAAAAACAGTGTACTACTTCTTGAAATGGGAGGCATCCTCAGAACATTCAAATTCATCTTTAGGGGTACAGGGTATGATGAGAAACTTGTACGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCCTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTGGAAGCCTCTCAGAATTTGGTCCTCCACTCCATAACAAGGAGTCACACTGAAAATCTAGAGCGATATGAGGTGTGGAGGTCCAACCCATACCATGAATCAGTTGATGAGCTCCGTGATAGAGTGAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCGTTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAATTTGAGATAGGTGAGGTCTACAAGAACCCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCACCTGAGGAAGAAGATGAACCTGAAACCAATA   [2002]
A_sinensis                      CATTCAGAGAAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCGAGGAACAGTGCCATGGAATGGCAACCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCACACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCCGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGTAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAACTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTTGTTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGAGCATATTTTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTATACCCTTGCTTCCCTACTGACTTAGTGACCCCAGTGAAATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTTTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGAAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGCTGAAAGGGAAAGAGATTTATACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTTTGAGAGAACTCAAGCTTCAGGTCAAAACGTTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTGGCTCTCAGAGCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGCTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTCAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACCGGGAGGCAGATCTTCCAGCCATTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGTTATCATCCATTTGAGTGGAAGCCTCCTTTGAAAAATGTGTCTGCTAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACACACAGTTGATGACTACCCAATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTGCCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAGCACATGACCTGGATGACTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAAGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACCGTCATGACCATCACTATAACTCACGGCAATACAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGTCAAGCCCAATTCAGAGCTATGTTGCAAGCCATTGTGTCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAAAACAGTGTACTACTTCTTGAAATGGAAGGCATCCTCAGAACATTCAAATTCATCTTTAGGGGTACAGGGTATGATGAGAAACTTGTGCGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCCTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTGGAAGCCTCTCAGAATTTGGTCCTCCACTCCATAACAAGGAGTCACACTGAAAATCTAGAGCGATATGAGGTGTGGAGGTCCAACCCATACCATGAATCAGTTGATGAGCTCCGTGACAGAGTGAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCGTTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAATTTGAGATAGGTGAGGTCTACAAGAACCCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCACCTGAGGAAGAAGATGAACCTGAAACCAATA   [2002]
C_rhombifer                     CATTCAGAGAAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCGAGGAACAGCACCATGGAATGGCAACCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCTCACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCTGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGGAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAATTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTCATTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGATCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTGTACCCTTGCTTCCCTACTGACCTAGTGACCCCAGTGAGATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTCTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGATGGAAGGGAAAGAGATTTACACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAAGTCAAAACATTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTGGCTCTCAGAGCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGCTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTCAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACTGGGAGGCAGATCTTCCAGCCATTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGTTATCATCCATTTGAGTGGAAGCCTCCTTTGAAAAATGTGTCTGCCAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACACTCAGTTGATGACTACCCTATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTACCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAGCACATGACCTGGATGACTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAGGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACCGTCATGACCATCACTATCACTCATGGCAATGCAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGTCAAGCCCAATTCAGAGCTATGCTGCAAGCCATTGTGTCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAAAACAGTGTACTACTTCTTGAAATGGGAGGCATCCTCAGAACATTCAAATTCATCTTTAGGGGTACGGGGTATGATGAGAAACTTGTGCGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCCTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTGGAAGCCTCTCAGAATTTGGTCTTCCACTCCATAACAAGGAGTCACGCTGAAAATCTAGAGCGATACGAGGTATGGAGGTCCAACCCATACCATGAGTCCGTTGATGAGCTCCGTGATAGAGTGAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCATTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAGTTTGAGATAGGTGAAGTCTACAAGAACCCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCATCTGAGGAAGAAGATGANNNNNNNNNNNNNN   [2002]
Crocodylus_acutus               ?????????AAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCGAGGAACAGCACCATGGAATGGCAACCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCTCACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCTGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGGAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAATTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTCATTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGATCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTGTACCCTTGCTTCCCTACTGACCTAGTGACCCCAGTGAGATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTCTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGATGGAAGGGAAAGAGATTTACACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAAGTCAAAACATTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGAC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
C_intermedius                   CATTCAGAGAAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCGAGGAACAGCACCATGGAATGGCAACCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCTCACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCTGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGGAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAATTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTCATTAAAGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGATCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTGTACCCTTGCTTCCCTACTGACCTAGTGACCCCAGTGAGATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTCTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGATGGAAGGGAAAGAGATTTACACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAAGTCAAAACATTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTGGCTCTCAGAGCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGCTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTCAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACTGGGAGGCAGATCTTCCAGCCATTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGTTATCATCCATTTGAGTGGAAGCCTCCTTTGAAAAATGTGTCTGCCAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACACTCAGTTGATGACTACCCTATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTACCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAGCACATGACCTGGATGACTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAGGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACCGTCATGACCATCACTATCACTCATGGCAATGCAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGTCAAGCCCAATTCAGAGCTATGCTGCAAGCCATTGTGTCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAAAACAGTGTACTACTTCTTGAAATGGGAGGCATCCTCAGAACATTCAAATTCATCTTTAGGGGTACGGGGTATGATGAGAAACTTGTGCGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCCTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTGGAAGCCTCTCAGAATTTGGTCTTCCACTCCATAACAAGGAGTCACACTGAAAATCTAGAGCGATACGAGGTATGGAGGTCCAACCCATACCATGAGTCCGTTGATGAGCTCCGTGATAGAGTGAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCATTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAGTTTGAGATAGGTGAAGTCTACAAGAACCCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCATMTGAGGAAGAAGATGAACCTGAAACCGATA   [2002]
Crocodylus_moreletii            ?????????AAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCGAGGAACAGCACCATGGAATGGCAACCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCTCACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCTGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGGAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAATTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTCATTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGATCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTGTACCCTTGCTTCCCTACTGACCTAGTGACCCCAGTGAGATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTCTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGATGGAAGGGAAAGAGATTTACACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAAGTCAAAACATTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGAC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_siamensis            ?????????AAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCGAGGAACAGCACCATGGAATGGCAACCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCTCACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCTGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGGAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAATTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAAATTTCATTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGAGCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTGTACCCTTGCTTCCCTACTGACCTAGTGACCCCAGTGAGATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTCTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGATGGAAGGGAAAGAGATTTACACGCACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAAGTCAAAACATTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGAC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_johnstoni            ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_mindorensis          ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_novaeguineae         ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_porosus              ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_palustris            ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_niloticus            ?????????AAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCGAGGAACAGCACCATGGAATGGCAACCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCTCACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCTGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGGAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAATTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTCATTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGATCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTGTACCCTTGCTTCCCTACTGACCTAGTGACCCCAGTGAGATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTCTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGATGGAAGGGAAAGAGATTTACACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACATCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAAGTCAAAACATTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGAC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
C_cataphractus                  CATTCAGAGAAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCGAGGAACAGCACCATGGAATGGCAACCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCTCACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCTGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGGAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAATTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTCATTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGAGCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTGTACCCTTGCTTCCCTACTGACCTAGTGACCCCAGTGAGATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTCTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGACGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGATGGAAGGGAAAGAGATTTACACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAAGTCAAAACATTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTGGCTCTCAGAGCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGCTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTCAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACTGGGAGGCAGATCTTCCAGCCATTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGTTATCATCCATTTGAGTGGAAGCCTCCTTTGAAAAATATGTCTGCCAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACACTCAGTTGATGACTACCCTATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTGCCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAGCACATGACCTGGATGACTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAGGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACCGTCATGACCATCACTATCACTCATGGCAATGCAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGTCAAGCCCAATTCAGAGCTATGCTGCAAGCCATTGTGTCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAAAACAGTGTACTACTTCTTGAAATGGGAGGCATCCTCAGAGCATTCAAATTCATCTTTAGGGGTACGGGGTATGATGAGAAACTTGTGCGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCCTCTGGCTCCACTTACATTTGTACGCTCTGTGATGCAACCCGCCTGGAAGCCTCTCAGAATTTGGTCTTCCACTCCATAACAAGGAGTCACGCTGAAAATCTAGAGCGATATGAGGTATGGAGGTCCAACCCATACCATGAGTCCGTTGATGAGCTCCGTGATAGAGTGAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCATTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAGTTTGAGATAGGTGAAGTCTACAAAAACCCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCACCTGAGGAAGAAGATGAACCTGAAACCGATA   [2002]
O_tetraspis                     CATTCAGAGAAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAAGTGTATTTCCCGAGGAACAGCACCATGGAATGGCAACCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCTCACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCTGCCTAACTTACAGCTTGCAAAACGACTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGGAAAGAACCAAGGAAAGCTAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAATTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTCATTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGAGCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCCTGTACCCTTGCTTCCCTACTGATCTAGTGACCCCAGTGAGATCCTTCCTAAACATCCTTGACTCTCTGACTCTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGACAAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGATGGAAGGGAAAGAGATTTACACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAAGTCAAAACATTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTGGCTCTCAGAGCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGCTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTCAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACTGGGAGGCAGATCTTCCAGCCATTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGTTATCATCCATTTGAGTGGAAGCCTCCTTTGAAAAATGTGTCTGCCAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACACTCAGTTGATGACTACCCTATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTACCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAGCACATGACCTGGATGACTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAGGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACCGTCATGACCATCACTATCACTCATGGCAATGCAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGTCAAGCCCAATTCAGAGCTATGCTGCAAGCCACTGTGTCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAAAACAGTGTACTACTTCTTGAAATGGGAGGCATCCTCAGAACATTCAAATTCATCTTTAGRGGTACGGGGTATGATGAGAAACTTGTGCGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCCTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTGGAAGCCTCTCAGAATTTGGTCTTCCACTCCATAACAAGGAGTCAYGCTGAAAATCTAGAGCGATATGAGGTATGGAGGTCCAACCCATACCATGAGTCCGTTGATGAGCTCCGTGATAGAGTGAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCATTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAGTTTGAGATAGGTGAAGTCTACAAGAACCCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCACCTGAGGAAGAAGATGAACCTGAAACCGATA   [2002]
T_schlegelii                    CATTCAGAGAAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAGGTTTATTTCCCGAGGAACAGCACCATGGAATGGCAGCCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCACACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCCGCCCAACTTACAGCTTGCAAAACGATTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGGAAAGAACCAAGGAAAGATAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAACTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTCATTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGAGCATATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCRGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCTTGTACCCTTGCTTCCCTACTGACCTAGTGACCCCAGTGAGATCCTTCCTAAACATCCTTGATGCTCTGACTCTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCAATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAGTATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGATGGAAGGGAAAGACATTTACACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACATCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAACTTCAAGTCAAAACATTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTGGCTCTCAGAGCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGSTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTCAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACTGGGAGGCAGATCTTCCAGCCATTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGTTATCATCCATTTGAGTGGAAGCCTCCTTTGAAAAATGTGTCTACCAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACACTCAGTTGATGACTACCCAATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTGCCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAGCACATGACCTGGATGATTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAGGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACCGTCATGACGATCACTATAACTCATGGCAATGCAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGCCAAGCCCAATTCAGAGCTATGTTGCAAGCCATTGTGTCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAAAGCAGTGTACTACTTCTTGAAATGGGAGGCATCCTCAGAACATTCAAATTCATCTTTAGGGGTACGGGGTATGATGAGAAACTTGTGCGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCTTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTAGAAGCCTCCCAGAATTTGGTCCTCCACTCCATAACAAGGAGTCACGCTGAAAATCTAGAGCGATACGAGGTGTGGAGGTCCAACCCATACCATGAGTCCGTTGATGAGCTCCGTGACAGAGTGAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCATTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAGTTTGAGATAGGTGAAGTCTACAAGAACCCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCACCTGAGGAAGAAGATGAACCTGAAACCAATA   [2002]
G_gangeticus                    CATTCAGAGAAAGTTCAGCAGTTCCCCATATGAGGTTTATTTCCCGAGGAACAGCACCATGGAATGGCAGCCTCACTCCCCAAATTGTGATGTTTGTCACACTAGCTGTCGGGGGATCAAGAGAAAGAAGCAGCCGCCGAACTTACAGCTTGCAAAACGATTGAAGATCATTGCAGAACGTGCTCGAAAAAACAGGTGTGGAAAGAACCAAGGAAAGATAAACAACAAGAACCTCATGAAAAAGATTACCAACTGCAAGAAGATACATCTTAGCACAAAGCTTCTTGCAGTTGACTATCCAGTAGATTTCATTAAGGCTATCTCTTGTCAGATCTGTGAGCACATTCTGTCAGATCCAGTGGAAACAACGTGTAGGCACTTATTCTGCAGAACCTGCATCCTTAAATGTCTCAAAGTTATGGGCAGTTATTGCCCCTCCTGCTTGTACCCTTGCTTCCCTACTGACCTAGTGACCCCAGTGAGATCCTTCCTAAACATCCTTGATGCTCTGACTCTGAGATGCCCAGTGAAAGAATGCGATGAAGAGATCTTGCTGGGGAAATATGGTCAGCATCTCTCCAGCCACAAGGAGATGGAAGGGAAAGACGTTTACACACACATAAATAAAGGGGGGCGACCAAGACAACACCTTCTGTCCTTGACCAGAAGAGCTCAAAAACATCGTCTGAGAGAACTCAAGCTTCAAGTCAAAACATTTGCTGAGAAAGAAGAAGGGGGAGATATAAAGGCTGTTTGCATGACTTTGTTTTTGTTAGCTCTCAGAGCAAAAAATGAACACCGGCAAGCAGATGAGCTGGAAGCTATAATGCAAGGGAGGGGCTCAGGGCTTCACCCAGCTGTTTGTTTGGCAATTCGAGTCAATACATTTCTCAGCTGTAGTCAGTACCATAAAATGTACAGAACTGTAAAAGCTGTCACTGGGAGGCAGATCTTCCAGCCATTGCATGCTCTTCGCACTGCTGAGAAAGCCCTGCTCCCAGGTTATCATCCATTTGAGTGGAAGCCTCCTTTGAAAAATGTGTCTGCCAATACAGAAGTGGGAATTATAGATGGGCTTTCAGGCCTGCCACACTCAGTTGATGACTACCCAATTGACACAATTGCAAAGAGGTTTCGATATGATGCAGCCTTGGTTTCTGCCTTAATGGATATGGAAGAAGACATCTTGGAAGGCATGAAAGCACATGACCTGGATGACTATTTGAATGGTCCTTTCACTGTGGTGGTGAAGGAGTCTTGTGATGGGATGGGAGATGTCAGTGAGAAGCATGGATGTGGACCAGCAGTCCCAGAAAAGGCAGTTCGCTTTTCTTTCACCGTCATGACCATCACTATAACTCATGGCAATGCAAATGTAAGGATCTTTGAAGAAGTCAAGCCCAATTCAGAGCTATGTTGCAAGCCATTGTGTCTTATGTTAGCTGATGAGTCAGACCATGAGACTCTGACAGCCATCCTGAGCCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAAAGCAGCGTACTACTTCTTGAAATGGGAGGCATCCTCAGAACATTCAAATTCATCTTTAGGGGTACGGGGTATGATGAGAAACTTGTGCGTGAGGTGGAAGGCCTTGAAGCTTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTCTGTGATGCAACCCGCCTAGAAGCCTCTCAGAATTTGGTCCTCCACTCCATAACAAGGAGTCACGCTGAAAATCTAGAGCGATATGAGGTGTGGAGGTCCAACCCATACCATGAGTCCGTTGATGAGCTCCGTGATAGAGTGAAGGGTGTTTCTGCAAAACCATTTATTGAGACTGTTCCCTCTATAGATGCATTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAGTTTGAGATAGGTGAAGTCTACAAGAACCCTGATGCATCTAAAGAAGAGAGGAAGAGGTGGCAATCAGCTCTTGACAAGCACCTGAGGAAGAAGATGAACCTGAAACCAATA   [2002]
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extinct_taxon                   ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????

[cytb = 240]
Struthio_camelus                CAAATTCTAACAGGGCTCCTACTAGCCATACATTACACAGCCGACACTACACTAGCATTCTCATCCGTCGCCCACACATGCCGGAACGTACAGTACGGATGATTTATCCGCAATCTCCATGCAAACGGCGCATCCCTCTTCTTCATCTGTATTTACCTACACATCGGCCGAGGACTCTACTATGGCTCTTACCTCTATAAAGAAACCTGAAACACCGGCGTTATCCTCCTACTAACATTA   [240]
Gallus_gallus                   CAAATCCTCACCGGCCTACTACTAGCCATGCACTACACAGCAGACACATCCCTAGCCTTCTCCTCCGTAGCCCACACTTGCCGGAACGTACAATACGGCTGACTCATCCGGAATCTCCACGCAAACGGCGCCTCATTCTTCTTCATCTGTATCTTCCTTCACATCGGACGAGGCCTATACTACGGCTCCTACCTCTACAAGGAAACCTGAAACACAGGAGTAATCCTCCTCCTCACACTC   [240]
Geochelone_yniphora             CAAGTCATTACTGGAATCTTTCTAGCAATACACTACTCACCAGACATCTCACTAGCATTCTCATCAGTGGCCCACATCACTCGAGATGTACAGTATGGATGACTTATCCGAAACTTACACGCCAACGGAGCCTCTATATTCTTTATATGTATCTACCTCCACATCGGCCGAGGACTTTACTACGGTTCTTATCTCTACAAAGAAACCTGAAACACAGGAATTATCCTACTACTCCTAGTC   [240]
C_crocodilus                    CAAATCCTCACAGGAGTATTCCTAATAATACATTTCTCACCCAGCGATACCACAGCTTTCTCATCCGTCGCCTACACCTCCCGCGAGGTCTGATTTGGATGACTCATCCGAAGCTTCCACACAAACGGAGCCTCCATCTTCTTCATATTTATCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTATATTACGCCTCCTACTTGCACGAAAACACATGAAACGTTGGAGTAATCATACTATTCCTACTA   [240]
C_latirostris                   CAAATCCTCACAGGAATCTTCCTAATAATACACTTCTCATCCAGCGACACCACAGCCTTCTCATCCGTCGCCTACACTTCTCGCGAAGTTTGATTCGGATGGCTTATCCGAAGTCTCCACACAAACGGAGCCTCCCTCTTCTTTATGTTCATCTTCCTACACATCGGACGAGGCCTGTATTACGCCTCCTACCTACACGAAAACACATGAAACATCGGAGTAGTTATACTACTCCTACTA   [240]
M_niger                         CAAATCCTCACAGGAGTATTCCTAATAATACACTTCTCATCCAGCGACACCACGGCCTTCTCATCCGTCGCCTACACCTCCCGCGAAATCTGATTTGGATGACTCATTCGAAACCTACACACAAACGGAGCCTCCTTATTCTTCATATTTATCTTCCTACACATTGGACGAGGCCTATACTACGCCTCCTACCTGCACGAAAACACATGAAACATTGGAGTGATCATACTCTTCCTACTA   [240]
P_palpebrosus                   CAAATTCTAACAGGAGTCTTCCTAATAATACACTTCTCATCAAGTGACACCACGGCCTTCTCATCCGTCGCCTACACCTCCCGCGAAGTCTGATTCGGATGACTTATCCGAAACCTCCACACAAACGGAGCCTCACTCTTCTTCATGTTTATTTTCCTCCACATCGGACGGGGCCTGTACTACGCCTCCTACACCCACGAAAAGACATGAGCTGTAGGAGTTATTATACTCTTCCTACTA   [240]
P_trigonatus                    CAAATCCTAACGGGGGTCTTCCTAATAATACACTTCTCATCAAGCGACACTGCGGCTTTCCCGTCCGTCGCCTACACCTCCCGCGAAGTCTGATTCGGATGACTTATCCGAAGCCTCCACACAAACGGGGCCTCCCTCTTCTTCATATTTATTTTCCTCCACATCGGACGAGGCCTATACTACGCCTCTTACGCCCACGAAAACACATGAAATGTAGGAGTCATAATGCTCTTCTTACTA   [240]
A_mississippiensis              CAGATTCTAACAGGATTCTTCTTAATAATGCACTTTTCATCAAGCGATACTCTAGCATTTTCATCTGTATCCTACACCTCCCGCGAAGTCTGATTTGGATGACTCATCCGCAACCTCCACACAAATGGGGCCTCCCTGTTCTTTATATTTATCTTTCTTCACATCGGACGAGGCCTATACTACACATCATATCTTCACGAAAGCACATGAAATATTGGAGTAATCATACTTCTACTCCTA   [240]
A_sinensis                      CAGATCCTAACAGGAGTCTTCTTAATAATGCACTTCTCATCGGGTGACACCATAGCATTTTCATCTGTCGCCTACACCTCCCGTGAAGTTTGGTTCGGGTGGCTTATTCGCGGCCTCCACATAAACGGGGCCTCTCTCTTCTTCATATTCATCTTCCTCCACATCGGACGAGGCCTATACTACGCATCCTACCTTCACGAGAGCACGTGAAATGTCGGAGTAATTATACTCCTACTCCTG   [240]
C_rhombifer                     CAACTAGCATCGGGCATCCTACTAATAATGCACTTCCTAGCTGATGACTCTCTGGCTTTTATATCTGTCGCTTATACTTCACGAGAAGTTTGATATGGCTGATTAATCCGAAGTCTCCATGCAAACGGAGCCTCCCTATTCTTCCTATGTATTTTCCTACACATTGGGCGCGGAGTATACTATGGATCATATCTCAATGAAAACACATGAAACATCGGAGTACTGCTACTGTTACTACTG   [240]
C_acutus                        NNNNNNNNNNNNNNNNTCCTACTAATAATGCACTTCCTGGCAGATGACTCTCTAGCTTTTATATCTGTAGCTTACACTTCACGAGAAGTTTGATATGGTTGACTAATCCGAAGCCTCCATGCAAACGGAGCCTCCCTATTCTTCCTATGTATTTTCCTACACATTGGACGCGGAGTATACTACGGATCATACCTCAACGAAAATACATGAAACATCGGAGTACTGCTACTATTACTACTG   [240]
C_intermedius                   CAACTAACATCGGGCATCCTACTAATAATGCACTTCCTGGCAGATGACTCTCTAGCTTTTATGTCTGTAGCTTACACTTCACGAGAAGTTTGATATGGTTGACTAATCCGAAGCCTCCATGCAAACGGAGCCTCCCTATTCTTCCTATGTATTTTCCTACACATTGGACGCGGAGTATACTACGGATCATACCTCAACGAAAACACATGAAACATCGGAGTACTGCTACTATTACTACTG   [240]
Crocodylus_moreletii            ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_siamensis_AF306453   CAATTAGCATCGGGCATTATACTAATAATGCACTTCCTAGCAGACGACTCAAAAGCTTTTATATCCGTCGCCTACACTTCACGAGAAGTCTGATATGGTTGACTAATCCGAAGCCTCCATGCAAACGGAGCTTCCCTATTCTTCCTATGCACCTTCCTCCACATCGGACGTGGAGTATACTACGGGTCTTACCTAAATGAAAATACATGAAACATCGGAGTATTATTGTTACTACTACTG
Crocodylus_johnstoni            ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_mindorensis          ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_novaeguineae         ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_porosus              ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_palustris            ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_niloticus            ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
C_cataphractus                  CAACTAACATCCGGAATCTTACTAATAATACACTTCCTAGCTGACGACACACTAGCTTTCACATCAATTGCCTACACCTCACGAGAAGTTTGATATGGCTGACTAATCCGCAGCCTTCACGCAAACGGAGCCTCTCTATTCTTCTTATGCATCTTCCTTCATATTGGACGAGGACTATACTACGGATCATACCTCAATGAAAACACATGAAATATCGGAGTACTGCTACTATTACTACTA   [240]
O_tetraspis                     CAACTGACATCAGGTATTCTACTAATAATACACTTCCTAGCCGATGATACCATAGCTTTTACATCAGTGGCCTACACTTCACGAGAAGTATGATATGGGTGACTAATTCGAAGCCTTCACGCAAACGGCGCCTCTCTATTCTTCCTGAGCATTTTCCTTCACATGGGCCGAGGACTATATTACGGATCATATCTACATGAAAACACATGAAATGTCGGGGTACTACTACTATTATTNNNN   [240]
T_schlegelii                    CAAATCCTATCAGGCATTCTACTAATAATACATTTCCTAGCACATGACACCATAGCCTTCGCATCCGTCGCTTACACATCACGAGAAGTCTGATACGGCTGACTTATCCGAAGCCTTCACGCAAACGGAGCTTCCCTATTCTTCTTTTGCATCTTCTTACACATTGGACGTGGCCTCTACTACGGCTCTTATCTGCACGAAAACACATGGAACATCGGAGTCATTTTACTCCTCCTACTA   [240]
G_gangeticus                    CAAATCCTATCAGGAGTTTTACTAATAATACACTTCCTAGCAGATGACACTATGGCCTTCGCATCTGTTGCTTACACCTCACGAGAAGTTTGATATGGTTGACTTATCCGAAGCCTCCACGCAAACGGAGCCTCCCTCTTCTTCCTATGCATCTTCTTACACATTGGACGTGGCTTATATTACGGCTCTTACCTACATGAAAATACATGAAACATTGGAGTCATCCTGCTCCTCTTATTA   [240]
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[c-myc = 1181]
Struthio_camelus              ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAGGAAGAA---CAAGAGGAAGAC---GAAGAAATTGATGTTGTTACACTAGCTGAAGCAAATGAATCCGAATCCAGCACAGAGTCCAGCACAGAA------------------ACA---TCA---GAAGGGCACAGTAAGCCCCACCACAGCCCGCTAGTTCTCAAACGGTGTCACGTCAACATCCATCAGCACAATTATGCTGCTCCTCCCTCCACCAAGGTTGAGTATCCAGCTGCAAAAAGGCTAAAGTTGGACAGTGGCAGAGTTCTCAAACAGATCAGTAATAACCGCAAATGCTCGAGTCCCCGCACATCAGACTCCGAAGAGAACGATAAGAGGCGAACGCACAATGTCCTGGAGCGCCAGAGGAGAAATGAGCTGAAGCTGAGTTTCTTCGCCTTGCGCGATCAGATACCGGAGGTGGCCAACAACGAAAAGGCACCCAAGGTTGTCATCCTGAAAAAAGCGACGGAATATGTTCTTTCTATCCAGTCAGATGAACACAGACTGATTGCAGAGAAAGAGCAGTTGAGGAGGAGGAGGGAACAGTTGAAACACAAACTTGAGCAGCTAAGGAACTCTTGTGCGTAGGAACTCTTGGGCATCATTTAGAATAACTCAAACTAGACTGAAACTATGATAAAA--TATTAATGTTTCTAATATCACTCATGAACTACACCCAGT-CCATAAAGGATGGAACTATTGCAACTGCATGCTGTGCGATTTAACTTGAGACTACACAACCTTGGCTAGATCTCCGAAGGGTTTAGCC?????????????
Ortalis_cinereiceps           ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAAGAAGAA---CAAGAGGAAGAT---GAGGAAATTGACGTCGTTACATTGGCTGAAGCAAACGAGTCCGAATCCAGCACAGACTCCAGCACAGAG------------------GCA---TCA---GAGGAGCACAGTAAGCCCCACCACAGCCCGCTGGTCCTCAAACGGTGTCACGTCAACATCCACCAGCACAATTATGCCGCTCCTCCCTCCACCAAGGTGGAATACCCAGCCGCCAAGAGGCTAAAGTTGGACAGTGGCAGGGTCCTCAAACAGATCAGCAACAACCGAAAATGCTCGAGTCCCCGCACGTCAGACTCAGAGGAGAACGACAAGAGGCGAACGCACAACGTCTTGGAGCGCCAGCGAAGGAATGAGCTGAAGTTGAGTTTCTTTGCCCTGCGCGACCAGATACCTGAGGTGGCCAACAACGAGAAGGCGCCCAAGGTTGTCATCCTGAAAAAAGCCACAGAGTACGTTCTGTCCATCCAGTCGGACGAGCACAGACTGATCGCAGAGAAAGAGCAGTTGAGGCGGAGGAGAGAACAGTTGAAACACAAACTTGAGCAGCTAAGGAACTCTCGTGCATAGGAACTCTTGGGCATCGCTTAGAATACCCCAAACTAGACTGAGACTATGATAAAA--TATTAGTGTTTCTAATAGCACTCATGAACTACACCCAGT-CCATCGAGTATGGAACTATTGCAACTGCATGCTGTGCGACTCAACTTGAGACTACACAACCTTGGCTGAATCTCCAAACGGTTTGGCCAGAACCTCAAAAC
Testudines                    ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Caiman_yacare                 GCAGCAT--GGGGGAGGAC------GGGAGAGTGCTGTCACATCTGCTGTCAGCAGTCAACTTCCCTGCTCTCTCAGCAGTTAGGCAAGATCTCTAAC----TCTT--GATCTGGGGTGCAGGGTTTAGCCCTGAAAGGAGGCAGATGTTCAAGCCATGGGCAGGAGCATCCTGTTGC-----------------------------ACATT-GGATGCTCGATTTCTGGGAGGAAATAG-TTTTTGGGGAAGTGCAGGTTTTAGAAGCCGATTACAACATGTTTAGAATTCAGTTTGCCGCTGTTCTTCCAAGCCCCAGAATGAGGTCCTGTTTTGAAACCCGGTGCTTTTTTAAATCTACAAGTTAACTGTTTT--CTTTTCCTTGCAGAAGAAGAA---CAAGAGGAAGATGAGGAGGAAATTGATGTGGTCACGCTAGTAGAGGTGAATGGAGTTGAATCCGGCACAGAGTCTAGTACAGACTCTAGCGGAGAGTCCAGCACAGATTCCATAGACGGACACAGCAAGCCACACCACAGCCCGCTAGTTCTCAAGCGTTGTCACGTCCCCATCCATCAGCACAATTACGCTGCTCCTCCTTCCACCAAGGTTGAATATCCATCAGCAAAGAGGTTAAAATTGGACAATGGCAGAATTCTCAAACAGATCAGTAACAACAGAAAGTGCTCAAGTCCCCGCACATCAGACTCGGAAGAGAACGACAAGAGGCGAACGCACAATGTCCTGGAGCGCCAAAGGAGAAACGAGTTGAAGTTGAGCTTCTTTGCTTTGCGTGACGAGATACCCGAGGTAGCCAACAATGAAAAGGCACCCAAAGTCGTCATCCTTAAAAAGGCAACGGAATATGTTATTTCTATTCAAACAGATGAACACAGACTGATTGCAGAGAAAGAGCAGTTGAGGAGACGGCGAGATCAATTGAAACATAAACTTGAGCAGTTAAGGAACTCTTGTGCATAGAAACTCTTGGGTATGGACTTGAGTAACCCAAACCAGAC---AA-TGTGGTAAAA-TTATTAATGTTTCTAATTTTACTCATGAACTATGCC-AATTCT---GAA-A-GGAGTTCTTGCAATTGCATGCTGTGCAAAATGACTTGCAACTACACAACCTTGGCTCCATCTCTCATGAGCTGAGCCATAACCTCAA--C
Caiman_latirostris            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Melanosuchus_niger            GCAGCAT--GGGGGAGGAC------GGGAGAGTGCTGTCACATCTGCTGTCAGCAGTCAACTTCCCTGCTCTCTCAGCAGTTAGGCAAGATCTCTAAC----TCTT--GATCTGGGGTGCAGGGTTTAGCCCTGAAAGGAGGCAGATGT-----------------------------GCAACAGGATGCTCCTGCCCATGGCTTGAACATTTGGATGCTCGATTTCTGGGAGGAAATAG-TTTTTGGGGAAGTGCAGGTTTTAGAAGCCGATTACAACATGTCTAGAATTCAGTTTGCCGCTGTTCTTCCAAGCCCCAGAATGAGGTCCTGTTTTGAAACCCGGCGCTTTTTTAAATCTACAAGTTAACTGTTTT--CTTTTCCTTGCAGAAGAAGAA---CAAGAGGAAGATGAGGAGGAAATTGATGTGGTCACGCTAGTAGAGGTGAATGGAGTTGAATCCGGCACAGAGTCTAGTACAGACTCTAGCGGAGAGTCCAGCACAGATTCCATAGACGGACACAGCAAGCCACACCACAGCCCGCTAGTTCTCAAGCGTTGTCACGTCCCCATCCATCAGCACAATTACGCTGCTCCTCCTTCCACCAAGGTTGAATATCCATCAGCAAAGAGGTTAAAATTGGACAATGGCAGAATTCTCAAACAGATCAGTAACAACAGAAAGTGCTCAAGTCCCCGCACATCAGACTCGGAAGAGAACGACAAGAGGCGAACGCACAATGTCCTGGAGCGCCAAAGGAGAAACGAGTTGAAGTTGAGCTTCTTTGCTTTGCGTGACGAGATACCTGAGGTAGCCAACAATGAAAAGGCACCCAAAGTCGTCATCCTTAAAAAGGCAACGGAATATGTTATTTCTATTCAAACAGATGAACACAGACTGATTGCAGAGAAAGAGCAGTTGAGGAGACGGCGAGATCAATTGAAACATAAACTTGAGCAGTTAAGGAACTCTTGTGCATAGAAACTCTTGGGTATGGACTTGAGTAACCCAAACCAGAC---AA-TGTGGTAAAA--TATTAATGTTTCTAATCTTACTCATGAACTATGCC-AATTCT---GAA-A-GGAGTTCTTGCAATTGCATGCTGTGCAAAATGACTTGCAACTACACAACCTTGGCTCCATCTCTCATGAGCTGAGCCATAACCTCAA--C
Paleosuchus_palpebrosus       GCAGCAT--GGGGGAGGAC------GGGAGAGTGCTGTCACATCTGCTGTCAGCAGTCAACTTCCCTGCTCTCTCAGCAGTTAGGCAAGATCTCTAAC----TCCT--GATCTGGGGTGCAGGGTTTAGCCCTGAAAGGAGGCAGATGTTGAAGCCATGGGCAGGAGCATCCTGTTGC-----------------------------ACATT-GGATGCTTGATTTCTGGGAGGAAATAG-TTTTTGGGGAAGTGCAGGTTTTAGAAGCCGATTACAACATGTTTAGAATTCAGTTTGCCGCTGTTCTTCCAAACCC-AGAATGAGGTCCTGTTTTGAAACCCGGTGCTTTTTTAAATCTACAAGTTAACTGTTTT--CTTTTCCTTGCAGAAGAAGAAGAACAAGAGGAAGATGAGGAGGAAATTGATGTGGTCACGCTAGTAGAGGTGAATGGAGTTGAATCCGGCACAGAGTCTAGTACAGACTCTAGCGGAGAGTCCAGCACAGATTCCATAGACGGACACAGCAAGCCACACCACAGCCCGCTAGTTCTCAAGCGTTGTCATGTCCCCATCCATCAGCACAATTACGCTGCTCCTCCTTCCACCAAGGTTGAATATCCATCAGCAAAGAGGTTAAAATTGGACAATGGCAGAATTCTCAAACAGATCAGTAACAACAGAAAGTGCTCAAGTCCCCGCACATCAGACTCGGAAGAGAACGACAAGAGGCGAACGCACAACGTCCTGGAGCGCCAAAGGAGAAACGAGCTGAAGTTGAGCTTCTTTGCTTTGCGTGACGAGATACCCGAGGTGGCCAGCAATGAAAAGGCACCCAAAGTCGTCATCCTTAAAAAGGCAACAGAATATGTTATTTCTATTCAAACAGATGAACACAGACTGATTGCAGAGAAAGAGCAGTTGAGGAGACGGCGAGATCAATTGAAACATAAACTTGAGCAGTTAAGGAACTCTTGTGCATAGAAACTCTTGGGTATGGACTTGAGTAACCCAAACCAGACTGAAA-TATGATAAAA--TATTAATGTTTCTAATCTTACTCATGAACTATGCC-AATTCT---GAA-A-GGAGTTCTTGCAATTGCATGCTGTGCAAAATGACTTGCAACTACACAACCTTGGCTCCATCTCTCATGAGCTGAGCCATAACCTCAA--C
Paleosuchus_trigonatus        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Alligator_mississippiensis    GCAGCAT--GGGGGAGGAC------AGGAGAGTGCTATCCCATCTGCTGTCAGCAGTCAACTTCCCTGCTCTCTCGGCAGTTAGGCAAGATCTCTAAC----TCTT--GATCTGGGGTGCAGGGTTTAGCCCTGAAAGGAGGCGGATGTTCAAGCCATGGGCAGGAGCATCCTGTTGC-----------------------------ACATT-GGATGCTGGATTTCTGGGAGGAAATAGGTTTTTGGGGAAGTGCAGGTTTTAGAAGCTGATTACAACATGTTTAAAATTCAGTTTGCCGCTGTTCTTCCAAGCCC-AGAATGAGGTCCTGTTTTGAAACCCGATGCTTTTTTAAATCTACAAGTTAACTGTTTT--ATTTTCCTTGCAGAAGAAGAA---CAAGAGGAAGATGAGGAGGAAATTGATGTGGTCACGCTAGTAGAGGTGAATGGAGTTGAATCCGGCACAGAGTCTAGTACAGACTCTAGCGGAGAGTCCAGCACAGATTCCATAGACGGACACAGCAAGCCACACCACAGCCCGCTAGTTCTCAAGCGGTGTCATGTCCCCATCCACCAGCACAATTACGCTGCTCCTCCTTCCACCAAGGTTGAATATCCGTCAGCAAAGAGGTTAAAATTGGACAATGGCAGAATTCTCAAACAGATCAGTAACAACAGAAAGTGCTCAAGTCCCCGCACATCAGACTCGGAAGAGAACGACAAGAGGCGAACACACAACGTCTTGGAGCGCCAAAGGAGAAACGAGCTGAAGTTGAGCTTCTTTGCTTTGCGCGACGAGATACCTGAGGTAGCCAACAATGAAAAGGCACCCAAAGTCGTCATCCTTAAAAAGGCAACGGAATATGTTATTTCTATTCAAACAGATGAACACAGACTGATTGCAGAGAAAGAGCAGTTGAGGAGGCGGCGAGATCAATTGAAACATAAACTTGAGCAGCTAAGGAACTCTTGTGCATAGAAACTCTTGGGTATAGACTTGAGTAACCCAAACCAGACTGAAA-TATGATAAAA--TATTAATGTTTCTAATCTTACTCATGAACTATACC-AGTTCC---GAA-A-GGAGCTCTTGCAATTGCATGCTGTGCAAAATGACTTGCAACTACACAACCTTGGCTTCATCTCTCATGAGCTGAGCCATAACCTCAA--C
Alligator_sinensis            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_rhombifer          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_acutus             ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_intermedius        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_moreletii          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_siamensis          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_johnstoni          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_mindorensis        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_novaeguineae       ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_porosus            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_palustris          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_niloticus          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_cataphractus       GCAGCAT--GGGGGGGGGCGGACACGGGAGGGTGCTGTCACATCT---GTCAGCAGTCGACTTCCCTGCTCTCTGGGCACTTAGGCAAGATCTCTAACGAGATCAAGAGATCTGGGGCGCAGGGCTTAGCCCTGAGGGGAGGCGGATGTTCAAGCCGTGGGCAGGAGCATCCTGTTGC-----------------------------ATGCT-GGATGCTAGATTTCTGGGAGGAAATAG-TTTTTGGGGAAGTGCAGGTTTTTGAAGCCAATTACAACATGTTTAAAATTCAGTTTGCCGCTGTTCTTCCAAGCCC-AGAATAAGGTCCTGTTTTGAAACCCGGGGCTTCTTTAAATCTACAAATTAACTGTTTTTTCTTTTTCTTGCAGAAGAAGAA---CAAGAGGAAGATGAGGAGGAAATTGATGTGGTCACGCTAGTAGAGGTGAATGGAGTTGAATCCGGCACAGAGTCTAGTACAGACTCTAGCGGAGAGTCTAGCACAGATTCCACAGACGGACACAGCAAGCCACACCACAGCCCGCTAGTTCTCAAGCGGTGTCATGTCCCCATCCATCAGCACAATTACGCTGCTCCTCCTTCCACCAAGGTTGAATATCCGTCAGCAAAGAGGTTAAAATTGGACAATGGCAGGATTCTCAAGCAGATCAGTAACAACAGAAAGTGCTCAAGTCCCCGCACATCAGACTCGGAAGAAAACGACAAGAGGCGAACGCACAACGTCCTGGAGCGCCAAAGGAGAAACGAGCTGAAGTTGAGCTTCTTTGCTTTGCGTGACGAGATACCCGAGGTAGCCAACAATGAAAAGGCGCCCAAAGTCGTCATCCTTAAAAAAGCAACGGAATATGTTATTTCTATTCAAGCAGATGAGCACAGACTGATAGCAGAGAAAGAGCAGCTGAGGAGGCGGCGAGATCAATTGAAACACAAACTTGAGCAGCTAAGGAACTCTTGTGCATAGAAACTCTTGGGTATAGACTTGAGTAACCCAAACCAGGCTGAAA-TATGATAAAAAATATTAATGTTTCTAATCTTACTCATGACCTACACC-GGTTCC---AAA-A-GGAGCTCTTGCAATTGCATGCTGTGCGGAATGACTTGCAACTACACAACCTTGGCTTTGTCTCTC--GAGCTGAGCCATAACCTCAA--C
Osteolaemus_tetraspis         GCAGCAT--GGGGGGGGGCRGACACGGGAGGGTGCTGTCACATCT---GTCAGCAGTCGACTTCCCTGCTCTCTGGGCACTTAGGCAAGATCTCTAACGAGATCAAGAGATCTGGGGCGCAGGGCTTAGCCCTGAGGGGAGGCGGATGTTCAAGCCGTGGGCAGGAGCATCCTGTTGC-----------------------------ATGCT-GGATGCTAGATTTCTGGGAGGAAATAG-TTTTTGGGGAAGTGCAGGTTTTTGAAGCCAATTACAACATGTTTAAAATTCAGTTTGCCGCTGTTCTTCCAAGCCC-AGAATAAGGTCCTGTTTTGAAACCCGGGGCTTCTTTAAATCTACAAATTAACTGTTTTTTCTTTTTCTTGCAGAAGAAGAA---CAAGAGGAAGATGAGGAGGAAATTGATGTGGTCACGCTAGTAGAGGTGAATGGAGTTGAATCCGGCACAGAGTCTAGTACAGACTCTAGCGGAGAGTCTAGCACAGATTCCACAGACGGACACAGCAAGCCACACCACAGCCCGCTAGTTCTCAAGCGGTGTCATGTCCCCATCCATCAGCACAATTACGCTGCTCCTCCTTCCACCAAGGTTGAATATCCGTCAGCAAAGAGGTTAAAATTGGACAATGGCAGGATTCTCAAGCAGATCAGTAACAACAGAAAGTGCTCAAGTCCCCGCACATCAGACTCGGAAGAAAACGACAAGAGGCGAACGCACAACGTCCTGGAGCGCCAAAGGAGAAACGAGCTGAAGTTGAGCTTCTTTGCTTTGCGTGACGAGATACCCGAGGTAGCCAACAATGAAAAGGCGCCCAAAGTCGTCATCCTTAAAAAAGCAACGGAATATGTTATTTCTATTCAAGCAGATGAGCACAGACTGATAGCAGAGAAAGAGCAGCTGAGGCGGCGGCGAGATCAATTGAAACACAAACTTGAGCAGCTAAGGAACTCTTGTGCATAGAAACTCTTGGGTATAGACTTGAGTAACCCAAACCAGGCTGAAA-TATGATAAAAAATATTAATGTTTCTAATCTTACTCATGACCTACACC-GGTTCC---AAA-A-GGAGCTCTTGCAATTGCATGCTGTGCGGAATGACTTGCAACTACACAACCTTGGCTTTGTCTCTC--GAGCTGAGCCATAACCTCAA--C
Tomistoma_schlegelii          GCAGCAA-GGGGGGGGGAC------GGGAGGGTGCTGTCACATCTGCTGTCAGCAGTCGACTTCCCTGCTCTCTT-GCACTTAGGTAAGATCTCTAACGAGATCAAGAGATCTGGGGTGCAG-ATCT---CCTGAGGGGAGGCGGATGTTCAAGGCGTGGGCAGGAGCATCCTGTTGC-----------------------------ACACT-GGATGCTGGATTTCTGGGAGGAAATAG-TTTTTGGGGAAGTGCAGGTTTTAGAAGCCGATTACAACATGTTTAAAATTCAGTTTGCCGCTGTTCTTCCGAGCCC-AGAATAAGGTCCTGTTTTGAAACCCGGTGCTTCTTTAAATCTACAAATTAACTGTTTT--ATTTTTCTTGCAGAAGAAGAA---CAAGAGGAAGATGAGGAGGAAATTGATGTGGTCACGCTAGTAGAGGTGAATGGAGTTGAATCCGGCACAGAGTCTAGTACAGACTCTAGCGGAGAGTCTAGCACAGATTCCACAGACGGACACAGCAAGCCACACCACAGCCCGCTAGTTCTCAAGCGGTGTCATGTCCCCATCCATCAGCACAATTACGCTGCTCCTCCTTCCACCAAGGTTGAATATCCGTCAGCAAAGAGGTTAAAATTGGACAATGGCAGGATTCTCAAGCAGATCAGTAACAACAGAAAGTGCTCGAGTCCCCGCACATCAGACTCGGAAGAAAACGACAAGAGGCGAACACACAACGTCCTGGAGCGCCAAAGGAGAAACGAGCTGAAGTTGAGCTTCTTTGCTCTGCGTGACGAGATACCCGAGGTAGCCAACAATGAAAAGGCACCCAAAGTCGTCATCCTTAAAAAAGCAACGGAATATGTTATTTCTATTCAAGCAGATGAGCACAGACTGATAGCAGAGAAAGAGCAGCTGAGGAGGCGGCGAGATCAATTGAAACATAAACTTGAGCAGCTAAGGAACTCTTGTGCATAGAAACTCTTGGGTATAGACTTGACTAACCCAAACCAGGCTGAAA-TACGATAAAAAATATTAATGTTTCTAATCTTACTCATGAACTACACC-GGTTCC---GAA-A-GGAGCTCTTGCAATTGCATGCTGTGCGGAATGACTTGCAACTACACAACCTTGGCTTCATCTCTCGAGAGCTGAGCCATAACCTCAA--C
Gavialis_gangeticus           GCAGCAAGGGGGGGGGAAC------GGGAGGGTGCTGTCACATCTGCTGTCAGCAGTCGACTTCCCTGCTCTCTT-GCACTTCGGTAAGATCTCTAACAAGGTCAAGAGATCTGGGGTGCAGGGCTCAGCCCTGAGGGGAGGCGGATGTTCGAGGCGTGGGCAGGAGCATCCTGTTGC-----------------------------ACACT-GGATGCTGGATTTGTGGGAGGAAATAG-TTTTTGGGGAAGTGCAGGTTTTAGAAGCCAATTACAACATGTTTAGAATTCAGTTTGCCGCTGTTCTTCCGAGCCC-AGAATAAGGTCCTGTTTTGAAACCCGGTGCTTCTTTAAATCTACAAATTAACTGTTTT--ATTTTTCTTGCAGAAGAAGAA---CAAGAGGAAGATGAGGAGGAAATTGATGTGGTCACGCTAGTAGAGGTGAATGGAGCTGAATCCGGCACAGAGTCTAGTACAGACTCTAGCGGAGAGTCTAGCACAGATTCCACAGACGGACACAGCAAGCCACACCACAGCCCGCTAGTTCTCAAGCGGTGTCATGTCCCTATCCATCAGCACAATTACGCTGCTCCTCCTTCCACCAAGGTTGAATATCCGTCAGCAAAGAGGTTAAAATTGGACAATGGCAGGATTCTCAAGCAGATCAGTAACAACAGAAAGTGCTCGAGTCCCCGCACATCAGACTCGGAAGAAAACGACAAGAGGCGAACACACAACGTCCTGGAGCGCCAAAGGAGAAACGAGCTGAAGTTGAGCTTCTTTGCTTTGCGTGACGAGATACCCGAGGTAGCCAACAATGAAAAGGCACCCAAAGTCGTCATCCTTAAAAAAGCAACGGAATACGTTATTTCTATTCAAGCAGATGAGCACAGACTGATAGCAGAGAAAGAGCAGCTGAGGAGGCGGCGAGATCAATTGAAACATAAACTTGAGCAGCTAAGGAACTCTTGTGCATAGAAACTCTGGGGTATAGACTTGACTAACCCAAACCAGGCTGAAA-TACGATAAAAAATATTAATGTT-CTAATCTTACTCATGAACTACACC-GGTTCC---GAA-A-GGAGCTCTTGCAATTGCATGCTGTGCGGAATGACTTGCAACTACACAACCTTGGCTTCATCTCTCAAGAGCTGAGCCATAACCTCAA--C
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Struthio_camelusY12025      CCAAAAATAATGCTAAAGAGATAAATGACACCCCCAAACTCAACAACCACCCACAACCAACAACAGACCCAACAACCAAACCAAGTACACCATAATAGGGAGACGGATTAGACGCCCCAGCTACCGCTCCCAAAATAGAACAAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGCCCCCAACATTCGAAAATCGCACCCCCTGCTCAAAATTATCAACAACTCCCTAATCGACCTCCCATCTCCCTCAAACATC
Gallus_gallus               CCAAAAATAACGCCAAGGAAACAAAAGAAACACCCAAACTCACTAACCACCCACATCCTATCACAGACGCTACCACCAACCCCACCACCCCATAATACGGCGAAGGATTAGACGCCACAGCTAAAACCCCCAGCATAAAACAAATCCCAAGAAAAATCA--CAAAATAAGTCATATTATTCCCGCTTGGT-TAGACCCCAAGGACTACGGCTTGAAAAGCCATTGTTGT-TCT-CAACT-ACGGGAACTAAACTA--------ATGGCACCCAACATTCGAAAATCCCACCCCCTACTAAAAATAATTAACAACTCCCTAATCGACCTCCCAGCCCCATCCAACATC   [333]
Chrysemys_pictaNC002073     TCAAAAATAGCACCAAAGACATAAAAGATCCTCCCATACCAACCAATACTCCACACCCAGAAGCTGCCCCTAATACTAAACTAAGAACACCATAATAGGGTGATGGATTACAAGACACACCCACTATTCAAAAGACAAAGCAAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGACCATAAACCACCGAAAAACCCACCCACTAACAAAAATCATCAACAACTCATTCATTGATCTACCAAGCCCCTCCAACATC
C_crocodiluscr              ????TAACACCACTAAAGGCATAAAACTCCCACCCTCAATCACCACCAAACCGCTGCCCAACATAGCCATAAAAACTAAACTCAGCACAGCAAAATGAACCCCAGAATTTGCCCCAACCATTACCGCACATACCAACACCAAAACACCTACA---------ATGTAAATTCCAT--TATTCTCATTTGGACTTC-AACCAAAACCTGAGGTCTGAAAAACCCCCGTTGT-TATTCAACT-ATAAAAATAATTAACCC------ATGACCCACCAACTACGAAAATCGCACCCACTCCTCAAACTTGTCAACCACTCACTAATTGACCTCCCAACCCCATCAAAACAT   [327]
C_latirostris               ?????ATCACCAC?AAAGGCATAAAACTCCCACCCTCAACCACCACTAAACCACTGCCCAGCACAGCCATAAAAACCAAGCTTAGCACAGCAAAATGAACCCCAGAATTTGCCCCC???????????????ATCAACACCAAACAACCTAAAAACA-----ATGTAAATTCCAT--AATTCCCATTTGGA?TT?-AACCAAAACCTGAGGTCTGAAAAACCCCTGTTGT-TCTTCAACT-ATGAAAATAATCCACCT------ATGACCCACCAACTGCGAAAATCTCACCCACTCCTCAAAC????????????????????????????????????????????   [331]
M_niger                     ?????AACACCACTAACGGCATAAAACTCCCACCCTCAATTACCACCAAGCCCCCTCCTAACACAGCCATAAAAACCAAGCTCAACACGGAAAAATGAACTCCAGAATTTGCCCCCACTATTACTGCACACACCAATACCAAACAACCTAAAAACA-----GTGTGAACTCCAT--TATTCTAATTTGGG-TTTAAACCAAAACCTGGGGTCTGAAAAACCCCTGTTGT-TATTCAACT-ACAAGAATAATTTTTTTTTA---ATGACCCACCAACTACGAAAATCGCACCCACTCCTCAAAC????????????????????????????????????????????   [334]
P_palpebrosus               ??????GCACCACCAACGGCATAAAACTCCCACCCTCAACCACCACCAAGCAACTGCCAAACACGGCCATAAATACCAAACTCAACACAGCAAAATGAATCCCAGAATTCGCCCCCACCATTACCGCACACGCCAGCACCWRACAACCCMAAAAAT-----ATGTAAATTCCAT--TATTCTCATTTGGATTTC-AACCAAAATCTGAGGTCTGAAAAACCTCCGTTGT-CCTTCAACT-ATAAAAACCCCC-----------ATGACCCACCAACTACGAAAATCCCACCCACTCCTCAAACTCTTCAACCACTCCCT????????????????????????????   [326]
Paleosuchus_trigonatus      ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
A_mississippiensis          ?????AACACCACTAAAGGCATAAAACTTCCACCCTCAATAATTAACAAACCACTACCGAATACAACTACAAAAAGTAAACTTACCACGGCAAAATGAATTATTGAACTTGCCGCCACCATCATCGCACATGCTAATATCAAACAACAAAGAAACA-----ACGTAAATCCCAT--TATTTTTATTTGGCCTTC-AACCAAAACCTGAGGTCTGAAAAACCCCTGTTGT-ATTTCAACT-ATAAAAACCC-------------ATGACCCACCAACTACGAAAATCCCACCCAATCATTAAACTCATCAACCGCTC???????????????????????????????   [324]
A_sinensis                  TTAATAATACCACCAGGGGCATAAAACTTCCACCCTCAACTACTACCAAACCACTACCGAACACAGCCACAAAAAGCAAGCTCACTACAGCAAAGTGGATCATTGAACTTGCCGCTACCATTATCGCACATACTAGTATAAAACAACAAAAAAACA-----ACGTAATCTCCAT--CATTTTTATTTGGATTTC-AACCAAAACCTGAGGCCTGAAAAGCCCCCGTTGT-CCTTCAACT-ATAAAAACCC-------------ATGACCCACCAGCTACGAAAATCCCACCCACTTATTAAACTTATTAACCAAACCCTT???????????????????????????   [324]
C_rhombifer                 ?TAGTAGTACTACAAGCGGCATAAAACTTCCACCTCCCACTACTAATAATGCACTGCCAAATATTGCAGCAAAAAGCAAACTAACCACCCCATAATGGATCGTCACCCCAGACGCCACTAACACCACACTGACTATCATTAAACAACAAAGAAGAAAAA--ATGTAATTCCCAT--TATTCTCACCTGGACT-TAGACCAAGACCTGGGGTACGAAAAACCCCTGTTGTATCTTCAACT-ATAAAAACTAACATT-AAACCAAATGGCCCACCAACTACGAAAATCCCACCCACTCTTAAAACTAGTAAACCACTC???????????????????????????????   [340]
C_acutus                    TTAGTAGTACCACAAGCGGCATAAAACTTCCACCCCCTACTACTAATAATGCACTACCAAATATTGCAGCAAAAAGCAAACTAACCACCCCATAATGAATCGTCACCCCAGACGCCACTAACACCACGCTAATTATCATTAAACAACAAAGAAGAAAAA--ATGTAATTCCCAT--TATTCTCACTTGGACTCTAGACCAAGACCTGGGGTACGAAAAACCCCCGTTGTATTTTCAACT-ATAAAAACTAACACT-AAACCAAATGGCCCACCAACTACGAAAATCCCACCCACTTTTAAAACTAGTAAACCACTC???????????????????????????????   [341]
C_intermedius               ?TAGTAGTACSMCAAGCGGCATAAAACTTCCACCCCCTACTACCAATAATGCACTACCAAATATTGCAGCAAAAAGCAAACTAACCACCCCATAATGAATCGTCACCCCAGACGCCACTAACACCACGCTAATTATTATTAAACAACAAAGAAGAAAAGAAATGTAATTCCCAT--TATTCTCACTTGGACTATAGACCAAGACCTGGGGTACGAAAAACCCCTGTTGTATTTTCAACT-ATAAAAACTAACACT-AAACCAAATGGCCCACCAACTACGAAAATCCCACCCACTTTTAAAACTAGTAAACCACTC???????????????????????????????   [343]
C_moreletii                 ???????????????GC?GCHT??HHCTTCCHCCCCCTHCTHCTHHTHHTGCGCTGCCAAATATTGCAGCAAAAAGCAAACTAACCACCCCATAGTGGATCGTCACCCCAGACKCCACTAACACCACACTGATTATCATTAAGCAACAAAGAAGAAAAA--ATGTAATTCCCAT--TATTCTCACTTGGACTCTAGACCAAGACCTGGGGCACGAAAAACCCCCGTTGTACTTTCAACTTATAAAAACCAACATT-AAACCAAATGGCCCACCAACTACGAAAATCCCACCCAC????AAAACT?GTAAAC?ACT????????????????????????????????   [342]
C_siamensis                 ???????CACCACAAGTGGCATAAAACTTCCACCCCCCACTACTAACAACCCACTACCAAATATTGCAGCAAAAAGCAAACTAACCACCCCGTAGTGGATCGTCACCCCAGATGCCACTAACACCACACTAATTATCATTAAACAACAAAGAAGAAAAA--ACATAATTCCCAT--CATTCTCACTTGGGCTCTGTACCAAGACCTAGGGCACGAAAAGCCCCCGTTGTATTTTCAACT-ATAAAAACTGACATCCAAACCAAATGGCCCACCAACTACGAAAATCCCACCCACTCTTAAAACTAGTAAACCACTC???????????????????????????????   [342]
C_johnstoni                 TCAGAAGTACCACAAGCGGCATAAAACTTCCACCCCCCATTGCTAGTAGCCCACTTCCAAATATTGCAGCAAAAAGCAAACTAACCACCCCATAATGGATCGCCACCCCCGACGCCACTAATACTACACTAGCCATCATTAAACAACAAAGAAGAAAAA--ATGTAATTCCCAT--TATTCTCACTTGGATTATAGACCAAGACCTAGGGCACGAAAAACCCCCGTTGTATTTTCAACT-ATAAAAACTAACATT-AAATCAAATGACCCACCAACTACGAAAATCCCACCCGCT?TTAAAATTAATAAAC?AC?????????????????????????????????   [341]
C_mindorensis               ????CAATACTMM?ASY?GCAT??AACCTCCACCCCCCACTACCAACAACCCACTACCAAATATTGCAGCAAAAAGCAGACTAACCACCCCATAATGGATCGTCACCCCCGACGCCACTAGCACCACACTAATTATCATTAAAAAACAAAGAAGAA-----ATGTAATTCCCAT--TATTCTCACTTGGGCTCTAGACCAAGACCTGAGGCACGAAAAACCCCCGTTGTATCTTCAACT-ATAAAAACTAACGTTCAAACCAAATGGCCCACCAACTACGAAAATCCCACCCGCT???AAAACTAGTAAA?????????????????????????????????????   [339]
C_novaeguineae              ???CAATACTAMC?ACYAACATAAAACTTCCACCCCCCACTACCAACAACCCACTACCAAATATTGCAGCAAAAAGCAGACTAACCACCCCATAGTGGATCGTCACCCCCGACGCCACTAACACCACACTAATTATTATTAAAAAACAAAGAAGAA-----ATGTAATTCCCAT--TATTCTCACTTGGGCTCTAGACCAAGACCTGAGGCACGAAAAGCCCCTGTTGTGTATTCAACT-ATAAAAACTAATATTCAAACCAAATGACCCACCAACTACGAAAATCCCACCCACTC??AAAACTAGTAAAATA??????????????????????????????????   [339]
C_porosus                   ????TA?CACCACAAGTGGCATAAAACTTCCACCCCCTGCTACCAACAACCCACTACCAAATATTGCCGCAAAAAGCAAACTAACCACCCCATAATGGATCGTCACCCCAGACGCCACTAACACCACACTAATTATCATTAAGCAACAAAGAAGAAAAA--ATGTAATTCCCAT--TATTCTCACTTGGACTATGGACCAAGACCTGGGGCACGAAAAACCCCCGTTGTATTTTCAACT-ATAAAAATCAGCATCTAAACCAAATGACCCACCAACTACGAAAATCCCACCCACTCCTAAAGCTAGTAAACCACTC???????????????????????????????   [342]
Crocodylus_palustris        ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
C_niloticus                 TTAGTAGTACCACAAGCGGCATAAAACTTCCACCCCCTACTACTAACAATGCACTGCCAAATATTGCAGCAAAAAGCAAACTAACCACCCCATAGTGGATCGTCACCCCAGACGCCACTAACACCACACTAATTATCATTAAACAACAAAGAAGAAAAA--ATGTAATTCCCAT--TATTCTCACTTGGACTCTAGACCAAGACCTGGGGCACGAAAAACCCCTGTTGTACTTTCAACT-ATAAAAACTAACATT-AAACCAAATGACCCACCAACTACGAAAATCCCACCCACTTTTAAAACTAGTAAATCACTCTCTAA??????????????????????????   [341]
C_cataphractus              ???????????????????CACAAAACTCCCTCCACCTGCCACCAATAAACCACTACCAAACATTGCTGCAAACAACAAACTAACCACTCCATAGTGGATTGTAACCCCAAAGTCCACCAGTACCACACTTACCATTATTAAACAACAAAGAAAAAAAA--GCATAGTTCCCAT--TATTTTAACTTGGACTTTAAACCAAGACCTGGGGTACGAAAAACCCCTGTTGTACTTTCAACT-ATAAAAACTACT????????---ATGGCCCACCAACTACGAAAATCCCACCCGCTACTAAAACTAATAAACCACTC???????????????????????????????   [339]
O_tetraspisb                ??AATAACACCACAAGCGGCATAAAACTCCCCCCTCCTACTACCAACAAACTACTACCCAATATTGTAGCAAAAAGCAAACTAACCACCCCATAATGAATCGTAGCCCCAAAAGCTACTAATACAACACTGATTATCATTAAACAGCAGAGAATAAAAA--ATATACCTCCCAT--TATTTTTACTTGGACTTTAAACCAAGACCTAAGGCACGAAAAGCCCTCGCTGTA-TTTCAACT-ATAAAAACTCAATAATTAAATTAATGATCCACCAACTACGAAAATCCAACCCCATATTAAAACTGATAAATAATTC???????????????????????????????   [341]
T_schlegelii                ?????AATACTACTATTGGTATGAAGCTTCCTCCCCCAACTGCCAGCAGGCCACCACTTGATAATGCAGCAAAAAGCAGACTAATTACCCCATAATGGGTCGTGGCCCCCGCTGATACTAATACCACACCTACTAATATTAAACTACTAAGAGCAAAAA--AAGTCATTCCCAT--TATTCTCACTTGGAGTCT-AACCAAGACCTGAGGTATGAAAAACCCCCGTTGTAGCTTCAACC-ACGAGAATCACCTTATCAA----ATGGCCCACCAACTACGAAAGTCCCACCCCCTACTAAAACT?ATAAACC?ACT???????????????????????????????   [337]
G_gangeticus                ??????ATACTACAATGGGCATAAAACTGCCTCCTCCAACCACCAATAAACCACTACTTAATACCGCAGCAAAGAGCAAACTTACCACCCCATAGTGTGTTGTAGCACCCGCCGCCACTAACACAACA???CCAAATATTAAACAAACAAAGAAAAAGAA-ATGCAATTTCCAT--TATTTTCACTTGGACTATAAACCAAGACTTGAGGTACGAAAAACCTCCGTTGTACATTCAACT-ATAAAAACCACTTCAACCAA---ATGGCCCACCAACTACGAAAATCCCACCCCCTACTAAAACT?GTAAA?????????????????????????????????????   [340]
extinct_taxon               ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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[BDNF = 563]
Rhea_americana              ATCTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCGATGAAAGAAGCTAGTGTAAGGGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTGCGGACCCATGGGACTCTGGAGAGCCTAAACGGGCCCAATGCTGGTTCAAGAGGACTGACGTCGCTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCGGGACATGCAGCCCAGCGAGGAAAACAAGGATGCAGACTTGTACACATCGCGAGTCATGCTGAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCCCTGCTCTTCCTGCTTGAGGAGTACAAAAACTACTTGGATGCTGCAAATATGTCCATGAGAGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGCCGAGGGGAACTGAGCGTATGTGACAGTACGAGTGAGTGGGTAACAGCGGCAGAGAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCGACTGTCACAGTCCTTGAAAAAGTTCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGGTACACGAAAGAGGGTTGCAGGGG   [563]
Gallus_gallus               ATCTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCGATGAAAGAAGCTAGTGTAAGAGGACATGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTTGAAAGCCTAACTGGGCCCAATGCTGGTTCAAGAGGACTGACATCACTGGCGGACACTTTTGAACACGTGATAGAGGAGCTTCTAGATGAAGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAGGAAAACAAGGATGCGGACTTGTACACATCCCGAGTCATGCTGAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCACTGCTCTTTCTGCTCGAGGAGTACAAAAACTACCTGGATGCTGCAAACATGTCCATGAGAGTCCGGCGTCACTCTGACCCAGCTCGCCGTGGGGAACTGAGCGTCTGTGACAGCACAAGCGAGTGGGTAACAGCAGCGGAGAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACTGTCACAGTCCTTGAAAAAGTCCCAGTACCTAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGGTACACAAAGGAAGGCTGCAGGGG   [563]
Pyxis_planicauda            ATCTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCTATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACTAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCATGGGACTCTGGAGAACCTAAGTGGGCCCAACACTGGTTCAAGAGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGAACAGGACATCCAGCCCAGTGAGGAAAACAAGGATGCCGACTTGTACACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAGCCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCCATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCTGCTCGCCGAGGGGAACTGAGCGTGTGTGACAGTGCTAGTGAGTGGGTAACAGCAGCAGAGAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACGGTTACGGTCCTGGAAAAAGTCCCAGTATCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAATCCCAAAGGTTACACAAAAGAGGGTTGCAGGGG   [563]
C_crocodilus                ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGCTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTGTACACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCGGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACAGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
C_latirostris               ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGCTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTGTACACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCGGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACAGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
M_niger                     ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGCTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTGTACACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCGGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACAGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
P_palpebrosus               ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTATTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGCTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTTGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTGTATACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCGGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACAGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
P_trigonatus                ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTATTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGCTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTGTATACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCGGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACAGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
A_mississippiensis          ?????????????????????????????????????????????AGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGCTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTGTATACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCAGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACAGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
A_sinensis                  ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGCTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTGTATACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGCGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCAGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACAGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTACGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
C_rhombifer                 ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGTTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTATATACGTCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCAGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACCGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAAACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCCGGGG   [563]
Crocodylus_acutus           ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
C_intermedius               ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGTTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGAYTTATATACGTCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCAGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACCGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAAACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCCGGGG   [563]
Crocodylus_moreletii        ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_siamensis        ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_johnstoni        ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_mindorensis      ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_novaeguineae     ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_porosus          ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_palustris        ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_niloticus        ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
C_cataphractus              ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGTTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTATATACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCAGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACCGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGGTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
O_tetraspis                 ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGTTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTATATACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCAGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACCGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGGTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
T_schlegelii                ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGTTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTGTATACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCAGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACCGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
G_gangeticus                ATTTCATACTTCAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAATGAAGCAAGTGTCAGAGGACAAGGCAGCTTGGCTTACCCAGGTCTTCGGACCCACGGGACTCTGGAGAGCCTAAGTGGGTCCAATGCTGGTTCAAGGGGACTGACATCACTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTTCTAGATGAGGATCAGGACATCCAGCCCAGTGAAGAAAACAAGGATGCAGACTTGTATACATCTCGGGTTATGCTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAACCCCCATTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTACAAAAATTACTTGGATGCTGCAAATATGTCTATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCAGCTCGTCGTGGGGAACTAAGTGTGTGTGACAGTACTAGTGAGTGGGTAACAGCAGCAGAAAAAAAGACTGCAGTGGACATGTCTGGTGCAACCGTTACAGTCTTGGAAAAAGTCCCAGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATACTTCTATGAGACCAAATGCAACCCCAAGGGTTACACAAAAGAGGGGTGCAGGGG   [563]
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[allozymes = 16]
[Alligatoridae: 1=LDH-2 2=6-PGD 3=G-6-PDH 4=DIP 5=TRI-2 6=TRI-3 7=Pro-3 8=MPI 9=ALB 10=a-MAC 11=TF;  Crocodyloidea + Tomistominae + Gavialinae: 12=G-6-PDH 13=PRO-2 14=MPI 15=a-MAC 16=TF]
Paleognathae         ??????????????    ??
Neognathae           ??????????????    ??
Testudines           ??????????????    ??
C_crocodilus_yacare  21111052301???    ??
C_latirostris        31111122000???    ??
M_niger              33111032304???    ??
P_palpebrosus        33230231311???    ??
P_trigonatus         33220210112???    ??
A_mississippiensis   00012311113???    ??
A_sinensis           12003001215???    ??
C_rhombifer          ???????????110    02
C_acutus             ???????????110    02
C_intermedius        ???????????110    03
C_moreletii          ???????????110    05
C_siamensis          ???????????110    02
C_johnstoni          ???????????110    00
C_mindorensis        ???????????110    04
C_novaeguineae       ???????????110    04
C_porosus            ???????????110    02
C_palustris          ???????????110    04
C_niloticus          ???????????110    01
C_cataphractus       ???????????10(0 1)00
O_tetraspis          ???????????000    00
T_schlegelii         ???????????101    16
G_gangeticus         ???????????001    16
extinct_taxon        ??????????????    ??
extinct_taxon        ??????????????    ??
extinct_taxon        ??????????????    ??
extinct_taxon        ??????????????    ??
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[ATP7A = 689]
Paleognathae                    ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Neognathae                      ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Geochelone_yniphora             TATTGTTGTGTATCAGCCTCATCTAATTACAGCAGAGGAAATCAAAAACCAAACTGAAGCTGCAGGTTTCACAGCAATCATCAAAAAACAGCCCAAACCCATCAAGCTGGGTGTTATTGATGTGGAACGTTTAAAGAACACCCAAACCAAATCTTCAGAGGGAACCCTTCAAAAAAGTCCAAAGCATATCAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCGATGGCATGCACTGCAATTCCTGTGTCTTAAATATCCAGAGCAGCATATCAGCACTTCCATCTGTAGCAAGCATAGTAGTTTCTTTAGAGAAGAAAACAGCTACTGTAAAGTACGACCCAGACTCCATCAGTATAGATGCACTGAGAAGAGCCATAGAGGYAGTATCACCAGGGACGTTTAAAGTCAGTCTTCCTGATGAATATGAAAACGTTGAGCTTTTCAGCGCACAGATATCTCCAGTGAAACCTTCTCAGACAGCTTTAAACAGCACCAACCAGTCCGTTACTCAAGTTACTGTGGTAAATATTGAGGGAATGACTTGTAATTCTTGTGTGCAATCTATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTAAAATCAATATGTGTCTCTCTTGTGAATCATAATGGGACTATAAAATATGATCCTCTCCTAACTTGTCCAGAAGACTTAAAATCTGCAATAGAGG   [689]
Ccrocodilus                     CATTGTTGCGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATCAAAAACCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCTCAAACCACTCAAGCTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATAGCCAAACCAAAAGCTCAGAGGGAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGCATCTCGAACATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAGTTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATATAAAGTCAGCCTTCCTGATGAATATGAAGATGCAGAGCTTCTCAACACACAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAATGGCCCCTTACACAAGTTACGGTGATAAATATTGCGGGAATGACTTGTAATTCTTGTGCGCAGTCCATTGAAGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACGTCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCAAGG   [680]
Clatirostris                    CATTGTTGCGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATCAAAAACCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCTCAAACCACTCAAGCTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATACCCAAACCAAAAGCTCAGAGGGAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGCATCTCGAACATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAGTTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATATAAAGTCAGCCTTCCTGATGAATATGAAGATGCAGAGCTTCTCAACACACAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAATGGCCCCTTACACAAGTTACGGTGATAAATATTGCGGGAATGACTTGTAATTCTTGTGCGCAGTCCATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACGTCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCAAGG   [680]
Mniger                          CATTGTTGCGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATCAAAAACCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCTCAAACCACTCAAGCTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATACCCAAACCAAAAGCTCAGAGGGAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGCATCTCGAACATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAGTTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACGTATAAAGTCAGCCTTCCTGATGAATATGAAGATGCAGAGCTTCTCAACACACAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAATGGCCCCTTACACAAGTTACGGTGATAAATATTGCGGGAATGACTTGTAATTCTTGTGGCCAGTCCATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCAAGG   [680]
Ppalpebrosus                    CATTGTTGTGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATCAAAAACCAAATTGAAGCTGTTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCTCAAACCACTTAAGCTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATACCCAAACCAAAAGCTCAGAGGCAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGTATGCACTGCAATTCATGCATCTCGAACATTCAGAGCACCATATCTGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAGTTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATTTAAAGTCAGCCTTCTTGATGAATATGAAGATGTAGAGCTTCTCAACACACAGTCATCTCCAGTAAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAATGGCCCCTTACACAAGTTACGGTGATAAATATTGAGGGAATGACTTGTAATTCTTGTGGGCAGTCCATTGAGGGATTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCAAGG   [680]
Ptrigonatus                     CATTGTTGTGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATCAAAAACCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCTCAAACCACTTAAGCTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATACCCAAACCAAAAGCTCAGAGGGAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGTATGCACTGCAATTCATGCATCTCGAACATTCAGAGCACCATATCTGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAGTTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATTTAAAGTCAGCCTTCTTGATGAATATGAAGATGTAGAGCTTCTCAACACACAGTCATCTCCAGTAAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAATGGCCCCTTACACAAGTTACGGTGATAAATATTGAGGGAATGACTTGTAATTCTTGTGGGCAGTCCATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCAAGG   [680]
Amississippiensis               CATTGTTGTGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATCAAAAACCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCTCAAACCACTCAAGCTGGGAGCTATTGATGTAGGACGTTTGAAGAATACCCACACCAAAAGCTCAGAGGGAATGCGGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGCGTCTCGAACATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAGTTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATTTAAAGTCAGCCTTTCTGATGAATATGAAGATGTAGAGCTTCTCAACACACAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAATGGCCCCTTACACAAGTTACTGTGATAAATATTGAGGGAATGACTTGTAATTCTTGTGGGCAGTCTATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCGAGG   [680]
Asinensis                       CATTGTTGTGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATCAAAAACCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCCCAAACCACTCAAGCTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATACCCACACCAAAAGCTCAGAGGGAATGCTACAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGCGTCTCGAACATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAGTTTCTTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATTTAAAGTCAGCCTTTCTGATGAACATGAAGATGTAGAGCTTCTCAACACACAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAATGGCCCCTTACACAAGTTACTGTGATAAATATTGAGGGAATGACGTGTAATTCTTGTGGGCAGTCCATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCGAGG   [680]
Crhombifer                      CATTGTTGTGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATAAAAAGCCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCCCAAACCCCTCAAGTTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATACCCACACTAAAAGCTCAGAGGGAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGTGTTTCAAATATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCARGCATAGTAATTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATTTAAAGTCAGCCTTCCTGATGAATATGAAAATGTAGAGCTTCTCAACACACAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAACGGCCCCTTACACAAGTTACTGTGATAAATATTGAGGGAATGACTTGTAATTCTTGTAGGGAGTCCATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATTGAGG   [680]
Crocodylus_acutus               ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Cintermedius                    CATTGTTGTGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATAAAAAGCCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCCCAAACCCCTCAAGTTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATACCCACACTAAAAGCTCAGAGGGAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGTGTTTCAAATATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCAAGYATAGTAATTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATTTAAAGTCAGCCTTCCTGATGAATATGAAAATGTAGAGCTTCTCAACACACAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAACGGCCCCTTACACAAGTTACTGTGATAAATATTGAGGGAATGACTTGTAATTCTTGTAGGGAGTCCATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCGAGG   [680]
Crocodylus_moreletii            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_siamensis            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_johnstoni            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_mindorensis          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_novaeguineae         ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_porosus              ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_palustris            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_niloticus            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Ccataphractus                   CATTGTTATGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATAAAAAACCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCCCAAACCCCTCAAGTTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATACCCACACTAAAAGCTCAGAGGGAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGTGTTTCAAACATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAATTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATTTAAAGTCAGCCTTCCTGATGAATATGAAAATGTAGAGCTTCTCAACACACAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAACAGCCCCTTACACAAGTTACTGTGATAAATATTGAGGGAATGACTTGTAATTCTTGTAAGGAGTCCATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCGAGG   [680]
Otetraspis                      CATTGTTGTGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATAAAAAACCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATCAAAAAACAGCCCAAACCCCTCAAGTTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATACCCACACTAAAAGCTCAGAGGGAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGTGTTTCAAACATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAATTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACWTTTAAAGTCAGCCTTCCTGATGAATATGAAAATGTAGAGCTTCTCAACACACAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAAATGGCCCCTTACACAAGTTACTGTGATAAATATTGAGGGAATGACTTGTAATTCTTGTAGGGAGTCCATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCGAGG   [680]
Tschlegelii                     CATTGTTGTGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATCAAAAACCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATAAAAAAACAGCCCAAACCCCTCAAGCTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAATACCCACACTAAAAGCTCAGAGGGAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGTGTTTCGAACATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAATTTCCTTGGAAAAKAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATTTAAAGTCAGCCTTCCTGATGAATATGAAAATGTAGAGCTTCTCAACACAAAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAGAAGGCCCCTTACACAAGTTACTGTGATAAATATTGAGGGAATGACTTGTAATTCTTGTAGGGAGTCCATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCAAGG   [680]
Ggangeticus                     CATTGTTGTGCATCAGCCTCACCTGATTACAGCAGAGGAAATCAAAAACCAAATTGAAGCTGCTGGTTTCACAGCATCTATAAAAAAACAGCCCAAACCCCTCAAGCTGGGAGCTATTGATGTGGAACGTTTGAAGAGTACCCACACTAAAAGCTCAGAGGGAATGCTGCAAAAAAGTCCAAAGCATATGAATGACTTAAAGACCATTGTTTTCAGAGTCAATGGCATGCACTGCAATTCATGTGTTTCGAACATTCAGAGCACCATATCCGCACTCCCATCTGTAGCAAGCATAGTAATTTCCTTGGAAAAGAAATCTGCTCTGGTAAAGTACAACCCAAACTTAATTCATGTGGATGCATTAAGAAGAGCCATAGAAGCAGTGTCACCAGAGACATTTAAAGTCAGCCTTCCTGATGAATATGAAAATGTAGAGCTTCTCAACACACAGGCATCTCCAGTGAA---------GTCCCCTTTAAATAGAAACAGAAGGCCCCTTACACAAGTTACTGTGATAAGTATTGAGGGAATGACTTGTAATTCTTGTAGGGAGTCCATTGAGGGAGTCATTTCCCAAAAGCCAGGTGTCAAATCAATACACATCTCCCTTGTGAATCATAATGGGACAATAGAATATGACCCTCTGCTAACCAGCCCAGAAGATTTAATATCTTCCATCAAGG   [680]
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extinct_taxon                   ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
extinct_taxon                   ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
extinct_taxon                   ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
extinct_taxon                   ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
extinct_taxon                   ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
extinct_taxon                   ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????

[18S_RFLP = 26]
Paleognathae                  ??????????????????????????
Neognathae                    ??????????????????????????
Testudines                    ??????????????????????????
Caiman_crocodilus_yacare      10000001000000110000100100
Caiman_latirostris            ??????????????????????????
Melanosuchus_niger            ??????????????????????????
Paleosuchus_palpebrosus       ??????????????????????????
Paleosuchus_trigonatus        ??????????????????????????
Alligator_mississippiensis    10000001000000000000100100
Alligator_sinensis            ??????????????????????????
Crocodylus_rhombifer          01100000101110111010011011
Crocodylus_acutus             01101010101110111010011011
Crocodylus_intermedius        01100010101110111010011011
Crocodylus_moreletii          01101010101110111010011011
Crocodylus_siamensis          01111000101110111010011011
Crocodylus_johnstoni          01100000101110111010011011
Crocodylus_mindorensis        01100001101111111010011011
Crocodylus_novaeguineae       01100001101111111010011011
Crocodylus_porosus            01111000101110111010011011
Crocodylus_p_palustris        01111001111110111010011011
Crocodylus_niloticus          01100001111110111010011011
Crocodylus_cataphractus       01100010101110111010011011
Osteolaemus_tetraspis         01100000001110110110011011
Tomistoma_schlegelii          10000110001100111111001011
Gavialis_gangeticus           10000110000100001111001011
extinct_taxon                 ??????????????????????????
extinct_taxon                 ??????????????????????????
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[28S_RFLP = 33]
Paleognathae                  ?????????????????????????????????
Neognathae                    ?????????????????????????????????
Testudines                    ?????????????????????????????????
Caiman_crocodilus_yacare      100000000010001110000000000000010
Caiman_latirostris            ?????????????????????????????????
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Alligator_mississippiensis    010000000010001110001000000100010
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Crocodylus_moreletii          ??1????00101100111011110?1??10001
Crocodylus_siamensis          001000000101000111000011010010001
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Crocodylus_novaeguineae       001001000101000111000111101100001
Crocodylus_porosus            001110010101100111000010010010001
Crocodylus_p_palustris        001100010101100111000111010010001
Crocodylus_niloticus          001001000101000111000010010100001
Crocodylus_cataphractus       001000000101000011000010110000001
Osteolaemus_tetraspis         001000000110000111000010001110000
Tomistoma_schlegelii          100000000101110001000100010101100
Gavialis_gangeticus           110000000100010001100100100101100
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[12SrDNA = 275]
Struthio_camelus       	GACTTGGCGGTGCCCTAAACCCACCTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAATCCACGATTCACCCAACCACCCCTTGC-C-------A---TGCAGCCTACATACCGCCGTCG--CCAG-CCCGCCTC-A--TGAGAGA-A-CA-ATAGCGAGCACAATAGC-C-----CA-CCC-GCTAACAAGACAGGTCAAGGTATAGCATA-TGGAGTGGAAGAAATGGGCTACATTTTCT-AACA--TAGAATAC-AAC-GA--AAGAGGA-TATGAAA
Gallus_gallus           GACTTGGCGGTGCCCCAAACCCACCTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAATCCACGATTCACCCAACCACCCCTTGC-C------AG---CACAGCCTACATACCGCCGTCG--CCAG-CCCACCTC-TAATGAAAGA-A-CA-ACAGTGAGCTCAATAGC-C-----C--CTC-GCTAATAAGACAGGTCAAGGTATAGCCTA-TGGGGTGGGAGAAATGGGCTACATTTTCT-AACA--TAGAA-CA-AAC-GA--AAAAGGA-TGTGAAA
Geochelone_yniphora    	GACTTGGCGGTGCCTCAAACCCTCCTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAATCCACGATTCACCCAACCATCTCTTGC-C------AA---TACCGCCTATATACCACCGTCA--TTAG-CCTACCCC-G--TGAAGGATA-TA-AAAGTAAGCAAAATAGCTA-A---C--AACAGCTAAAAAGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAACTGAGATGGAAGAAATGGGCTACATTTTCT-AA-AT-TAGGA-ATAATCTCACGGAAAGAACTATGAAA
Ccrocodilus         	GACTTGACAGTACTTCAAATCCACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGAAAGTACACGATTCACCTAACCACCCTTAGT-T-------A---TCCAGTTTGCATACCGCCGTCG--CAAGCTTGTCTCG-C--TGAGAGAAA-CA-AAATG-AGCACAATAGC-C-----C--C-CCGCTAAAACGTCAGGTCAACGCGCAGCTAA-TGGGGTGGGAAGGATGTGCTACATTTTCT-AACACATAGAA-AT-ACGTGACGGAACGTCCCGTGAAA
Clatirostris        	GACTTGACAGCACTTCAAATCCACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGAAAGTACACGATTCACCTAACCACCCCTAGTCT-------A---CCCAGTTTGTATACCGCCGTCG--CAAGCCTGTCTCG-C--TGAGAGAAA-CA-AAATG-GGCACAACAGC-C-T---C--CTAGGCTAAAACGTCAGGTCAACGTGCAACTAA-TGGGGTGGGAAGGATGTGCTACATTTTCT-AACACATAGAA-AT-ACGTGACGGAACGTCCCGTGAAA
Mniger              	GACTTGACAGCACTTCAAAACCACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGAAAGTACACGATCCACCTGACCACCCCTGGC-C-------C---TCCAGTCTGTATACCGCCGTCG--CAAGCTTGTCTCG-C--TGAGAGAAA-CA-AAATA-AGCACAACAGC-C-T---C--CCAGGCTAAAACGTCAGGTCAACGTGCAGCCAA-TGGGGTGGGAAGGATGTGCTACATTTTCT-AACACATAGAA-AT-AGGTAACGGAGCGTCCCATGAAA
Ppalpebrosus        	GACTTGACGGTACTTCGAACCCACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATTGAAGATACACGATTCACCTAACCCCTCCTTGC-C-------T---CTCAGTCTGTATACCGCCGTCGC-CAAACTCGTCCCA-C--TGAGGGAAA-CA-AAACA-AGTGCAACAGC-C-T---C--CCAGGCTAATACGTCAGGTCAAGGTGCAGCTAA-TGGAGCGGAAGAGATGTGCTACATTTTCT-AA-A-ATAGAA-AT-ACGTAACAGAACGCCCTCTGAAA
Ptrigonatus         	GACTTGACGGTACTTTAAACCCACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATTGAAGATACACGATCCACCTAACCCCTCCTAGC-C-------T---CTCAGTCTGTATACCGCCGTCG--CAAACTTGTCCCA-C--TGAAGGAAA-CA-AAACG-AGTACAACAGC-C-T---C--CCAGGCTAATACGTCAGGTCAAGGTGCAACTAA-CGGAGCGGAAGAGATGTGCTACATTTTCT-AA-A-ATAGAA-AT-ACGTAACAGAACGCCCTATGAAA
Amississippiensis   	GACTTGACGGCACTTTAAACCCCCCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGACAGTACACGTTACACCCGACCACCTTTAGC-C------TA---CTCAGTCTGTATACCGCCGTCG--CAAGCCCGTCCCATT--TGAGGGAAA-CA-AAACG-CGCGCAACAGCTC-A---A--CCGAGCTAACACGTCAGGTCAAGGTGCAGCCAA-CAAGGTGGAAGAGATGGGCTACATTTTCTCAACATGTAGAA-AT-ATTCAACGGAGAGCCCTATGAAA
Asinensis           	GACTTGACGGCGCTTCGAACCCACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGACGGTACACGATTCACCCGACCACCTCTAGC-C-------C---CTCAGCCTGTATACCGCCGTCG-CCAAGCCCGTCCCC-C--TGAGGGAGA-CA-AAACG-AGCACAATAGC-C-T---C--CCAGGCTAGCACGTCAGGTCAAGGTGCAGCCAA-TGAGGTGGAAGAGATGAGCTACATTTTCT-AACACATAGAA-AT-ATGCAACGGAGAGCCCTGTGAAA
Crhombifer          	GACTTGACGGTATTTCGAACCCACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGACAATACACGATCCACCCAACCACCTTTTGC-C-C----TA---AGCAGCCTGTATACCGCCGTCG--CAAG-CTTAGCCC-A--TGAGGGACA-AG-AACCT-AGCACAATAACTC-A-CTT--CTGAGCTAGTACGTCAGGTCAAGGTGCAGCCAA-TAAGTTGGTAGAGATGGGCTACATTTTCT-ACACCATAGAA-AT-TGGTCACGGAGAGGCCTGTGAAA
Cacutus             	GACTTGACGGTATTTCGAACCTACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGACAATACACGATCCACCCAACCACCTTTTGC-C-C----TA---AGCAGCCTGTATACCGCCGTCG--TAAG-CTTAGCCC-A--TGAGGGACA-AG-AACCT-AGCACAATAACTC-A-CTT--CTGAGCTAGTACGTCAGGTCAAGGTGCAGCCAA-TAAGTTGGTAGAGATGGGCTACATTTTCT-ACATCATAGAA-AT-TGGTCACGGAGAGGCCTGTGAAA
Cintermedius        	GACTTGACGGTATTTCGAACCCACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGACAATACACGATCCACCCAACCACCTTTTGC-C-C----TA---AGCAGCCTGTATACCGCCGTCG--CAAG-CTTAGCCC-A--TGAGGGACA-AG-AACCT-AGCACAATAACTC-A-CTT--CTGAGCTAGTACGTCAGGTCAAGGTGCAGCCAA-TAAGTTGGTAGAGATGGGCTACATTTTCT-ACATCATAGAA-AT-TGGTCACGGAGAGGCCTGTGAAA
Crocodylus_moreletii    ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Csiamensis          	GACTTGACGGTGTTTCGAACCCGCCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGACAACACACGATCCACCCAACCATCTTTTGC-C-C----TA---AACAGCCTGTATACCGCCGTCG--CAAG-CTTAGCCC-A--TGAGGGACA-AG-TACCT-AGCACAATAACTC-A-CTT--CTGAGCTAGTACGTCAGGTCAAGGTGCAGCCAA-TAAGTTGGTAGAGATGGGCTACATTTTCT-ACACTATAGAA-AC-CAGTCACGGAGAGGCCTGTGAAA
Crocodylus_johnstoni    ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_mindorensis  ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_novaeguineae ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_porosus      ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_palustris    ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_niloticus    ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Ccataphractus       	GACTTGACGGTATTTCGAACCCTCCTAGAGGAGCCTGTCCTGTAATCGACAATACACGATTAACCCAACCACCTTTTGC-C-T----TA---AACAGCCTGTATACCGCCGTCG--CAAG-CTTACCCC-T--TGAGGGATA-AA-TACCT-AGCGCAACAGCTC-A-TTT-ATTAAGCTAATACGTCAGGTCAAGGTGCAGCCAA-TAAGCTGGTAGAGATGGGCTACATTTTCC-ACACTATAGAA-AT-TAGTCACGGAGAGACCTGTGAAA
Otetraspis          	GACTTGACGGTATTTCGAATCCACCTAGAGGAGCCTGTCCTGTAATCGACAACACACGATTAACCCAACCACCTTTTGC-C-T----TA---AACAGCCTGTATACCGCCGTCG--CAAG-CTTACCCT-T--TGAGGGCTATAA-TATCT-AGCACAACAGCTCAATCTT--TTGAGCTAATACGTCAGGTCAAGGTGCAGCCAA-TAGGGTGGAAGAGATGAGCTACATTTTCT-ACAATATAGAA-AT-AAGTCACGGAGGGACCTGTGAAA
Tschlegelii         	GACTTGACGGTACTTCGCACCCACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGACAACACTCGATACACCCTACCAACTTTTGC-CTTAAACTACATAACAGCCTGTATACCGCCGTCG--CAAA-CTAACCCC-C--TGAGGGACG-AACAGTTA-AGTGCAACAGCTC-A---T--TTGAGCTAATACGTCAGGTCAAGGTGCAGCCAA-TAAGTTGGAAGAGATGGGCTACATTTTCT-ACCTCATAGAA-AT-ATGTCACGGAGAGCCCTGTGAAA
Ggangeticus         	GACTTGACGGTACTTCGCACCCACCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGACAGTACTCGATATACCTTACCAACTTTTGC-CTTAAACGTC-TAACAGCCTGTATACCGCCGTCG--CAAA-CTAGCCCC-C--TGAGGGACA-AACAATTT-AGTACAATAGCTT-A---T--TTGAGCTAATACGTCAGGTCAAGGTGCAGCCAA-TGAGTTGGAAGAGATGGGCTACATTTTCT-ACCACATAGAA-AT-ATGTCACGGAGAGCCCTGTGAAA
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[16SrDNA = 446]
Struthio_camelus        AAGGNAGCGCAATCAATTGTCCCATAAATCGGGACTTGTATGAATGGCTAAACGAGGTCTCAACTGTCTCTTGCAGATAATCAATGAAATTGATCTTCCTGTGCAAAAGCAGGAATATAAACATAAGACGAGAAGACCCTGTGGAACTTA-AAA--ACCAAGGATCA--A-TG----C-ACTC-C-C-AC--CCAAACCT-ACTAAGGCTCA-CCACTCCTG-C--AACCA-AC--TGA-TCCTCGTTTTTTGGTTGGGGCGACCTTGGAG-AAAA-AAGAATCCT-C-CA-AAA-ACA-AG--ACCAC-A--ACTCTTAACTAAGA--GCCACTCCTCAAAGTGCCAACA-GCGACCAGACCCAATATAA-TTGATTAATGGACCAAGCTACCCCAGGGATAACAGCGCAATCTCCTTCAAGAGCCCCTATCGACAAGGAGGTTT
Gallus_gallus           AAGGTAGCGCAATCAATTGTCCCGTAAATTGAGACTTGTATGAATGGCTAAACGAGGTCTTAACTGTCTCCTGTAGGTAATCTATGAAATTAGTATTCCCGTGCAAAAACGAGAATGTGAACATAAGACGAGAAGACCCTGTGGAACTTT-AAA--ATCAC-GACCA--CCTT-A--C-AACC-T-T-AC--ACAGCCCC-ACT-GGGTCCACCCACACAT--A--AA-CC-CC--TGG-TCGACATTTTTCGGTTGGGGCGACCTTGGAG-AAAA-AAAAATCCT-C-CA-AAC-CCACAG--ACCAC-A--ACTCTTCACTAAGA--CCAACTCCTCAAAGTACCAACA-GTAACCAGACCCAATATAA-TTGAGCAATGGACCAAGCTACCCCAGGGATAACAGCGCAATCTCCTCCAAGAGCCCATATCGACAAGGAGGTTT
Geochelone_yniphora    	AAGGTAGCGTAATCACTTGTCTTTTAAATAAAGACTAGAATGAACGGCCAAACGAGGCTTTACCTGTCTCTTACAAATAATCAGTGAAATTGATCTTCCTGTGCAAAAGCAGGAATAACATTATAAGACGAGAAGACCCTGTGGAACTTC-AAA--CATAA-AATCA--ACTG-T--C-ATCA-G-C-AT--ACA-CCAA-ACC-AGGCCTA--TACAAAA--C--AG-CA-CT--TGA-TTTTTA-CTTTCGGTTGGGGCGACCTCGGAG-TAAA-ACAAAACCT-C-CG--AA--AATAA--AGAAT-T--TCTTTAAACCTAGA--ATTACAAACCAAAGTGCTTCCA-GCAAAACGATCCAATATAT-TTGATCAACGAACCAAGCTACCCCAGGGATAACAGCGCAATCCCATTCTAGAGTTCCTATCGACGATGGGGTTT
Ccrocodilus         	AAGGTAGCGTAATCACTTGTTCTCCAAATAAGGACTAGTATGAACGGTTAAACGAGAATCTAACTGTCTCCTGCAAGCAGCCAATGAAATTGATCTTCCTGTGCAAAAGCAGGAATGACCCCACCAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTA-AAC-CCACTA-AGTTAA-ACCA-A--C-AACA-T-T-A---ACT-GC-A-AC--A--CCCA-CGAC-TGT--T--GA-AA-CC--TGACTTAACG-TTTTCGGTTGGGGTGACCCTAAAA-CAAAGAAAAACTTT-TAAGACAA-CTATAACTAAGCC-CGAATTATTAACCAAGA--CCCACCCCTCAAAGTACTTAAATGTAATTAGATCCGACA-ACGTCGATCAACGGACGAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCCTCAAGAGCTCATATCGACAGGGGGGTTT
Clatirostris        	AAGGTAGCGTAATCACTTGTTCTCTAAATAAGGACCAGTATGAATGGTTAAACGAGAATCTAACTGTCTCCTGCAAACAGCCAATGAAATTGATCTTCCTGTGCAAAAGCAGGAATAACATCACCAGACGAAAAGACCCTGTGAAACTTA-AAC-CACCTA-AGTTAA-ACCA-A--C-AATA---C-A---ACT-GT-A-AC--C--CCTA-CAAC-CGT--T--TA-CA-CC--TAACTTAGCG-TTTTCGGTTGGGGTGACCTTAAAA-CAAAAAAAAACTTT-TAAGACAA-CTATAACTAAGAC-CAAATTATTAACCAAGA--CCCACACCTCANAGTACTTAAATGTAATTAGATCCGACA-ACGTCGATCAACGAACAAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCCTCAAGAGCCCATATCGACAGGGGGGNNN
Mniger              	AAGGTAGCGTAANCACTTGTTCTCTAAATAAGGACCGGTATGAATGGTNAAACGAGAATCTAACTGTCTCCTGCAAGNNNCCAATGAAATTGATCTCCCTGTGCAAAAGCAGGAATAATATCACCAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTA-AAC-CCACTA-AGTTAC-ACCA-A--C-AGCA-T-A-A---ACT-GC-A-AC--A--CCCA-CGAC-CGT-CT--TG-TA-CC--TAACTTARCG-TTTTCGGTTGGGGTGACCCTAAAA-CAAAGAAAAACTTT-TAAGACAA-CCATAACTAAGAC-CAAACTATTAACTAAGA--CCTACATCTCAAAGTGCTTAAATGTAATTAGATCCGACA-ATGTCGATCAACGAACAAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCTCCCTCAAGAGCCCATATCGACAGGGGGGTTT
Ppalpebrosus        	AAGGTAGCGTAATCACTTGTTCTTTAAATAAGGACTAGTATGAACGGCTAAACGAGAATCTAACTGTCTCCTGCAAGGAGCCAATGAAATTGATCTTCCTGTGCAAAAGCAGGAATACTACCACCAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTA-AAT-CAGCTA-AGTCAC-ACCA-A--C-AACA-C-C-A---ACT-AC---A---A--CCCA-CGAC-CAC--C--AT-CA-CC--TGACCTAGCG-CTTTCGGTTGGGGCGACCTTAAAA-CAAAGAAAAACTTT-TAAGACAACCCATAGCAAAG-T-TAGACCATTAACTAAGA--ACCACACCTCAAAGTACTTAAATGTAATTAGATCCGACA-ATGTCGATCCACGAACCAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCCTCAAGAGCCCCTATCGACGGGGGGGTTT
Ptrigonatus         	AAGGTAGCGTAATCACTTGTTCTTTAAATAAGGACCAGTATGAACGGCTAAACGAGAATCTAACTGTCTCCTGCAAGCAACCAATGAAATTGATCTCCCTGTGCAAAAGCAGGAATAATATCACCAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTA-AAC-CAGCTA-AGTCAC-ACCA-A--C-AACA-C-CAA-CCACA-AC---A---A--CCCA-CGTC-CAC--C--AC-TA-CT--TGACTCAGCG-CTTTTGGTTGGGGCGACCTTAAAA-CAAAGAAAAACTTT-TGAGACAACCCATAGCAAAG-T-TAGACTATTAACCAAGA--ACTACACCTCAAAGTGCTTAAATGTAATTAGATCCGACA-ATGTCGATCCACGAACCAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCCTCAAGAGCCCCTATCGACAGGGGGGTTT
Amississippiensis   	AAGGTAGCGTAATCACTTGTTCTCCAAATAAGGACCAGTATGAACGGCTAAACGAGAATCTAACTGTCTCCTGCAAGCAACCAATGAAATTGATCTCCCTGTGCAAAAGCAGGAATGACCCCACCAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTT-AAC-CGACTA-AGTCAC-A-C--A--CTAGGA-A-C-A---A-C-AC---A---A--CCCA-CAAC-CAC--CT-TA-AACCCA-TGACTTAGCG-CTTTTGGTTGGGGTGACCCTAAAA-CAAAAAAAAACTTT-TAAGACAA-TCATAACAAAA-T-TAGACTATTAACTAAGA--CCCACACCTCAAAGTACTTAACTGTAATTAGATCCGACA-ATGTCGATCCACGAACTAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCTTCAAGAGCCCCTATCGACAAGGGGGTTT
Asinensis           	AAGGTAGCGTAATCACTTGTTCTTTAAATAAGGACCAGTATGAACGGCTAAACGAGAGTCTAACTGTCTCCTGCAAGCAGCCAATGAAATTGATCTTCCTGTGCAAAAGCAGGAATAGCCCCACCAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTT-AAT-CGGCTA-AGTCAT-A-C--A--C-ACAA-C-T-A---ATA-AT---C---A--CCCA-TAAT-TAC--C--TG-GA-CCG-TGACTTAGCG-TTTTTGGTTGGGGTGACCTTGAAA-CAAAGAAAAACTTT-TAAGAAAG-CTATAACAAAG-TAGCCAGTATCCACTGAGACCCCCACACCTCAAAGTACTTAAATGTAATTAGATCCGACA-ACGTCGATCCATGAACCAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCTTCAAGAGCCCCTATCGACAGGGGGGTTT
Crhombifer          	AAGGTAGCGTAATCATTTGTTCTTTAAATAAGGACCAGTATGAAGGGCTAAACGAGAATCTATCTGTCTCTTGCAGAAGGCCAGTGAAATTGATCTCCCTGTGCAAAAGCAGGGATGTCAACATTAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTT-AAA-CCACTA-AATCACAAAAAATTGT-AAAATC-T-C---ACC-CCAA-GC--GGGCTGA-CTAC-AAT--T--AG-CA-CG-TTGATTTAGCG-TTTTCGGTTGGGGCGACCCCAAAA-TAAA-AAAAACTTTCCAGGAAAA-CAGTAAC-ATGAC-A--ATTACTAACCAAGA--CCCACACCACAAAGTGCTTAAATGTAATCAGATCCGGCACACGCCGATTCATGAACCAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCTTCAAGAGCCCGTATCGACAAGGGGGTTT
Crocodylus_acutus       ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Cintermedius        	AAGGTAGCGTAATCATTTGTTCTTTAAATAAGGACCAGTATGAAAGGCTAAACGAGAATCTATCTGTCTCTTGCAGAAGGCCAGTGAAATTGATCCCCCTGTGCAAAAGCAGGGATGTCAACATTAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTT-AAA-CCACTA-AATCACAAAAAGTTGT-AAAATA-T-C---ACC-CCAA-GC--GGGCTGA-CTAC-AAT--T--AG-CA-CA-TTGATTTAGCG-TTTTCGGTTGGGGCGACCCCAAAA-TAAA-AAAAACTTTCCAGGAAAA-CAGTAAC-ATGAC-A--ACTACTGACCAAGA--CCCACACCACAAAGTGCTTAAATGTAATCAGACNNNGCACACGCCGATTCATGAACTAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCTTCAAGAGCCCCTATCGACAAGGGGGTTT
Crocodylus_moreletii    ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_siamensis    ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_johnstoni    ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_mindorensis  ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_novaeguineae ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_porosus      ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_palustris    ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_niloticus    ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Ccataphractus       	AAGGTAGCGTAATCATTTGTTCTTTAAATAAGGACCAGTATGAACGGCTAAACGAGAATCCATCTGTCTCTTGCAGAAGGCCAGTGAAATTGATCTCCCTGTGCAAAAGCAGGGATATTAACATTAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTT-AAA-CTACTA-AATTACAACAAGTTGT-AAAA-C-A-C---ACA-CTAA-ACT-AGCCCAA-CTAC-TAT--T--AA-TA-TG-TTGATTTAGCG-TTTTCGGTTGGGGCGACCCCAAAA-TAAA-AAAAACTTTCCAGGAAAA-TTGTAGC-ATGAT-T--ACTACTGACTAAGG--CCCACACCACAAAGTGCTTAAATGTAATCAGATCCGGCACACGCCGATTTATGAACCAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCCTCAAGAGCCCTTATCGACAGGGGGGTTK
Otetraspis          	AAGGTAGCGTAATCATTTGTTCTTTAAATAAGGACTGGTATGAAAGGCTAAACGAGAATCTATCTGTCTCTTGCAGAAGGCCAGTGAAATTGATCTCCCTGTGCAAAAGCAGGGATTTTAACATCAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTTCAAA-CTCCTG-AACCATAATTA--ACT-AAAA-T-T-T---TCC-CTAA-ACT-AGCCCCA-CTAT-CAC--T--AA-TG-CC-TTGGCTCAGAG-TTTTCGGTTGGGGCGACCCCAAAACAAAA-AAAAACTTTACAGGAAAA-TTGTAAC-A-CA-----ACCACTTACTAAGG--CCCACACTACAAAGTGCTTAAATGTAATCAGATCCGGCACACACCGATTTATGAACCAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCCTCAAGAGCCCTTATCGACAGGGGGGTTT
Tschlegelii         	AAGGTAGCGTAATCACTTGTTCTTTAAATGGGGACTAGTATGAAAGGCTAAACGAGAGTCCATCTGTCTCTTGCAGGCAGCCAATGAAATTGATCTCCCTGTGCAAAAGCAGGGATTTACACATCAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTT-AAACCCCCTA-GGCCACAACAA-ATGT-AATC-CTT-T---TCC-CCAACCCG-GGGCCAA-CTAC-CAT--T-AAA-AC-TA-TTGACCTAGTG-TTTTCGGTTGGGGCGACCCCAAAA-TAAA-AAAAACTTTCCTGGAAAA-CAGTAAC-ATAAC-T--ACTACTAACTAAGA--CCTACACCCCAAAGTGCTTAAATGTAATCAGATCCGGCATGCACCGATCTATGGACCAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCCTCAAGAGCCCCTATCGACAGGGGGGTTT
Ggangeticus         	AAGGTAGCGTAATCACTTGTTCTTTAAATAAGGACCAGTATGAAAGGCTAAACGAGAATCCATCTGTCTCTTGCAGGCAGCCAATGAAATTGATCTCCCTGTGCAAAAGCAGGGATTCATACATTAGACGAGAAGACCCTGTGAAACTTT-AAA-CCCCTA-GGCCACAACAA-ATGT-AA-C-C-T-A---AAC-CC-A-CAT-AGGCCCA-CTAT-CAT--T-AGA-CC-CC-TTGACCTAGTG-TTTTCGGTTGGGGCGACCCCAAAA-TAAA-AAAAACTTTCCCGGAAAA-CAGTAAC-ATGAC-T--ACTACTAACTAAGA--CCTACACCCCAAAGTGCTTAAATGTAATCAGATCNNNCA-AAGCCGATCTATGAACCAAGCTACTCCAGGGATAACAGCGCAATCCCCCTCAAGAGCCCTTATCGACAGNNGRGNTT
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[DLoop = 301]
Paleognathae            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Neognathae              ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Testudines              ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Ccrocodilus         	CATCCCCCCACTTGAATTAATCCTCATGTGGTTGGAGTTCTTGTTATCCGCGTC-ATCTTTTGTTCGGTACTCACTGTTACTAGTTTCAAGCCCATACCTGGACACGGCTTCCATGTATTGCT-TTTTAAGAGGCCTCTGGTTATCACTCTCACGTACCTATCTTGCGATTGCCTGGACATTCGTTCCTCTTCTTCGAGGCCTCAACCCGCACCGTCTTGGTAAC-CACTCATTCAAGTCCGTGATCGCGGCATCTCCA-TTCTCAAAT-GCATTTGGTTGGATTTTTATTTTTTGGGGGA
Caiman_latirostris      ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Melanosuchus_niger      ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Paleosuchus_palpebrosus ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Paleosuchus_trigonatus  ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Amississippiensis   	CATCCTCCCATGTGAATTAACCCACATAT-ATTAAAATTCTTGTTATTCGCGTCAATTTTTCGTTCAGCACTAACTGTTACTAGTTTCAAGCCCATAACTGAATACCACTTCCATAAATTGCT-TTTTAAGAGGCCTCTGGTTATCACTCTCATGTATATGTCTTGCGATTGCCTGAACATTCGTTTCTCTTCTTAGAGACCTCAACCCGCACCGTCTTGGTCAC-CACCCA-TTAAATCCGTAATCTCAACATCACCAGCTCTCCAGT-CCATTTGGTAAGGATTTTATTTTTTTGGGGA
Asinensis           	CATCCCCCCACTCAGATTGGTCCACTG-T-ACAGGGGTTCTCGCTATCCGCGTC-ATCTTTCGTTCAGTACTAACTATTACTAGCTTCAAGCTCATACCTGGACACGGCTTCCATGTATTGCT-TTTTAAGAGGCCTCTGGTTATCACTCTCACGTCCATATCTTGCGATTGCCTGGACATTCGTCCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCGTCTTGGTCTC-CACTCATTTTTGTCCGTGATCGCGGCATCTCCAGCT-T-GAGC-ACATTTAGT-GGATTTTTATTTTTTGGGGGA
Crhombifer          	CATCCATTAGTTCTTATTAGTCAGCAT-C-TCACGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATCCA-TACTAACTATTACTACTCTCAAGCCCATACCTGGACACGGCTCACATTTATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTACCCATCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCAT-ATGGCTT--CACTCATTCACGTCCGTAATCGCGGCATCCCTTTTC-T-TCA--ATGGCTATT-GGTTCTTTATTTTTTTGGGGA
Cacutus             	CATCCATTAGTTCTTATTAATCAGCAT-C-TCACGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATCCA-TACTAACTATTACTAGTCTCAAGCCCATACCTGGACACGGCTCACATTCATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTACCCATCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCAT-ATGGTTT--CACTCATTCACGTCCGTGATCGCGGCATCCCCTTTT-T-TCA--ATTGCTATT-GGTTCTTTATTTTTTTGGGGA
Cintermedius        	CATCCATTAGTTCTTATTAATCAGCAT-C-TCACGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATCCA-TACTAACTATTACTAGTCTCAAGCCCATACCTGGACACGGCTCACATTCATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTACCCATCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCAT-ATGGTTT--CACTCATTCACGTCCGTGATCGCGGCATCTCC-TTT-T-TCA--ATTGCTATT-GGTTCTTTATTTTTTTGGGGA
Cmoreletii          	CATCCACTAGTTCTTATTAATCAGCAT-C-TCACGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATCCA-TACTAACTATCACTAGTCTCAAGCCCATACCTGGACACGGCTCACATTCATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTACCTATCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCAT-ATGGTTT--CACTCATTCACGTCCGTGATCGCGGCATCTCCTTTT-T-TCA--ATTGCTATT-GGTTCTTTATTTTTTTGGGGA
Csiamensis          	CATCCATTAGTTCTTATTAATCAGCAT-C-TCACGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATCCA-TACTAACTATTACTAGTCTCAGGCCCATACCTGGACACGGTTCACATTTATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTACCCATCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCGT-ATGGTTT--CACTCATCCTCGTCCGTGATCGCGGCATTCCTATTT-T-TCA--ATTGCTATT-GGTTCTTTATTTTTTTGGGGA
Cjohnstoni          	CATCCATTAGTTCTTATTAATCAGCAT-C-TCACGTGAAATCAGCAT---C--C-AT-TGT-ATCCA-TACTAACTATTACTAGTCTCAGGCCCATACCTGGACACGGTTCACATTTATTGCTCTTCTTAGAGGCCTCTGGTTATCACTCTCACGTACTCATCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCAT-ATGGTTT--CACTCATTTAGATTCGTGACCCCGGCATCTCTATTC-T-TCA--ATTGCTATT-GGTTCTTTATTTTTTTGGGGA
Cmindorensis        	CATCCATTAGTTCTTATTAATCAGCAT-C-TCACGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATCCA-TACTAACTATTACTACTCTCAAGCCCATACCTGGACACGGCTCACATTTATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTACCCATCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCGT-ATGGTTT--CACTCATTTATATTCGTGATCCCGGCATCCCCATTC-T-TCA--AGTGCTATT-GGTTCTTTATTTTTTTGGGGA
Crocodylus_novaeguineae ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Cporosus            	CATCCATTAGTTCTTATTAATCAGCAT-C-TCATGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATCCA-TATTAATTATTACTAGTCTCAAGCCCATACCTGGACACGGCTCACATTTATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTACTCATCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCAT-ATGGTTT--CACTCATTTACGTCCGTGATCGCGGCATTTCTATTT-T-TTG--ATTGCTATT-GGTTCTTTATTTTTTTGGGGA
Cpalustris          	CATCCATTAGTTCTTATTAATCAGCAT-C-TCACGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATCCA-TACTAACTATTACTAGTCTCAGGCCCATACCTGGACACGGCTCACATTTATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTACCCATCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCAT-ATGGTTT--CACTCATCTACGTCCGTGATCGCGGCATTCCTATTC-T-TTG--ATTGCTATT-GGTTCTTCATTTTTTTGGGGA
Cniloticus          	CATCCACTAGTTCTTATTAATCAGCAT-C-TCACGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGC-ATCCA-TACTAACTATTACTAGTCTCAAGCCCATACCTGGACACGGTTCACATTTATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTACCCATCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCAT-ATGGCTT--CACTCATTTAAATCCGTGATCGCGGCATCCC-ATTT-T-TCA--ATTGCTATT-GGTTCTTTATTTTTTTGGGGG
Ccataphractus       	CATCCAATAGTTTTTATTAATCAGCAT-C-TCTCGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATCCA-TACTAACTATTACTAGTNTCAAGCCCATACCTGGACACGGCTCACATTCATTGCTCTTCTTAGAGACCTGTGGTTATCACTCTCACGTACCCCTCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTTTTAGAGGCCTCAACCCGCACCAT-ATGGTTT--CACTCATTTTCGTCCGTGATCGCAGCATNTAAATTC-T-TTC--ATAACTATT-GGTTATTTCTTTTTTTGGGGA
Otetraspis          	CATCCATTAGTTATTATTAATCACCAT-C-TCTCGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATACA-TACTAACTATTACTAGTCTCAAGCCCATACCTGGACACGGCTCACATATATTGCTCTTCTTGGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTTCCCTTCTTGCTATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCGG-ATGGTGT--CACTCATTTAAGTCCGTGATCCCGGCATTCCAATTC-T-TTC-AAGTGCTATT-GGTTCTTTATTTTTTTGGGGA
Tschlegelii         	CATCCTCTAGTTCTTATTAATCAACAC-C-TCCCGTGAAATCATCAT---C--C-AT-TGT-ATTCA-TACTAACTCTTACTAGTCTCAAGTCCATATCTAGATA-TACTCACATTCATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCATGTACTCTTCTTGCAATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTAGAGGCCTCAACCCGCACCAT-ATGGTGT--CACTCATTTTAATTCGTAATCCCGGCATCTCTATTT-T-TAT--ATTGCTATT-GGTTCTTCATTTTTTTGGGGA
Ggangeticus         	CATCCCTTAGTTCTTATTGATCAGCAT-C-TCTCGTGAAATCACCAT---C--C-AT-TGT-ATTCA-TACTAACTCTTACTAGTCTCAAGTCCATAACTGGACACGGTTCACATTCATTGCTCTTCTTAGAGACCTCTGGTTATCACTCTCACGTACCCTTCTTGCGATTGCCTGGACATTCTTTCCTCTTCTTCGAGACCTCAACCCGCACCGT-ATGGTCT-CCACTCATTCAAGTCCGTGATCGCAGCATCT-TCTTT-C-TTG--ATTGCTATT-GGTTCTATCTTTTTTTGGGGA
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extinct_taxon           ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????

[LDH-A = 637]
Paleognathae                ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Neognathae                  ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Testudines                  ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Caiman_yacare               ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
C_latirostris               GTAGGCAGCAGTTTATCAACATGAAAGGAACAGGTCTGTTTTTAAGACCTAAACATGTATTCTTGTAATGGTAAC--TGCCCACAACTACATTATTCAGCAATACAGATGAAATCAAATTAATAACTAACTTGATGGTTTTTGCTGTCTCTACCCTCTCCCCCTGGCTTGTACCAGGGCTGTCAAACTTTTGTGCAGCTGGGGACCCCAGATCCTTCCCCTGCTACATGTACAACATTCTCCTKGCCTGCAGGAAAGGGGGCAGGAACCAGAAGCCAGAGGAGGGAGGGGGAGTCTGGAGATGCCAGCAGCTGCCTTCAGAGCACTGGAC-AAAGCAGTCACTGGGCAGGAACCTGTAGGCAGCATTTAAACCCCTCACAGGCCACTAGTTTGATGTTTGACAGCCCTAGTTTAAACTTCAGTCCTGCTGTCATCATTGACCTAGAGCAGTGAACTTGCTGCTTGCAAAATATACTGTAACCCAAGGCATGTGGAACTATGGATTCCAGTCACTAAGAAAATGAAGTAATATCCTTCTTCCTTTT-CAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCCTAAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGTATTACAGATGTAGTGATGATGACTC   [633]
M_niger                     GTAGGCAGCAGTTTATCAACATGAAAGGAACAGGTCTGTTTTTAAGACCTAAACATGTATTCTTGTAATGGTAAC--TGCCCACAACTACATTATTCAGCAATACAGATGAAATCAAATTAATAACTAACTTGATGGTTTTTGCTGTCTCTACCCTCTCCCCCTGGCTTGTACCAGAGCTGTCAAACTTTTGGGCAGCTGGGGACCCCGGATCCTTCCCCTGCTACATGTACAACATTCTCCTTGCCTGCAGGAAGGGGGGCAGGAACCAGAAGCCAGAGGAGGGAGGGGGAGTCTGGAGATGCCAGCAGCTGCCTTCAGAGCACTGGAC-AAAGCAGTCACTGGGCAGGAACCTGTAGGCAGCATTTAAACCCCTCACAGGCCACTAGTTTGATGTTTGACAGCCCTAGTTTAAACTTCAGTCCTGCTGTCATCATTGACCTAGAGCAGTGAACTTGCTGCTTGCAAAATATACTGTAACCCAAGGCATGTGGAACTATGGATTCCAGTCACTAAG---------TAATATCCTTCTTCCTTTT-CAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCCTAAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGTATTACAGATGTAGTGATGATGACTC   [624]
Ppalpebrosus                GTAGGCAGCAGTTTATCAACATGAAAGGAACAGGTCTGTTTTTAAGACCTAAACATGTATTCTTGTAATGGTAACTATGCCCACAACTACATTATTCAGCAATACAGATGAAATCAAATTAATAACTAACTTGATGGTTTTTGCTGTCTCTACCCTCTCCCCCTGGCTTGTACCAGGGCTGTCAAACTTTTGGGTAGCTGGGGACCCCGGATCCCTCCCCTGCTACATGTACAACATTCTCCTTGCCTGCAGGAAAGGGGGCAGGAACCAGAAGCCAGAGAAGGGAGGGGGAGTCTGGAGATGCCAGCAGCTGCCTTCAGAGCACTGGAC-AAAGCAGTCACTGGGCAGGAACCTGTAGGCAGCATTTAAACCCCTCACAGGCCACTAGTTTGATGTTTGACAGCCCTAGTTTATACTTCAGTCCTGCTGTCATCATTGACCTAGAGCAGTGAACCTGCTGCTTGTAAAATATACTGTAACCCAAGGCCTGTGGAACTATGGATTCCAGTCACTAAGAAAATGAAGTAATATCCTTCTTCCTTTT-CAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCCTAAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGTATTACAGATGTAGTGATGATGACTC   [635]
P_trigonatus                GTAGGCAGCAGTTTATCAACATGAAAGGAACAGGTCTGTTTTTAAGACCTAAACATGTATTCTTGTAATGGTAACTATGCCCACAACTACATTATTCAGCAATACAGATGAAATCAAATTAATAACTAACTTGATGGTTTTTGCTGTCTCTACCCTCTCCCCCTGGCTTGTACCAGGGCTGTCAAACTTTTGGGTAGCTGGGGACCCCGGATCCCTCCCCTGCTACATGTACAACATTCTCCTTGCCTGCAGGAAAGGGGGCAGGAACCAGAAGCCAGAGAAGGGAGGGGGAGTGTGGAGATGCCAGCAACTGCCTTCAGAGCACTGGAC-AAAGCAGTCACTGGGCAGGAACCTGTAGGCAGCATTTAAACCTCTCACAGGCCACTAGTTTGATGTTTGACAGCCCTAGTTTATACTTCAGTCCTGCTGTCATCATTGACCTAGAGCAGTGAACCTGCTGCTTGTAAAATATACTGTAACCCAAGGCCTGTGGAACTATGGATTCCAGTCACTAAGAAAATGAAGTAATATCCTTCTTCCTTTT-CAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCCTAAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGTATTACAGATGTAGTGATGATGACTC   [635]
Alligator_mississippiensis  ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
A_sinensis                  GTAGGCAGCAGTTTATCAACATGAAAGCAACAGGTCTGTTTTTAAGACCTAAATATGTATTCCTGTAATGGTAACAATGCCCACAACTACATTATTCTGCAATACAGATGAAATCAAACTAATAACTACCTTGATGGTTTTTGCTGTCTCTGCCCCCTCCCCCTGGCTTATATCAGGGCTGTCAATCTTTTGGGCAGCTGGGGACCCTGGCTCCCTCCCCTGCTACATGCACAACATTCTCCTTGCCTGCAGGAAAGGGGGCAGGAACCAGAAGCCAGAAGAGGGAGAGGGAGTCTGGAGATGCCAGCAGCTGCCATCAGAGCACTGGACCAAAGCGGTCACTGGGCAGGAACCTGTAGGCAGCATTTAAACCCCTCACAGGCCACTAGTTTGATGTTTGACAGCCCTGGTTTATACTTCAGTCCTGCGGTCATCATTGGCCTAGAGCAGTGAACCTGCTGTTTGTAAAATATACTGTAACCCAAGGCATGTGGAATTATGGAATTCAGTCACTAAGAAAATGAAGTAATATCCTTCTTCCTTTTTCAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCTTAAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGTATTACAGACGTAGTGATGATGACTC   [637]
C_rhombifer                 GTAGGCAGCAGTTTATCAACGTGAAAGCAACAGGTCTGTTTTTAAGACCTAAATATGTATTTCTATAATGGTGACAATGCCCACAACTACATTATTCTGCAATACAGATGAAATCAAACTAATAATTAACTTGATGGTTTCTGTTGTCTCTGCCCCTGCTCCCTGGCTTATACCAGGGCTGTCCAATTTTTGGGCAGCTGGGGGCCCTGGCTCCCTCCCCTGCTACATGCACAACATTCTCCTTGCCTGCAGGAAAGTGGGCAGGAACCATCAGCCAAAGGAGGGAGGGGTAGTTTGGAGATGCCAGCAGCTGCCCTCAGCGCACTGGAC-AAAGCGATCACTGGGCAGGAACCTGTAGGCAGCATTTAAACCTATCACAGGCCACTAGTTTGATGTTTGACAGCCCTGGGTTATACTTCAGTCCTGCTGTCATCATTGGCCTAGAGCAGTGAACCTGTTACTTATA-------CTGTAACCCAAGGTGTGTGGAACTATGGAATCTAGTCACAATGAAAATGAAGTAACATCCTTCTTCCTTTT-CAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCCTCAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGCATTACAGATGTAGTGATGATGACTC   [628]
Crocodylus_acutus           ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
C_intermedius               GTAGGCAGCAGTTTATCAACATGAAAGCAACAGGTCTGTTTTTAAGACCTAAATATGTATTTCTATAATGGTGACAATGCCCACAACTACATTATTCTGCAATACAGATGAAATCAAACTAATAATTAACTTGATGGTTTCTGTTGTCTCTGCCCCTGCTCCCTGGCTTATACCAGGGCTGTCCAATTTTTGGGCAGCTGGGGGCCCTGGCTCCCTCCCCTGCTACATGCACAACATTCTCCTTGCCTGCAGGAAAGTGGGCAGGAACCATCAGCCAAAGGAGGGAGGGGTAGTTTGGAGATGCCAGCAGCTGCCCTCAGAGCACTGGAC-AAAGCGATCACTGGGCAGGAACCTGTAGGCAGCATTTAAACCTATCACAGGCCACTAGTTTGATGTTTGACAGCCCTGGGTTATACTTCAGTCCTGCTGTCATCATTGGCCTAGAGCAGTGAACCTGTTACTTATA-------CTGTAACCCAAGGTGTGTGGAACTATGGAATCTAGTCACAATGAAAATGAAGTAACATCCTTCTTCCTTTT-CAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCCTCAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGCATTACAGATGTAGTGATGATGACTC   [628]
Crocodylus_moreletii        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_siamensis        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_johnstoni        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_mindorensis      ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_novaeguineae     ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_porosus          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_palustris        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Crocodylus_niloticus        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
C_cataphractus              GTAGGCAGCAGTTTATCAACATGAAAGCAACAG-TCTGTTTTTAAGACCTAAATATGTATTTCTGTAATGGTAACAATGCCCACAACTACATTATTCTGCAATACAGATGAAATCAAACTAATAATTAACTTGATGGTTTCTGCTGTCTCTGCCCCCGCTCCCTGGCTTATACCAGGGCTGTCCAATTTTTGGGCAGCTGGGGGCCCTGGCTCCCTCCCCTGCTACATGCACAACATTCTCCTTGCCTGCAGGAAAGTGGGCAGGAACCATCAGCCAAAGGAGGGAGGGGTAGTTTGGAGATGCCAGCAGCTGCCCTCAGAGCACTGGAC-AAAGCGATCACTGGGCAGGAACCT-------------------ATCACAGGCCACTAGTTTGATGTTTGACAGCCCTGGGTTATACTTCAGTCCTGCTGTCATCATTGGCCTAGAGCAGTGAACCTGTTACTTATAAAATATACTGTAACCCAAGGCGTGTGGAACTATGGAATCTAGTCACAATGAAAATGAAGTAACATCCTTCTTCCTTTT-CAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCTTAAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGCATTACAGACGTAGTGATGATGACTC   [615]
O_tetraspis                 GTAGGCAGCAGTTTATCAACATGAAAGCAASAG-TCTGTTTTTAAGACCTAAATATGTATTTCTGTAATGGTAACAATGCCCACAACTACATTATTCTGCAATACAGATGAAATCAAACTAATAATTAACTTGATAGTTTCTGCTGTCTCTGCCCCCGCTCCCTGGCTTATACCAGGGCTGTCCAATTTTTGGGCAGCTGGGGGCCCTGGCTCCCTCCCCTGCTACATGCACAACATTCTCCTTGCCTGCAGGAAAGTGGGCAGGAACCATCAGCCAAAGGAGGGAGGGGTAGTTTGGAGATGCCAGCAGCTGCCCTCAGAGCACTGGAC-AAAGCGAGCACTGGGCAGAAACCTGTAGGCAGCATTTAAACCTATCACAGGCCACTAGTTTGATGTTTGACAGCCCTGGGTTATACTTCAGTCCTGCTGTCATCATTGGCCTAGAGCAGTGAACCTGTTACTTATAAAATATACTGTAACCCAAGGCGTGTGGAACTATGGAATCTAGTCACAATGAAAATGAAGTAACATCCTTCTTCCTTTT-CAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCCTAAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGCATTACAGACGTAGTGATGATGACTC   [634]
T_schlegelii                GTAGGCAGCAGTTTATCAACATGAAAGCAACAGGTCTGTTTTTAAGACCTAAATATGTATTCCTGTAATGGTAACAATGCCCACAACTACATTATTCTGCAATACAGATGAAATCAAACTAATAATTAACTTGATGGTTTCTGCTGTCTCTGCCCCCTCTCCCTGGCTTACACCAGGGCTGTCCAGCTTTTGGGCAGCTGGGGGCCCTGGCTCCCTCCCCTGCTACATGCACAACATTCTCCTTGCCTGCAGGAAAGTGGGCAGGAACCTGAAGCCAAAGGAGGGAGGGGGAGTCTGGAGATGCCAGCAGCTGCCCTCAGAGAACTGGAC-AAAGCGATCACTGGGCAGGAACCTGTAGGCAGCATTTAAACCTCTCACAGGCCACTAATTTGATGTTTGACAGCCCTGGCTTATACTTCAGTCCTGCTGTCATCATTGGCCTAGAGCAGTGAACCTGTTACTTATAAAATATACTGTAACCCAAGGCGTGTGGAACTATGGAATCCAGTCACAATGAAAATGAAGCAATATCCTTCTTCCTTTT-CAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCCTAAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGCATTACAGACGTAGTGATGATGACTC   [635]
G_gangeticus                GTAGGCAGCAGTTTATCAACATGAAAGCAACAGGTTTGTTTTTAAGACCTAAATATGTATTCCCGTAATGGTAACAATGCCCACAACTACATTATTCTGCAATACAGATCAAATCAAACTAATAATTAACTTGATGGTTTCTGCTGTCTCTGCCCCCTCTCCCTGGCTTACACCAGGGCTGTCCAACTTTTGGGCAGCTGGGGACCCTGGCTCCCTCCCCTGCTACATGCACAACATTCTCCTTGCCTGCAGGAAAGTGGGCAGGAACCAGAAGCCAAAGGAGGGAGGGGGAGTCTGGAGATGCCAGCAGCTGCCCTCAGAGAACTGGAC-AAAGCGATCACTGGGCAGGAACCTGTAGGCAGCATTTAAACCTCTCTCAGGCCACTAATTTGATGTTTGACAGCCCTGGCTTATACTTCAGTCCTGCTGTCATCATTGGCCTAGAGCAGTGAACCTGTTACTTATAAAATATATTGTAACCCAAGGCGTGTGGAACTGTGGAATCCAGTCACAATGAAAATGAAGTAATATCCTTCTTCCTTTT-CAGGGCATGTATGGAATAAAAGATGATGTCTTCCTAAGTGTCCCTTGTGTGTTGGGATACCATGGCATTACAGACGTAGTGATGATGACTC   [635]
extinct_taxon               ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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[chromosomes = 3; nest = 1 (#107-110 of Poe, 1996)]

[chromosome morphology/number 14 states, satellited submetacentric 0 = absent, 1=present, secondary constriction telocentric 0=absent, 1=present (Cohen and Gans, 1970)]
[nest type: 0=mound, 1=hole (Greer, 1970 Table 1), and additional data and polymorphism from Campbell (1972) Table 1]


Paleognathae                    ???  ?
Neognathae                      ???  ?
Testudines                      ???  ?
Caiman_crocodilus               200  0
Caiman_latirostris              110  0
Melanosuchus_niger              100  0
Paleosuchus_palpebrosus         000  0
Paleosuchus_trigonatus          000  ?
Alligator_mississippiensis      310  0
Alligator_sinensis              310  0
Crocodylus_rhombifer            E01  (0 1)
Crocodylus_acutus               801  (0 1)
Crocodylus_intermedius          801  1
Crocodylus_moreletii            701  0
Crocodylus_siamensis            501  (0 1)
Crocodylus_johnstoni            801  (0 1)
Crocodylus_mindorensis          ???  ?
Crocodylus_novaeguineae         900  0
Crocodylus_porosus              601  0
Crocodylus_palustris            I01  (0 1)
Crocodylus_niloticus            901  1
Crocodylus_cataphractus         E10  0
Osteolaemus_tetraspis           J00  0
Tomistoma_schlegelii            Z00  0
Gavialis_gangeticus             410  1
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
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extinct_taxon                   ???  ?
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extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?
extinct_taxon                   ???  ?

;
END;
CONSTRAINTS outs=((1-3),4-86);
CONSTRAINTS supertree=(Paleognathae,Neognathae,(Testudines,((((((((((((Caiman_yacare,Caiman_latirostris,(Melanosuchus_niger,Melanosuchus_fisheri),Caiman_lutescens),(Purussaurus_spp.,(Orthogenysuchus_olseni,Mourasuchus_spp.))),(Paleosuchus_palpebrosus,Paleosuchus_trigonatus)),Eocaiman_cavernensis),(((((((((Alligator_mississippiensis,Alligator_mefferdi),Alligator_sinensis),Alligator_olseni),Alligator_mcgrewi),Alligator_prenasalis),Arambourgia_gaudryi),Wannaganosuchus_brachymanus),(Allognathosuchus_polyodon,Allognathosuchus_wartheni,Procaimanoidea_kayi)),Ceratosuchus_burdoshi,Hassiacosuchus_haupti)),Stangerochampsa_mccabei),(Brachychampsa_montana,Brachychampsa_sealeyi)),(((Diplocynodon_hantoniensis,Diplocynodon_ratelii),Diplocynodon_darwini),Baryphracta_deponiae)),Deinosuchus),Leidyosuchus_canadensis),((((Crocodylus_rhombifer,(Crocodylus_acutus,Crocodylus_intermedius),Crocodylus_moreletii),((Crocodylus_siamensis,((Crocodylus_johnstoni,(Crocodylus_mindorensis,Crocodylus_novaeguineae)),Crocodylus_porosus)),Crocodylus_palustris),Crocodylus_niloticus,Crocodylus_palaeindicus),Crocodylus_cataphractus,((Osteolaemus_tetraspis,Crocodylus_robustus),Crocodylus_lloidi,Euthecodon_arambourgii)),Crocodylus_megarhinus,(Australosuchus_clarkae,Kembara_implexidens)),(((((Tomistoma_schlegelii,Tomistoma_lusitanica,Gavialosuchus_eggenbergensis),Paratomistoma_courtii),Tomistoma_cairense),Gavialosuchus_americanus),Dollosuchus_spenceri),(((((Gavialis_gangeticus,Gavialis_lewisi),(Gryposuchus_colombianus,Ikanogavialis_gameroi)),Eogavialis_africanus),Thecachampsoides_minor),Thoracosaurus_neocesariensis,Thoracosaurus_macrorhynchus),((Borealosuchus_formidabilis,(Borealosuchus_wilsoni,Borealosuchus_acutidentatus)),Borealosuchus_sternbergii),Pristichampsus_vorax,Brachyuranochampsa_eversolei,Dormaal_crocodyloid,Crocodylus_acer,Crocodylus_affinis,Asiatosuchus_grangeri,Asiatosuchus_germanicus,Prodiplocynodon_langi),(Glen_Rose_Form,Bernissartia_fagesii),Hylaeochampsa_vectiana)));

BEGIN ASSUMPTIONS;
CHARSET  mtDNA       =  2167-2406 3588-3934 5262-6283;
CHARSET  nuDNA       =  165-2166 2407-3587 3935-4497 4514-5202 6284-6920;
CHARSET  morph       =  1-164;
CHARSET  rag1        =  165-2166;
CHARSET  cytb        =  2167-2406;
CHARSET  cmyc        =  2407-3587;
CHARSET  nd6glucytb  =  3588-3934;
CHARSET  bdnf        =  3935-4497;
CHARSET  allozymes   =  4498-4513;
CHARSET  atp7a       =  4514-5202;
CHARSET  18Srflp     =  5203-5228;
CHARSET  28Srflp     =  5229-5261;
CHARSET  12SrDNA     =  5262-5536;
CHARSET  16SrDNA     =  5537-5982;
CHARSET  dloop       =  5983-6283;
CHARSET  ldh_a       =  6284-6920;
CHARSET  chromosomes =  6921-6923;
CHARSET  nest        =  6924-6924;

TAXSET  morph       =  1 4-86;
TAXSET  rag1        =  1-15 21-25;
TAXSET  cytb        =  1-13 15 22-25;
TAXSET  cmyc        =  1-2 4 6-7 9 22-25;
TAXSET  nd6glucytb  =  1-7 9-19 21-25;
TAXSET  bdnf        =  1-11 13 22-25;
TAXSET  allozymesA  =  4-10;
TAXSET  allozymesC  =  11-25;
TAXSET  atp7a       =  3-11 13 22-25;
TAXSET  18Srflp     =  4 9 11-25;
TAXSET  28Srflp     =  4 9 11-25;
TAXSET  12SrDNA     =  1-13 15 22-25;
TAXSET  16SrDNA     =  1-11 13 22-25;
TAXSET  dloop       =  4 9-17 19-25;
TAXSET  ldh_a       =  5-8 10-11 13 22-25;
TAXSET  chromosomes =  4-16 18-25;
TAXSET  nest        =  4-7 9-16 18-25;
;
ENDBLOCK;