#NEXUS 
[MacClade registered to Axel Meyer, Stony Brook]

BEGIN DATA;
DIMENSIONS  NTAX=35 NCHAR=798;
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MATRIX

[                            10        20        30        40        50]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            TATCCGCCCGGGAACTACAAGCACAAGCTTAAAACCCAAAGGACTTGGCG   [50]
A.mytopteris        ..................G.....C.........................   [50]
B.variegatus        ...T....T..A......G...G.G.........................   [50]
C.aceratus          ..................G.....C.........................   [50]
C.gunnari           ..................G.....C.....G...................   [50]
C.hamatus           ..................G.....C.........................   [50]
C.antarcticus       ..................G.....C.........................   [50]
C.mawsoni           ..................G.....C.........................   [50]
D.eleginoides       ..................G.....C.........................   [50]
D.mawsoni           ..................G.....C.........................   [50]
E.maclovinus        ........T.........G.....C.........................   [50]
N.coriiceps         ..................G.....C.........................   [50]
G.acuticeps         ..................G.....C.........................   [50]
H.antarcticus       ........................C.........................   [50]
H.velifer           ..................G.....C.........................   [50]
G.acuta             ..............A...G.....C.........................   [50]
L.nudifrons         ........................C.........................   [50]
L.squamifrons       ........................C.........................   [50]
L.dearborni         ........T...G.....G....GC.........................   [50]
I.cyanobrancha      ..................................................   [50]
G.gibberifrons      ..............A...G.....C.........................   [50]
N.rossii            ..................G.....C.........................   [50]
P.brachycephalum    ........T.........G....GC.........................   [50]
P.macropterus       ..................G.....C.........................   [50]
P.tessellata        ........T.........G.....C.........................   [50]
P.charcoti          ..................G.....C.....G...................   [50]
P.scotti            ..................G.....C.........................   [50]
T.eulepidotus       ..............................G...................   [50]
T.nicolai           ..............................G...................   [50]
T.pennelli          ............T.................G...................   [50]
P.antarcticum       ........T.........G.....C.........................   [50]
T.bernacchii        ..............................G...................   [50]
T.hansoni           ..............................G...................   [50]
P.borchgrevinki     ..............................G...................   [50]
T.newnesi           ..............................G...................   [50]

[                            60        70        80        90        100]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            GTGCTTTAGATCCTCCTAGAGGAGCCTGTTCTAGAACCGATAACCCCCGT   [100]
A.mytopteris        ..............A...................................   [100]
B.variegatus        ........C.....T.......GA.AC..C..........C.........   [100]
C.aceratus          ..............A...................................   [100]
C.gunnari           ..............A...................................   [100]
C.hamatus           ..............A...................................   [100]
C.antarcticus       ..............A...................................   [100]
C.mawsoni           ..............A.................GC................   [100]
D.eleginoides       ..............A...........................C.......   [100]
D.mawsoni           ..............A...................................   [100]
E.maclovinus        ..............T...................................   [100]
N.coriiceps         ..............A...................................   [100]
G.acuticeps         ..............A...................................   [100]
H.antarcticus       ..............A...................................   [100]
H.velifer           ..............A..................A................   [100]
G.acuta             ..............A...................................   [100]
L.nudifrons         ..............G...................................   [100]
L.squamifrons       ..............G...................................   [100]
L.dearborni         ........A.C..A............................G.......   [100]
I.cyanobrancha      ..................................................   [100]
G.gibberifrons      ..............A...................................   [100]
N.rossii            ..............A...................................   [100]
P.brachycephalum    ........A.C..A....................................   [100]
P.macropterus       ..............A...........................C.......   [100]
P.tessellata        ..............G...................................   [100]
P.charcoti          ..............A..................T................   [100]
P.scotti            ..............A...................................   [100]
T.eulepidotus       ..................................................   [100]
T.nicolai           ..................................................   [100]
T.pennelli          ..................................................   [100]
P.antarcticum       ..............A...................................   [100]
T.bernacchii        ..................................................   [100]
T.hansoni           ..................................................   [100]
P.borchgrevinki     ..................................................   [100]
T.newnesi           ..................................................   [100]

[                            110       120       130       140       150]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            TCAACCTCACCTTTCCTTGTTTTTCCCGCCTATATACCGCCGTCGTCAGC   [150]
A.mytopteris        ..................................................   [150]
B.variegatus        ......................................A.......A...   [150]
C.aceratus          ..................................................   [150]
C.gunnari           ..................................................   [150]
C.hamatus           ..................................................   [150]
C.antarcticus       ..................................................   [150]
C.mawsoni           ...........C...........C..........................   [150]
D.eleginoides       ...........C......................................   [150]
D.mawsoni           ..................................................   [150]
E.maclovinus        .......................C..........................   [150]
N.coriiceps         ..................................................   [150]
G.acuticeps         ..................................................   [150]
H.antarcticus       ...........C..........CC..........................   [150]
H.velifer           .......................C..........................   [150]
G.acuta             ..................................................   [150]
L.nudifrons         ..................................................   [150]
L.squamifrons       ..................................................   [150]
L.dearborni         .......................A..........................   [150]
I.cyanobrancha      ..................................................   [150]
G.gibberifrons      ..................................................   [150]
N.rossii            ..................................................   [150]
P.brachycephalum    .......................A..........................   [150]
P.macropterus       ..................................................   [150]
P.tessellata        ..................................................   [150]
P.charcoti          .....................CCC..........................   [150]
P.scotti            .......................C..........................   [150]
T.eulepidotus       ..................................................   [150]
T.nicolai           ..................................................   [150]
T.pennelli          ..................................................   [150]
P.antarcticum       ........................A.........................   [150]
T.bernacchii        ..................................................   [150]
T.hansoni           ..................................................   [150]
P.borchgrevinki     ...........................................T......   [150]
T.newnesi           ..................................................   [150]

[                            160       170       180       190       200]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            CCACCCCGTGAGGGTTTTAAAGTAGGCTTAATTGGCACAGCCCAAAACGT   [200]
A.mytopteris        ......TA...A.....A..........A...............G.....   [200]
B.variegatus        TG....T....A..AA.C.T....A...C..C............G.....   [200]
C.aceratus          ......TA...A..AC.A..........A...............G.....   [200]
C.gunnari           ......TA...A..AC.A..........A...............G.....   [200]
C.hamatus           ......TA...A..AC.A..........A...............G.....   [200]
C.antarcticus       ......TA...A..AC.A..........A...............G.....   [200]
C.mawsoni           ......TA.......C.A......A...A.....................   [200]
D.eleginoides       ......T....A.....A..........AG.......T......G.....   [200]
D.mawsoni           ......TA...A.....A..........A........T......G.....   [200]
E.maclovinus        ......T....A....CA.........AA........A......G.....   [200]
N.coriiceps         ......TA...A.....A..........A........T......GC....   [200]
G.acuticeps         ......TA...A...C.A..........A...............G.....   [200]
H.antarcticus       ......TA...A.....A..........C.........C.....G.....   [200]
H.velifer           ......TA...A.....A..........C...............G.....   [200]
G.acuta             ......TA...A.....A...................T............   [200]
L.nudifrons         .......A..GA.....A..........C........T............   [200]
L.squamifrons       .......A........AA..........A.....................   [200]
L.dearborni         TT....T....A.....A.T....A..AA..C....TTG.....G.....   [200]
I.cyanobrancha      ................AA................................   [200]
G.gibberifrons      ......TA...A.....A................................   [200]
N.rossii            ......TA...A.....A...................T....-.GC....   [199]
P.brachycephalum    TT....T....A.....A.T....A...A..C....TTG.....G.....   [200]
P.macropterus       ......TA...A..AC.A..........A...............G.....   [200]
P.tessellata        .......C.........A...................T............   [200]
P.charcoti          ......TA...A...C.A..........A.....................   [200]
P.scotti            ......TA...A.....A..........C...............G.....   [200]
T.eulepidotus       ..............C..A...........................T....   [200]
T.nicolai           .................A...........................T....   [200]
T.pennelli          ..............C.AA...........................T....   [200]
P.antarcticum       ......TA...A.....A..........A........TG.....G.....   [200]
T.bernacchii        ..............C.AA...................T.A.....T....   [200]
T.hansoni           ..............C..A...........................T....   [200]
P.borchgrevinki     ..............C..A...........................T....   [200]
T.newnesi           ..............C..A...........................T....   [200]

[                            210       220       230       240       250]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            CAGGCCGAGGTGTAGCGTATGGAGAGGGAAGAAATGGGCTACATTCCCTA   [250]
A.mytopteris        .......................A..........................   [250]
B.variegatus        ....T..........T.......A..........C.C.TCC....TT...   [250]
C.aceratus          .......................AG.........................   [250]
C.gunnari           .......................AG.........................   [250]
C.hamatus           .......................AG.........................   [250]
C.antarcticus       .......................AG.........................   [250]
C.mawsoni           .......................AG........................G   [250]
D.eleginoides       ........................G.........................   [250]
D.mawsoni           .......................AG.........................   [250]
E.maclovinus        ......................GA..........................   [250]
N.coriiceps         .......................A..........................   [250]
G.acuticeps         .......................AG.........................   [250]
H.antarcticus       .......................AG.........................   [250]
H.velifer           ..................................................   [250]
G.acuta             .......................AG........................G   [250]
L.nudifrons         .......................A..........................   [250]
L.squamifrons       .......................A..........................   [250]
L.dearborni         ....T............C....GAG.....................G..G   [250]
I.cyanobrancha      .......................A.........................G   [250]
G.gibberifrons      .......................A.........................G   [250]
N.rossii            .......................A..........................   [249]
P.brachycephalum    ....T............C....GAG.....................G..G   [250]
P.macropterus       .......................AG.........................   [250]
P.tessellata        .......................A..........................   [250]
P.charcoti          .......................AG........................G   [250]
P.scotti            .......................A..........................   [250]
T.eulepidotus       .......................A..........................   [250]
T.nicolai           .......................A..........................   [250]
T.pennelli          .......................A.........................G   [250]
P.antarcticum       .......................AG.........................   [250]
T.bernacchii        .......................AG.........................   [250]
T.hansoni           .......................A..........................   [250]
P.borchgrevinki     .......................A..........................   [250]
T.newnesi           .......................AG.........................   [250]

[                            260       270       280       290       300]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            TTTTAGGGCACA-CGAATGATATGCTGAAACGCACATCTT-GAAGGAGGA   [298]
A.mytopteris        ............-.....................A.....-.........   [298]
B.variegatus        ..AA..AA.C.C-.CG..A..G............TG.T..T....T..A.   [299]
C.aceratus          .A..........-......G.G..................-.........   [298]
C.gunnari           .G......T...-......G.G..................-.........   [298]
C.hamatus           .A..........-......G.G.........A........-.........   [298]
C.antarcticus       .A..........-......G.G..................-.........   [298]
C.mawsoni           .A........T.-.....CG.G..T......A........-.........   [298]
D.eleginoides       ..........A.A...........................-.........   [299]
D.mawsoni           ..........A.-...........................-.........   [298]
E.maclovinus        ........T.T.-........C.A........T.G.....-.........   [298]
N.coriiceps         A...........-...........................-.........   [298]
G.acuticeps         .A..........-......G....................-.........   [298]
H.antarcticus       .C..........-......G.G..................-.........   [298]
H.velifer           .C..........-......G.G..................-.........   [298]
G.acuta             ............-......G.G..................-.........   [298]
L.nudifrons         ............-.........C..........GT.....-.........   [298]
L.squamifrons       ............-.........C..........GT.....-.........   [298]
L.dearborni         C.GC..C.A.T.-..G.C...GCA........TT.....--.........   [297]
I.cyanobrancha      ............-........G.............G....-.........   [298]
G.gibberifrons      ............-......G.G..................-.........   [298]
N.rossii            A...........-......G.G..................-.........   [297]
P.brachycephalum    C.GC..C.A.T.-..G.C...GCA........TC.....--.........   [297]
P.macropterus       .AC.....T...-......G.G..........T.......-.........   [298]
P.tessellata        ........T...-.........GC.........GT.....-.........   [298]
P.charcoti          .G.C......T.-......G.G..T......A........-.........   [298]
P.scotti            .C..........-......G.G..................-.........   [298]
T.eulepidotus       ............-........G............TG....-.........   [298]
T.nicolai           ........T...-.....................TG....-.........   [298]
T.pennelli          ............-......C..............T.....-.........   [298]
P.antarcticum       ............-.........C..........G......-.........   [298]
T.bernacchii        ............-........G............T.....-.........   [298]
T.hansoni           ............-.....................T.....-.........   [298]
P.borchgrevinki     .C........T.-.........C...........T.....-.........   [298]
T.newnesi           .G........T.-......G.G............T.....-.........   [298]

[                            310       320       330       340       350]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            TTTAGCAGTAAGCAGAAA-GTAGAGCTCTGCATTTTGACCGCGCGAAGGT   [347]
A.mytopteris        ...............G..-A..............................   [347]
B.variegatus        ...............G..-.C...............A..T..........   [348]
C.aceratus          ...............G..-...............................   [347]
C.gunnari           ...............G..-.......-.......................   [346]
C.hamatus           ...............G..-...............................   [347]
C.antarcticus       ...............G..-...............................   [347]
C.mawsoni           ...............G..-A..............................   [347]
D.eleginoides       ............T..G..-.......C.......................   [348]
D.mawsoni           ...............G..-......-C.C.....................   [346]
E.maclovinus        ...............G..-A........C.....................   [347]
N.coriiceps         ............T..G..-...............................   [347]
G.acuticeps         ...............G..-.................A.............   [347]
H.antarcticus       ...............G..-...............................   [347]
H.velifer           ...............G..-.........C.....................   [347]
G.acuta             ............T..G..-........TGC....................   [347]
L.nudifrons         ...............G..-...............................   [347]
L.squamifrons       ...............G..-...............................   [347]
L.dearborni         ..................-A.....T..C............T........   [346]
I.cyanobrancha      ...............GG.A...............................   [348]
G.gibberifrons      ............T..G..-...............................   [347]
N.rossii            ............T..G..-A..............................   [346]
P.brachycephalum    ..................-A.....T..C............T........   [346]
P.macropterus       ...............G..-...............................   [347]
P.tessellata        ...............G..A...............................   [348]
P.charcoti          ...............GG.-.C.............................   [347]
P.scotti            ...............G..-A........C.....................   [347]
T.eulepidotus       ..................-...............................   [347]
T.nicolai           ...............G..-...............................   [347]
T.pennelli          ...............G..-...............................   [347]
P.antarcticum       ...............G..-...............................   [347]
T.bernacchii        ...............G..-...............................   [347]
T.hansoni           ...............G..-...............................   [347]
P.borchgrevinki     ...............G..-...............................   [347]
T.newnesi           ...............G..-..........................T....   [347]

[                            360       370       380       390       400]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            AGCGCAATCATTTGTCTCTTAAATGGGGACCTGTATGAATGGCATAACGA   [397]
A.mytopteris        ..........C...............A.......................   [397]
B.variegatus        ....A.....C......T...........................G....   [398]
C.aceratus          ..........C.............A.A.................C.....   [397]
C.gunnari           ..........C...............A.................C.....   [396]
C.hamatus           ..........C...............A.................C.....   [397]
C.antarcticus       ..........C.............A.A.................C.....   [397]
C.mawsoni           ..........C...............A.................C.....   [397]
D.eleginoides       ..........C...............A.......................   [398]
D.mawsoni           ..........C...............A.......................   [396]
E.maclovinus        ..........C......T........A.......................   [397]
N.coriiceps         ..........C...............A.................C.....   [397]
G.acuticeps         ..........C...............A.................C.....   [397]
H.antarcticus       ..........C......T........A.................C.....   [397]
H.velifer           ..........C...............A.................C.....   [397]
G.acuta             ..........C...............A.......................   [397]
L.nudifrons         ..........C.......................................   [397]
L.squamifrons       ..........C...............A.......................   [397]
L.dearborni         ..........C......T.......AA.......................   [396]
I.cyanobrancha      ...A......C...............A.......................   [398]
G.gibberifrons      ..........C...............A.......................   [397]
N.rossii            ..........C...............A...T.............CG....   [396]
P.brachycephalum    ..........C......T.......AA.......................   [396]
P.macropterus       ..........C...............A.................C.....   [397]
P.tessellata        ..........C...............A.......................   [398]
P.charcoti          ..........C...............A.................C.....   [397]
P.scotti            ..........C...............A.................C.....   [397]
T.eulepidotus       ..........C.......................................   [397]
T.nicolai           ..........C.......................................   [397]
T.pennelli          ..........C.......................................   [397]
P.antarcticum       ..........C...............A.......................   [397]
T.bernacchii        ..........C.......................................   [397]
T.hansoni           ..........C.......................................   [397]
P.borchgrevinki     ..........C.......................................   [397]
T.newnesi           ..........C.............................T........G   [397]

[                            410       420       430       440       450]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            GGGCTTAGCTGTCTCCTCCCCTAAGTTAATGAAATTGATCTTTCCGTGCA   [447]
A.mytopteris        ..................................................   [447]
B.variegatus        .......A.........TTTTC....C..............CC.......   [448]
C.aceratus          .........................................CC.......   [447]
C.gunnari           .........................................CC.......   [446]
C.hamatus           .........................................CC.......   [447]
C.antarcticus       .........................................CC.......   [447]
C.mawsoni           .........................................CC.......   [447]
D.eleginoides       ...........................................T......   [448]
D.mawsoni           ..................................................   [446]
E.maclovinus        ..................TT................A.....C.......   [447]
N.coriiceps         ..................................................   [447]
G.acuticeps         .........................................CC.......   [447]
H.antarcticus       .........................................CC.......   [447]
H.velifer           .........................................CC.......   [447]
G.acuta             ..................................................   [447]
L.nudifrons         ................C....C............................   [447]
L.squamifrons       ................C....C............................   [447]
L.dearborni         .......A..........TTTCC...C......G........C.......   [446]
I.cyanobrancha      ..................................................   [448]
G.gibberifrons      ..................................................   [447]
N.rossii            ..................................................   [446]
P.brachycephalum    .......A..........T.TCC...C......G........C.......   [446]
P.macropterus       .........................................CC.......   [447]
P.tessellata        ................C..T.C............................   [448]
P.charcoti          ..........................................C.......   [447]
P.scotti            .........................................CC.......   [447]
T.eulepidotus       ..................................................   [447]
T.nicolai           ..................................................   [447]
T.pennelli          ..................................................   [447]
P.antarcticum       .........................................CC.......   [447]
T.bernacchii        ..................................................   [447]
T.hansoni           ..................................................   [447]
P.borchgrevinki     ..................................................   [447]
T.newnesi           ................CT....G..G........................   [447]

[                            460       470       480       490       500]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            GAAGCGGGAATAGACACATAAGACGAGAAGACCCTATGAAGCTTTAGACG   [497]
A.mytopteris        ............A.....................................   [497]
B.variegatus        ........G...CC.C..C..............................A   [498]
C.aceratus          ........G...A...............................A.....   [497]
C.gunnari           ........G...A.....................................   [496]
C.hamatus           ........G...A.....................................   [497]
C.antarcticus       ........G...A.....................................   [497]
C.mawsoni           ........G...A.T..................................C   [497]
D.eleginoides       ............T.T..........G..G...............C.....   [498]
D.mawsoni           ............A...............................C.....   [496]
E.maclovinus        ............A.TC.................................A   [497]
N.coriiceps         ............A.....................................   [497]
G.acuticeps         ........G...A.....................................   [497]
H.antarcticus       ........G...A.T...................................   [497]
H.velifer           ........G...A.....................................   [497]
G.acuta             ............A.A...................................   [497]
L.nudifrons         ............A.....................................   [497]
L.squamifrons       ............A.T...................................   [497]
L.dearborni         ............C.A..................................A   [496]
I.cyanobrancha      ..................................................   [498]
G.gibberifrons      ............A.....................................   [497]
N.rossii            ............A...............................A.....   [496]
P.brachycephalum    ............C.A..................................A   [496]
P.macropterus       ........G...A.....................................   [497]
P.tessellata        ............A.....................................   [498]
P.charcoti          ........G...A.T...................................   [497]
P.scotti            ........G...A.....................................   [497]
T.eulepidotus       ..................................................   [497]
T.nicolai           ..................................................   [497]
T.pennelli          ..................................................   [497]
P.antarcticum       ........G...C.....................................   [497]
T.bernacchii        .................................................A   [497]
T.hansoni           ..............T...................................   [497]
P.borchgrevinki     ............AC....................................   [497]
T.newnesi           ..................................................   [497]

[                            510       520       530       540       550]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            T-AAGGTAGCCCAGACTA-CAAGGCCCCAATAAGTGAACAAACCAAAA-G   [544]
A.mytopteris        .-.......A........-....A.T.TC.....A.G...........-.   [544]
B.variegatus        C-....C.....CACG.TAA..AC.-TA.....AG.CCT....TT.C--A   [544]
C.aceratus          .-...........A.A..-..T........C...G.G...........-.   [544]
C.gunnari           .-...........A.A..A..TAA..-T......G.GCT.........-.   [543]
C.hamatus           .-...........A.A..-..T.....T..C...G.G...........-.   [544]
C.antarcticus       .-...........A.A..-..TAAA..T..C...A.G...........-.   [544]
C.mawsoni           .-..........GT....-..TAC...TG....AGA............-.   [544]
D.eleginoides       .-..A..G.A...AG...-....A..ATG....AG.G...........-.   [545]
D.mawsoni           .-.GA....A........-..G.A..TTG....AG..C.......G..-A   [543]
E.maclovinus        A-.......A........-....A...G.....CG.G..........T-.   [544]
N.coriiceps         .-.......A........-....A...T......G.C...........-.   [544]
G.acuticeps         .-...........A....-T.T.A...TG.....CAGC..........T.   [545]
H.antarcticus       .-...........A....-..T.A...TG.....G-G...........-.   [543]
H.velifer           .-...........A....-..T.A..........GAG...........-.   [544]
G.acuta             .-.............A..-........TG.....G.G...........-.   [544]
L.nudifrons         .-.......A........-......TAA......A....T........-.   [544]
L.squamifrons       .-.......A........-......TAA......A.G....G......-.   [544]
L.dearborni         CC....C..AT..TGT..--.TAA.TAA.TAT..G.CTT........GT.   [544]
I.cyanobrancha      .-................-.................G...........-.   [545]
G.gibberifrons      .-.......A.....A..-........TC.....G.............-.   [544]
N.rossii            .-.......A........-....A...T......G..G..........-.   [543]
P.brachycephalum    CC....C..AT..TGT..--.TAA.TAA.TAT.AG.CTT........GT.   [544]
P.macropterus       .-..........TA.A..-..T.A...TG.C...G.GG..........-.   [544]
P.tessellata        .-.......G........-......TAA.....AA.............-.   [545]
P.charcoti          .-..........CT....-..CAC.-.TGT....G...T.......T.-A   [543]
P.scotti            .-...........A....-..T.A..........GAG...........-.   [544]
T.eulepidotus       .-................-.............................-.   [544]
T.nicolai           .-................-......T......................-.   [544]
T.pennelli          .-................-......T......................-.   [544]
P.antarcticum       .-..............G.-..G.A.TGTG....CA.GG...G...G.G-.   [544]
T.bernacchii        .-.......T........-...A..T............T.........-.   [544]
T.hansoni           .-................-...A..T......................-.   [544]
P.borchgrevinki     .-...........A....-....T.T..C...................-.   [544]
T.newnesi           .-................-......T......................-.   [544]

[                            560       570       580       590       600]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            GTTTACTACCCCGATGTCTTTGGTTGGGGCGACCGCGGGGAAAGACAAAA   [594]
A.mytopteris        .CCC.........................................A....   [594]
B.variegatus        .-CCC..G...TT.......C...................T..A.A.T..   [593]
C.aceratus          ..CCC........................................A....   [594]
C.gunnari           .CCCC........................................A....   [593]
C.hamatus           .CCCC.......A................................A....   [594]
C.antarcticus       .CCCC........................................A....   [594]
C.mawsoni           .CCC........A...........................G....AG...   [594]
D.eleginoides       AGCCG.C.....A................................A....   [595]
D.mawsoni           .GCC........A...........................G....A....   [593]
E.maclovinus        .ACC-..G...TCC...............................A....   [593]
N.coriiceps         .ACCC........................................A....   [594]
G.acuticeps         AGCCC........................................A....   [595]
H.antarcticus       .ACCT.......A...........................T....A....   [593]
H.velifer           .G.CC........................................A....   [594]
G.acuta             .CCC.........................................A....   [594]
L.nudifrons         ............A.....................................   [594]
L.squamifrons       .............................................A....   [594]
L.dearborni         AAAC-..G...GA...........................C.TTGA....   [593]
I.cyanobrancha      ..................................................   [595]
G.gibberifrons      .CCC.........................................A....   [594]
N.rossii            .ACCC........................................A....   [593]
P.brachycephalum    AAAC-..G...GA...........................C.TTGA....   [593]
P.macropterus       .CCCC........................................A....   [594]
P.tessellata        ..................................................   [595]
P.charcoti          .CCC-..G....C................................G....   [592]
P.scotti            .GGCC........................................A....   [594]
T.eulepidotus       ....T.............................................   [594]
T.nicolai           ....T.............................................   [594]
T.pennelli          ....T...................................G.........   [594]
P.antarcticum       .GCC-.......A................................A....   [593]
T.bernacchii        ....T.............................................   [594]
T.hansoni           ....T.............................................   [594]
P.borchgrevinki     ....T.......A.....................................   [594]
T.newnesi           ....T.................................C...........   [594]

[                            610       620       630       640       650]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            CCCCCATGTGGAACGGGAGTACAA-CTCCTGAAACTCAGACCGGCAGCTC   [643]
A.mytopteris        ......C.................-.....T.........G.CA......   [643]
B.variegatus        ......C......T...G.C.T..C.C..CC..GTCA...GTTA..T...   [643]
C.aceratus          ......C.................-.....T.....A...G.CC......   [643]
C.gunnari           ......C.................-.....T.....A...G.CC.T....   [642]
C.hamatus           ......C.................-.....T.....A...G.CC......   [643]
C.antarcticus       ......C.................-.....T.....A...G.CC......   [643]
C.mawsoni           ......C.................-.....T.........G.CA......   [643]
D.eleginoides       ......C.................-.....T.........G.CA......   [644]
D.mawsoni           ......C.......A.........-.....T.........G.CA......   [642]
E.maclovinus        ......C.......A.......TG-.....T..G......G.CA......   [642]
N.coriiceps         ......C..A....A.........-.....T.........G.CA......   [643]
G.acuticeps         ......C.................-.....T.........G.CA......   [644]
H.antarcticus       ......C.................-.....T.........G.CA......   [642]
H.velifer           ......C.................-.....T.........G.CA......   [643]
G.acuta             ......C.................-.....T.........G.CA...G..   [643]
L.nudifrons         ......C.................-.....A.....A...G.C.......   [643]
L.squamifrons       ......C.....G...........-.....T.........G.C.G.....   [643]
L.dearborni         ......C......T.....C..CC-.A...AC....A...G.CA......   [642]
I.cyanobrancha      ........................-.....AG........G..A......   [644]
G.gibberifrons      ......C.................-.....T.........G.CA......   [643]
N.rossii            ......C.........-.......-.....T.........G.CA......   [641]
P.brachycephalum    ......C......T.....C..CC-.....AC....A...G.CA......   [642]
P.macropterus       ......C.................-.....T.....A...G.CC......   [643]
P.tessellata        ........................-.....A.........G.C.......   [644]
P.charcoti          ......C.................-.....T..G......G.CT......   [641]
P.scotti            ......C.................-.....T.........G.CA......   [643]
T.eulepidotus       ........................-.....TT........G.C.......   [643]
T.nicolai           ........................-.....TT........G.C.......   [643]
T.pennelli          ........................-.....TT........G.C.......   [643]
P.antarcticum       ......C..........CA.....-T....T.........G.CC.G....   [642]
T.bernacchii        ........................-.....TT........G.C.......   [643]
T.hansoni           ........................-.....TT........G.C.......   [643]
P.borchgrevinki     .............G..........-.....TT........G.C.......   [643]
T.newnesi           ........................-.....T.........G.A.......   [643]

[                            660       670       680       690       700]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            TAAGAAACAAGATTTTT--GACCTA-AAGATCCGGCAATGCCGATTAACG   [690]
A.mytopteris        ..........A......--......-...........G.......C....   [690]
B.variegatus        C.G.C.G..GA....C.--....AT-...........GC......C.G..   [690]
C.aceratus          ..........A......--......-T..................C....   [690]
C.gunnari           ..........A......--......-C..................C....   [689]
C.hamatus           ..........A......--......-T..........G.......C....   [690]
C.antarcticus       ..........A......--......-T..........G.......C....   [690]
C.mawsoni           ....T.....A......--......-...................C....   [690]
D.eleginoides       ...T.............--......-.G.................C....   [691]
D.mawsoni           ....G.....A......--......-.G.................CG...   [689]
E.maclovinus        .........GA......--......-...................C....   [689]
N.coriiceps         ..........A......--......-...................C....   [690]
G.acuticeps         ...C......A......T-......-...................C....   [692]
H.antarcticus       ..........A......--......-...................C....   [689]
H.velifer           ..........A......--.....T-...................C....   [690]
G.acuta             ......GG..A......--......-...................C....   [690]
L.nudifrons         ..........A......--....A.-T.......................   [690]
L.squamifrons       ...T.............--....A.-........................   [690]
L.dearborni         ..GTG....GA.A..C.--....A.T...................C....   [690]
I.cyanobrancha      .................--......-........................   [691]
G.gibberifrons      ......G...A......--......-...................C....   [690]
N.rossii            ..........A......--......-.G.................C....   [688]
P.brachycephalum    ..GT.....GA.A..C.--....A.T...................C....   [690]
P.macropterus       ..........A......--......-T..........G.......C....   [690]
P.tessellata        .................--....A.-....................G...   [691]
P.charcoti          ..........A......--......-...........T.......C....   [688]
P.scotti            ..........A......--.....T-...................C....   [690]
T.eulepidotus       .................--......-........................   [690]
T.nicolai           .................--......-........................   [690]
T.pennelli          .................--......-........................   [690]
P.antarcticum       ..........A......--......-...................C....   [689]
T.bernacchii        .................TT......-........................   [692]
T.hansoni           .................--......-........................   [690]
P.borchgrevinki     .................T-......-........................   [691]
T.newnesi           ........T........--......-........................   [690]

[                            710       720       730       740       750]
[                            .         .         .         .         .]

T.scotti            GACCGAGTTACTCTAGGGATAACAGCGCAATCCCCTTTTAGAGACCATAT   [740]
A.mytopteris        ..................................................   [740]
B.variegatus        A...A................................AC.......GC..   [740]
C.aceratus          ..................................................   [740]
C.gunnari           ..............................................T...   [739]
C.hamatus           ..................................................   [740]
C.antarcticus       ..................................................   [740]
C.mawsoni           ..............................................C...   [740]
D.eleginoides       ..................................................   [741]
D.mawsoni           ..................................................   [739]
E.maclovinus        ..................................................   [739]
N.coriiceps         ..................................................   [740]
G.acuticeps         ..................................................   [742]
H.antarcticus       ..................................................   [739]
H.velifer           ..................................................   [740]
G.acuta             ..................................................   [740]
L.nudifrons         ..................................T...............   [740]
L.squamifrons       ..................................T...............   [740]
L.dearborni         ...........C.....................T.........C......   [740]
I.cyanobrancha      ..................................................   [741]
G.gibberifrons      ..................................................   [740]
N.rossii            ..................................................   [738]
P.brachycephalum    ...........C.....................T.........C......   [740]
P.macropterus       ..................................................   [740]
P.tessellata        A.................................T...............   [741]
P.charcoti          A.................................................   [738]
P.scotti            ..................................................   [740]
T.eulepidotus       ..................................................   [740]
T.nicolai           ..................................................   [740]
T.pennelli          ..............................................C...   [740]
P.antarcticum       ....A.............................................   [739]
T.bernacchii        ..................................................   [742]
T.hansoni           ..................................................   [740]
P.borchgrevinki     ..................................................   [741]
T.newnesi           .....................T............................   [740]

[                            760       770       780       790      ]
[                            .         .         .         .        ]

T.scotti            CAACAAGGGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACATCCTATTGG   [788]
A.mytopteris        ................................................   [788]
B.variegatus        ..........................................C.G.A.   [788]
C.aceratus          ................................................   [788]
C.gunnari           ................................................   [787]
C.hamatus           ................................................   [788]
C.antarcticus       ................................................   [788]
C.mawsoni           ................................................   [788]
D.eleginoides       ................................................   [789]
D.mawsoni           ................................................   [787]
E.maclovinus        ................................................   [787]
N.coriiceps         ................................................   [788]
G.acuticeps         ................................................   [790]
H.antarcticus       ................................................   [787]
H.velifer           ................................................   [788]
G.acuta             ............................................G...   [788]
L.nudifrons         ................................................   [788]
L.squamifrons       ............................................G...   [788]
L.dearborni         .G..........................................A...   [788]
I.cyanobrancha      ................................................   [789]
G.gibberifrons      ............................................G...   [788]
N.rossii            ................................................   [786]
P.brachycephalum    .G..........................................A...   [788]
P.macropterus       ............................................C...   [788]
P.tessellata        ................................................   [789]
P.charcoti          ................................................   [786]
P.scotti            ................................................   [788]
T.eulepidotus       ................................................   [788]
T.nicolai           ................................................   [788]
T.pennelli          ...........................................G....   [788]
P.antarcticum       ................................................   [787]
T.bernacchii        ................................................   [790]
T.hansoni           ................................................   [788]
P.borchgrevinki     ................................................   [789]
T.newnesi           ..............T.................................   [788]
;
END;


BEGIN CODONS;
GENCODE UNIVNUC
;
END;

BEGIN ASSUMPTIONS;


	USERTYPE tstv21 STEPMATRIX = 4
	     A C G T
	 [A] . 2 1 2
	 [C] 2 . 2 1
	 [G] 1 2 . 2
	 [T] 2 1 2 .
	;

	USERTYPE tstv41 STEPMATRIX = 4
	     A C G T
	 [A] . 4 1 4
	 [C] 4 . 4 1
	 [G] 1 4 . 4
	 [T] 4 1 4 .
	;

	OPTIONS  DEFTYPE=unord PolyTcount=MINSTEPS ;

END; 

BEGIN TREES; 

	TRANSLATE
		1	T.scotti,
		2	A.mytopteris,
		3	B.variegatus,
		4	C.aceratus,
		5	C.gunnari,
		6	C.hamatus,
		7	C.antarcticus,
		8	C.mawsoni,
		9	D.eleginoides,
		10	D.mawsoni,
		11	E.maclovinus,
		12	N.coriiceps,
		13	G.acuticeps,
		14	H.antarcticus,
		15	H.velifer,
		16	G.acuta,
		17	L.nudifrons,
		18	L.squamifrons,
		19	L.dearborni,
		20	I.cyanobrancha,
		21	G.gibberifrons,
		22	N.rossii,
		23	P.brachycephalum,
		24	P.macropterus,
		25	P.tessellata,
		26	P.charcoti,
		27	P.scotti,
		28	T.eulepidotus,
		29	T.nicolai,
		30	T.pennelli,
		31	P.antarcticum,
		32  T.bernacchii,
		33  T.hansoni,
		34  P.borchgrevinki,
		35  T.newnesi

	;
	TREE tnn =  [&R] ((((1,20,28,29,30,32,33,34,35,17,25,18,16,21,2,9,10,12,22,31),(4,6,24,7,5,8,26,13,14,15,27),11),(19,23)),3);
	TREE 'nototheniidae-em' =  [&R] ((((1,20,28,29,30,32,33,34,35,17,25,18,16,21,2,9,10,12,22,31),(4,6,24,7,5,8,26,13,14,15,27),11),(19,23)),3);
	TREE Nototheniidaetree =  [&R] (((((((28,1,29,30,32,33,34,35),(2,31)),(20,12,21,16,18,25,17,22)),(11,9,10)),4,6,24,7,5,8,26,13,14,15,27),(19,23)),3);
	TREE  * nototheniidae =  [&R] ((((1,20,28,29,30,32,33,34,35,17,25,18,16,21,2,9,10,12,22,31,11),(4,6,24,7,5,8,26,13,14,15,27)),(19,23)),3);

END;



BEGIN MACCLADE;
v 3.0
-1315943986
0000&/0
0
0
END;