#NEXUS begin data; dimensions ntax=36 nchar=1240; format gap=- datatype=DNA matchchar=. ; matrix [Date: 28 May 1998 19:28:26 +0900. Alignment of mt tRNAs as used in Waddell, Cao, Hauf, and Hasegawa 1999, Syst. Biol] [Here is an example of how the sequences were aligned and sites selected. The method to do this follows that in Kumazawa, Y., and M. Nishida. (1993). Sequence evolution of mitochondrial tRNA genes and deep-branch animal phylogenetics. J. Mol. Evol. 37: 380-398. Here is an example using the tRNA for Alanine. It is coded on the light strand, while other tRNA's are coded on either the light or heavy strand. Since the two strands have distinctive base compositions, only L strand sequences were used, irrespective of the strand they were coded on. After aligning using the infered secondary structure as a guide, regions corresponding to varaible length loops (sites in lower case) which are ambiguous to align were excluded. So too were the anticodons, marked here with *'s (these are effectively invariant sites in this analysis). tRNA(Ala-A) *** Galga GAGGCCT-TA-GCTT-AATTA---AAGC-G-TCTGA-TTTGCAT-TCAGG-AGAT-ACAGG---TTAATGT-CCTGT-TGGTCTTA Strca AAGGCCT-TA-GCTT-AATTA---AAGC-A-TCTGA-TTTGCGT-TCAGA-GGAT-ACAGG---TTAATGT-CCTGT-TGGTCTTA Allmi GAGGTTT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-T-TCTGA-TTTGCAC-TTTGA-AGAT-GCCGG---ATAGAGT-CCTGC-AAACCTTA Musmu GAGGTCT-TA-GCTT-AATTA---AAGC-A-ATTGA-TTTGCAT-TCAAT-AGAT-GTAGG---ATGAAGT-CTTAC-AGTCCTTA Ratno GAGGATT-TA-GCTT-AATTA---AAGC-A-GTTGA-TTTGCAT-TTAAC-AGAT-GTAAG---ATATAGT-CTTAC-AGTCCTTA Bosta GAGGATT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-GTTGA-TTTGCAT-TCAAT-TGAT-GTAAG---GTGTAGT-CTTGC-AATCCTTA Balmu GAGGATT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-TTTGA-TTTGCAT-TCAAT-TGAT-GTAAG---ATATAGT-CTTGC-AGTCCTTA Balph GAGGATT-TA-GCTT-AATTA---AAGC-G-TTTGA-CTTGCAT-TCAAT-TGAT-GTAAG---ATATAGT-CTTGC-AGTCCTTA Dasno GAGGACT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-CCTGA-TTTGCGT-TCAGG-AGAT-GTGGG---GCTAAAT-CTTGC-AGTCCTTA Halgr AAGGGCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-A-GTTGA-TTTGCAT-TCAGT-TGAT-GTAAG---ATAGAGT-CTTGC-AGTCCTTA Phovi AAGGGCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-A-GTTGA-TTTGCAT-TCAGT-TGAT-GTAAG---ATAGAGT-CTTGC-AGTCCTTA Felca GAGGACT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-TTTGA-TTTGCAA-TCAAT-TGAT-GTAAG---ATAGATT-CTTGC-AGTCCTTA Equca AAGGGCT-TA-GCTT-AATAA---AAGA-G-TTTGA-TTTGCGT-TCAAT-TGAT-GTGAG---ATAGAGT-CTCGC-AGTCCTTA Rhiun GAGGGTT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-CTTGA-TTTGCAT-TCAAT-TGAT-GTAGG---ATAGAGT-CTTGC-AGCCCTTA Homsa AAGGGCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-GCTGA-TTTGCGT-TCAGT-TGAT-GCAGA---GTGGGGT-TTTGC-AGTCCTTA Pantr AAGGGCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-GCTGA-TTTGCGT-TCAGT-TGAT-GCAGA---GTGGGGT-TTTGC-AGTCCTTA Panpa AAGGGCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-GCTGA-TTTGCGT-TCAGT-TGAT-GCAGA---GTGGGGT-TTTGC-AGTCCTTA Gorgo AAGGGCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-GCTGA-TTTGCGT-TCAGT-TGAT-GCAGA---GTAGGGT-TTTGC-AGTCCTTA Ponpy GAGGGCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-GCTGA-TTTGCGC-TCAGT-TGAT-GCAAA---GTGGGGT-TTTGC-AGTCCTTA Ponab GAGGGCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-GCTGG-TTTGCGT-TCAGT-TGAT-GCAGA---GCGGGGC-TTTGC-AGTCCTTA Hylla AAGGGCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-ACTGA-TTTGCGT-TCGGT-TGAT-GCAAA---GT-GGGC-TTTGC-AGTCCTTG Erieu GAGGATT-TA-GCTT-AAAAA---AAGT-G-GTTGA-TTTGCAT-TCAAT-TGAT-ATAGG-aaATATAAT-CTTGT-AATCCTTA Loxaf AAGGGCT-TA-GTTT-AGTTA---AAGC-G-TCTGA-TTTGCAT-TCAGT-TGAT-GTAAG---ATAGTAT-CTTGC-AGTCCTTA Macro AAGAATT-TA-GCTT-AATGA---AAGT-G-TTCGA-TTTGCGT-TCGGA-TGAT-GCAAG---ATAAAGG-CTTGT-AATTCTTA Didvi AAGAATT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-A-TTCGA-TTTGCGT-TCGAG-TGAT-GCAAG---ATAAAGT-CTTGT-AATTCTTA Ornan GAGAATT-TA-GCTTaAAGTA---AAGT-A-GTTGA-TTTGCAG-TCAAA-AGAT-GGAAG-----AGAGA-CTTCC-AATTTTCG Xenla AAGGCTT-TA-CGTT-AATTA---AAGT-G-TTTGA-GTTGCAT-TCAAT-TGAT-GTTGG---ATAAAAT-CCTGC-AAGCCTTA Latch GAGGCCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-TCTGG-TTTGCAT-TCAGA-ATAT-GTGGG---GTAGTAT-CCTAC-AGGTCTTA Prodo AAAGCCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-A-TTTGA-GTTGCAT-TCATA-AGAT-GTGGG---GTAGAGT-CCCAC-AGGTTTTA Cypca AAGGCCT-TA-GCTT-AATAA---AAGT-G-TCTGA-TTTGCAA-TCAGA--GAT-GCAAG---TTAATAT-CTTGT-AGGCCTTA Crola AAGGCCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-TCTGA-TTTGCAT-TCAGA-AGAT-GTGGG---ATAGAGT-CCTCG-AGGTCTTA Gadmo AAGGTCT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-A-TTTGT-TTTGCAT-ACAGA-AGAT-GTGGG---GTAGTGT-CCTGC-AGATCTTA Oncmy AAGGCTT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-TCTGG-GTTGCAT-TCAGA-AGAT-GTGGG---ATAAAGT-CCTGC-AAGTCTTA Polor AGGGTTT-TA-GCTT-AATTA---AAGT-G-TTTGA-GTTGCAT-TCATA-AGAT-GTGGG---ATAAAGT-CCTGC-AAATCCTA Musma AAGGTTT-TA-GCTT-AATGA---AAGT-A-TCTGG-GTTGCAT-TCAGA-AGAT-GTGAG---ATAGAGT-CTTGC-AAATCTTA Petma AAAATTT-TA-GCTT-AATTTa--AAGC-A-TCTGA-TTTGCGT-TCAGA-AGAT-GTGAG-----GATAT-CTTGC-AAATTTTA ] [36 1240 mt-tRNAs: Phe Val Leu(TTR) Ile Gln Met Trp Ala Asn Cys Tyr Ser(TCN) Asp Lys Gly Arg His Ser(AGY) Leu(CTN) Glu Thr Pro] Bosta [Bos taurus (cow) # J01394] GTTGATGTAGCTTAAGCAAGGCACTAATGCCTAGATGAGTCAACTCCATAAACACAAGAT ATAGCTTAAGCATCCAGTTACCTAGAAGACTTCATATGAATATCTTGAGTTAAGGTGGCA GTTGCATAAAACTACTTTTATATCCAGAGATTCAAATCCTCTCCTTAACAAGAAATATGT CTGAAGAGTTACTTTAGAGTAAATAATAGAGGCCTCTTATTTCTACTAGAACTATAGGAA TCGAACCTACTCCTAAGAATCAACTCTTCGTGCTCCCACACCAAATTCTAAGTAAGGTCA GCTAATTAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCGTACTAAGGAATTTAGG TTGACCAAGAGCCTAAGCCCTAAGCAAGTATACTTAATTCCTGTAAGGATTGCAAGACTA CACCTTACATCAATTGAATAATCAACCACTTTAATTAAGCTAAATCCTCCTAGACTGGTG GGCTCCACCCCCACGAAACTTTAGTTAGCTAAACACCCTGGCTTCAATCTAAAGCCCCGG CAGAGCTGCTTCTCTGAATTAATTCAACGTGTTCACCACAGGGCTTGGTAAAAAGAGGCC TCTATCTTTAGATTAGTCTAATGCTTCAGCCATTTTACCTAAGAAAGGAAGG-AATCGAA CCCCCTACTATTGGTTAGCCAACATCATATATGTCTCTCTCAAGAGGTGTTAGTAATTAT ATAATTTTAAAGTTAAGTTACAAGCCTGTACACCTCACACTAAGAAGCTATAGCACTAAC CTAAGTTAGAGATTGAGAGCTCTCCTTGGTGAATTCTTTTAGTATGTACAGCTGACTAAT CAGCTAGTTTCGGCCGAAAAAGAATATGGTACTTAGTTTAAATAAATGATTACTCATTAG ATTATGATCATAATTACCAAGTAAATATAGTTTAAACATTAGATTAATCTAACAATAGAA ACTTCTTATTTACCGAAAAAGCAAGAACTAATTCTACCATATATGGCTTTTTCGACTTTT AAAGGATATCCGTTGGTCTGAACCAAATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCTTAC ATGGAATCTAACCATGACTAATGATATAAACCATCGTTGCAACTACAAGAACGTCTTTGT AGTACATATACTGGTCTAAACCAGAGAAGGAGACCTCCCTAAGACTTCAAGGAAGAAACG TCTCACCATCAACCCAAGCTGAAGTTCAAACTATTCCCTG Balmu [Balaenoptera musculus (blue whale) # X72204] GTTAATGTAGCTTAAGCAAGACACTAATGTCTAGATGGGTTAACCCCATTGGCACAAGAT ATAGCTTAAGCATCTAGTTACCTAGAAGATTCCACGTGCATATCTTGAGTTGAGGTGGCA GTTGCATAAAACTACCTTTACACTCAGAGGTTCAAATCCTCTCCCCAACAAGAAATATGT CTGAAGAGTTACTTTAGAGTAAATAATAGAGGCCTCTTATTTCTACTAGAATAATAGGAA TCGAACCTACCCTTAAGAATTAGTTCTTCGTGCTACCACACTACAATCTAAGTAAGGTCA GCTAAACAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCATACTAAGGAGTTTAGG TTGACCAAGGGCCTAAGCCCTAAGCAAGTATACTTAACTCCTGTAAGGACTGCAAGACTA TATCTTACATCAATTGAATAATCAAACACTTTAATTAAGCTAAATCCTCCTAGATTGGAG GGATACATCCCCACGAATTTTTAGTTAGCTAAATACCCTGGCTTCAATCTAAAGTCCCGG CAGGGCTGCTTCCTTGAATTAATTCAAAATGATCACCACAGGACTTGGTAAAAAGAGGCC TCTGTCTTTAGATTAGTCTAATACCTCGGCCATTTTACCCAAGAAAGGAAGG-AATCGAA CCTTCTCCCATTGGTTAGCCAATATCATATATGTCTTTCTTTAGAGATATTAGTAATTAT ATAACTTTAAAGTTAAGTTACAAGCCTGTATATCTCCCATTAAGAAGCTACAGCGTTAAC CTAAGTTAAAGATTGAGAGCTCCCCTTAATGAGTTCTTTTAGTATGTACAACTGACTAAT CAGTTAGTTTCGGCCGAAAAAGAACATGGTATTTAGTTTAAACAAGTGATTACCCACTAG ACTGTGATCACAACTACCAAGTAAGTATAGTTTAGACATTAGTTTAAACTAGCGATAGAA GCTTCTTACTTACCGAAAAAGCAAGAACTAACTCATCCACATGTGGCTTTTTCAACTTTT ACAGGATATCCATTGGTCTGAACCAAATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCTCAC ATGGACTTCAACCATGACCAATGACATAAATCATCGTTGCAACTACAAGAACGTCTTTGT AGTATATACCTCGGTTTAAACCGAAGAAGGAGACCTCCCTAAGACTTCAAGGAAGAAGCA CTCCACCATCAGCACAAGCTGAAATTCAAACTATTCCCTG Balph [Balaenoptera physalus (fin whale) # X61145] GTTGATGTAGCTTAAGCAAGACACTAATGTCTAGATGGGTCAACCCCATTGACACAAGAT ATAGCTTAAGCATGTAGTTACCTAGAAGATTCCACGTGTATATCTTGAGTTGAGGTGGCA GTTGCATAAAACTACTTTTACACCCAGAGGTTCAAATCCTCTCCCCAACAAGAAATATGT CTGAAGAGTTACTTTAGAGTAAATAATAGAGGCCTCTTATTTCTACTAGAATAATAGGAA TCGAACCTACCCTTAAGAATTAGTTCTTCGTGCTACCACACTACAATCTAAGTAAGGTCA GCTAAACAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCATACTAAGGAGTTTAGG TTGACCAAGAGCCTAAGCCCTAAGCAAGTATACTTAACTCCTGTAAGGACTGCAAGACTA TATCTTACATCAATTGAATAGTCAAACGCTTTAATTAAGCTAAATCCTCCTAGATTGGAG GGATACATCCCCACGAATTTTTAGTTAGCTAAATACCCTGGCTTCAATCTAAAGTCCCGG CAGGGCTGCTTCCTTGAATTAATTCAAAATGATCACCACAGGACTTGGTAAAAAGAGGCC TCTGTCTTTAGATTAGTCTAATACCTCGGCCATTTTACCCAAGAAAGGAAGG-AATCGAA CCCTCTCCCATTGGTTAGCCAACATCATATATGTCTTTCTTTAGAGATATTAGTAATTAT ATAACTTTAAAGTTAAGTTACAAGCCTGTATATCTCCCATTAAGAAGCTATAGCATTAAC CTAAGTTAAAGATTGAGAGCTCTCCTTAATGAGTCCTTTTAGTATGTACAACTGACTAAT CAGTTAGTTTCGGCCGAAAAAGAACATGGTATTTAGTTTAAACAAGTGATTACCCACTAG ACTGTGATCACAATTACCAAGTAAGTATAGTTTAGACGCTAGTTTAAACTAACAATAGAA GCTTCTTACTTACCGAAAAAGCAAGAACTAATTCATCCACATGTGGCTTTTTCAACTTTT ACAGGATATCCATTGGTCTGAGCCAAATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCTCAC ATGGACTTCAACCATGACCAATGACATAAATCATCGTTGCAACTACAAGAACGTCTTTGT AGTATATACCCCGGTTTAAACCGGAAAAGGAGACCTCCCTAAGACTTCAAGGAAGAAGTA CTCCACCATCAGCACAAGCTGAAGTTCAAACTATTCCCTG Halgr [Halichoerus grypus (grey seal) # X72004] GTTAATGTAGCTTAAGCAAGGCACTAATGCCTAGATGAGCCGGCTCCATAAACACAAAGT GTAGCTTAAGCGTCTGGCTACCCAGAAGATTTCACGTGACCACTTTGAGTTAGGGTGGCA GTTGCATAAAACTACCTTTATCTTCAGAGGTTCAACTCCTCTCCCTAACAAGAAATATGT CTGAAGAGTTACTTTAGAGTAAATAATAGAGGCCTCTTATTTCTACTAGAACAATAGGAA TCGAACCTAATCCTAAGAATTAAATCTCCGTGCTACCACACCATATTCTAAGTAAGGTCA GCTAAATAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCGTACTAAGAGATTTAGG CTGACCAAGGGCCTAAGCCCTAAGTAAGTAAACTTAATCTCTGTAAGGACTGCAAGACTC TATCTTACATCAACTGAATAATCAACTACTTTAATTAAGCTAAGCCCTTCTAGATCGGTG GGCCTCTATCCCACGAAACTTTAGTTAGCTAAAAACCCTGGCTTCAATCTAAAGCCCCGG CAGGGCTGCTTCTTTGAATTAATTCAACGTGATCACCACAGGACTTGGTAAAAGGGGGCC CCCATAGTTAGATTAGTCTAATGCTTCAGCCATTTTACCTAAGAAAGGAAGG-AGTCGAA CCCTCTGAAACTGGTTAGCCAATACCATATATGTCTTTCTCAAGAGGCATTAGTAATTAC ATAACTTTAAAGTTAAATTATAGGCCTTTATGCCTCCCATTAAGAAGCTATAGCGTTAAC CTAAGTTAAAGACTGAGAGCTCTCCTTAATGAGCTTCCTTAGTATGTATAGTTGACTAAT CAACCAGCTCTGGCCAGAAAGAAGCATGATAATTAGTTTAAACAAATGATTACTCATTAG ATTATGATCATAATTATCAAGTAAATATAGTCTAGATATTAGATTAATCTAATGACAAAA GCTTTTTATTTACCGAAAAAGCAAGAACTAACTCATCCACGCGTGGCTTTTTCAACTTTT AAAGGATATCCATTGGTCTGAACCAAATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCCCAC ATGGAATCTAACCATGACCAATGACATAAGCCATCGTTGCAACTATGAGAACGTCTTTGT AGTATTTACCTTGGTCTAAACCAAAAATGGAGACCTCCCTAAGACTTCAAGGAAGAGGTA CCCCACCACCAGCACAAGCTGACATTCAAACTATTCCCTG Phovi [Phoca vitulina (harbor seal) # X63726] GTTAATGTAGCTTAAGCAAGGCACTAATGCCTAGATGAGCCGGCTCCATAAACACAAAGT GTAGCTTAAGCGTCTGGCTACCCAGAAGATTTCACATGACCACTTTGAGTTAGGGTGGCA GTTGCATAAAACTACCTTTATCTTCAGAGGTTCAACTCCTCTCCCTAACAAGAAATATGT CTGAAGAGTTACTTTAGAGTAAATAATAGAGGCCTCTTATTTCTACTAGAACAATAGGAA TCGAACCTAATCCTAAGAATTAAATCTCCGTGCTACCACACCATATTCTAAGTAAGGTCA GCTAAATAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCGTACTAAGAGATTTAGG CTGACCAAGGGCCTAAGCCCTAAGTAAGTAAACTTAATCTCTGTAAGGACTGCAAGACTC TATCTTACATCAACTGAATAATCAACTACTTTAATTAAGCTAAGCCCTTCTAGATCGGTG GGCCTCTATCCCACGAAACTTTAGTTAGCTAAAAACCCTGGCTTCAATCTAAAGCCCCGG CAGGGCTGCTTCTTTGAATTAATTCAACGTGATCACCACAGGACTTGGTAAAAGGGAGCC CCCATAATTAGATTAGTCTAATGCTCCAGCCATTTTACCTAAGAAAGGAAGG-AGTCGAA CCCTCTGAAACTGGTTAGCCAACACCATATATGTCTTTCTCAAGAGGCATTAGTAATTAC ATAACTTTAAAGTTAAATTATAGGCCTTTATGCCTCCCATTAAGAAGCTATAGCATTAAC CTAAGTTAAAGACTGAGAGCTCTCCTTAATGAGCTTCCTTAGTATGTATAGTTGACTAAT CAACCAGCTCTGGCCAGAAAGAAGCATGATAATTAGTTTAAACAAATGATTACTCATTAG ATTATGATCATAATTATCAAGTAAATATAGTCTAGATATTAGATTAATCTAATGACAAAA GCTTTTTATTTACCGAAAAAGCAAGAACTAATTCATCCACGCGTGGCTTTTTCAACTTTT AAAGGATATCCATTGGTCTGAACCAAATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCCCAC ATGGAATCTAACCATGACCAATGACATAAGCCATCGTTGCAACTACGAGAACGTCTTTGT AGTATTTACCTTGGTCTAAACCAAAAATGGAGGTCTCCCTAAGACTTCAAGGAAGAGGTA CCCCACCACCAGCACAAGCTGACATTCAAACTATTCCCTG Felca [Felis catus (cat) # U20753] GTTAATGTAGCTTAAGCAAGGCACTAATGCCTAGATGAGTCGACTCCATAAACACAAGAT GTAGCTTAAGCATCTGGCTACCCAGAAGATTTCATCTGACCATCTTGAGTTAGGGTGGCA GCTGCATAAAACTGCTTTTATTATCAGAGGTTCAATTCCTCTCCTTAACAAGAAATATGT CTGAAGAGTTACTTTAGAGTAAAACATAGAGGCCTCTTATTTCTACTAGAATAACAGGAA TCGAACCTAATCCTAAGAATCAAATCTTCGTGCTACCACACCATATTCTAAGTAAGGTCA GCTAAATAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCATACTAAGAAGTTTAGG TTGACCAAGAGCCTAAGCTCTAAGCAAGTCGACTTAACTTCTGTAAGGACTGCAAGAATC TATCTTACATCAATTGATTAATCAAACACTTTAATTAAGCTAAGTCCTCCTAGATTGGTG GGCTCTAACCCCACGAAATTTTAGTTAGCTAAATGCCCTGGCTTCAATCCAAAGCCCCGG CAGCGCTGCTTCTTTGAATTAATTCAACATGATCACCGCAGGACTTGGTAAAAAGAGGCC TCTGTCTTTAGATTAGTCTAATGCTTCAGCCATTTTACCTAAGAAAGGAAGG-AATCGAA CCCTCTTTAACTGGTTAGCCAATGCCATATATGTCTTTCTCAAGAAGTATTAGTAATTAC ATAACTTTGAAGTTAAATTATAGGCCTATATGCTTCACATTAAGAAGCTAAAGCATTAAC CTAAGTTAAAGACTGGGAGCTCCCCTTAATGAATTCCTTTAGTATGTACAGTTGACTAAT CAACCAGTTTCGGCCGAAAAGGAATATGATAATTAGTTTAAACAAATGATTACTCATTAG ATTATAGCTATAATTATCAAGTAAATATAGTTTAAACATTAGATTAATCTAATAATGGAA GCTTCTTATTTACCGAAAAAGCAAGAACTAATTCATCCACGCGTGGCTTTTTCAACTTTT ATAGGATATCCATTGGTCTGAACCAAATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCTCAC ATGGAATTTAACCATGACTAATGATATAAACCATCGTTGCAACTATAAGAACGTCTTTGT AGTATATACTTTGGTCTAAACCAAAAAAGGAGACCTCCCTAAGACTTCAAGGAAGAAGCG CCCCACTATCAGCACAAGCTGAAATTCAAACTATTCCTTG Equca [Equus caballus (horse) # X79547] GTTAATGTAGCTTAAGCAAGGCACTAATGCCTAGATGAGTATACTCCATAAACACAAAGT GTAGCTTAAGCATCCAGCTACCTAGAAGATTTCACATGAACACTTTGAGTTAGGGTGGCA GTTGCATAAAACTACCTTTACACTCAGAGGTTCAACTCCTCTCCCTAACAGGAAATATGT CTGAAGAGTTACTTTAGAGTAAAACATAGAGGCCTCTTATTTCTACTAGAACTACAGGAA TTGAACCTGCTCCTGAGAATTAATCCTCCGTGCTACCACACCATGTCCTAAGTAAGGTCA GCTAAATAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCGTACTAAGGAATTTAGG TTGACCAAGAGCCTAAGCTCTAAGCAAGTGCACTTAATTCCTGTAAGGACTGCGAGACTC TATCTCACATCAATTGAACAATCAAACTCTTTTATTAAGCTAAGCCCTTCTAGATTGGTG GGCTACCATCCCACGAAATTTTAGTTAGCTAAATACCCTGGCTTCAATCTAAAGCCCCGG CAGAGCTGCTCCTTTGAATTAATTCAATGTGATCACCACGGGACTTGATAAGAAGAGGCC CCTGTCTTTAGATTAGTCTAATGCTTCAGCCATCTTACCTAAGAAAGGAAGG-AATCGAA CCCCCTCTAACTGGTTAGCCAATATCATAACTATGTCTTTCTCGAGGTATTAGTAATTAC ATGACTTTAAAGTTAAATTATAGGCCTATATACCTCTCACTAAGAAGCTATAGCATTAAC CTAAGTTAAAGATTGAGGGCCCTCCCTAGTGAATTCTTTTAGTATGTACAATTGACTAAT CAATCAGCTTCGGCCGAAAAAGAATATGGTAATTAGTTTAAACAAATGATTACTCATTAA ACTATGATCATAATTACCAAGTAAATATAGTTTAAACACTAGATTGATCTAGAAACAGAA ATTTCTTATTTACCGAGAAAGCAAGAACTAATTCATCCATGCATGGCTCTCTCAACTTTT AAAGGATATCCGTTGGTCTGAACCAAATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCCCAC GTGGAATCTAACCACGACCAATGACATAAATCATCGTTGCAACTATAAGAACGTCCCTGT AGTATTTACCCTGGTCTAAACCAGAAAAGGGGGCCTCCCAAGGACTTCAAGGAAGAAGCG CTCCACCATCAACACAAGCTGAAATTCAAACTATTCCTTG Rhiun [Rhinoceros unicornis (Indian rhinoceros) # X97336] GTTAATGTAGCTTAAGCAAGGCATTAATGCCTAGATGAGACAACTCCATAAACACAAAGT GTAGCTTAAGCACCTAGTTACCCAGGAGATTTCATATGACCACTTTGAGTTAGGATGGCA GCTGCATAAAACTACCTTTATAACCAGAGGTTCAACTCCTCTTCCTAACAAGAAATATGT CTGAAGAGTTACTTTAGAGTAAATAATAGAGGCCTCTTATTTCTACTAGAACCATAGGAA TTGAACCTACTCCTAAGAACTAAATCTTCGTGCTACCACACCACATTCTAAGTAAGGTCA GCTAAACAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCGTACTAAGGAATTTAGG TTGACCAAGAGCCTAAGCCCTAAGCAAGTATACTTAATTCCTGTAAGGGCTGCAAGACTC TATCCTACATCAATTGAATAATCAAGCACTTTAATTAAGCTAAACCCTCCTAGATTGGTG GGCCACTATCCCACGAAACTTTAGTTAGCTAAATACCCTGGCTTCAATCTAAAGCCCCGG CAGAGCTGCTTCTCTGAATTAATTCAACATGATCACCACAGGGCCTGGTAAAGAGAGGCC TCTGTCTTTAGATTAGTCTAATGCTTCAGCCACTTTACCTAAGAAAGGAAGG-AATCGAA CCCCCTCTGACTGGTTAGCCAATATCATATCTATGTCTTTCTCGAGATATTAGTAATTAC ATAACTTTAAAGTTGAGTTATAGGCCTATATATCTCCCATTAAGAAGCTACAGCGTCAAC CTAAGTTGAAGACCGAGAGCTCTCCTTAATGAATTCTTTTAGTATGTACAATTGACTAAT CAATCAGCTTCGGCCGAAAAAGAATATGATAATTAGTTTAAACAAATGATTACTCATTAG ATTATGATCATAATTATCAAGTAGATATAGTTTAAACATTAGATTAATCTAATAATAGAA ACTTCTTATCTACCGAGAAAGCAAGAACTAACTCATCCATATATGGCTTTCTCAACTTTT AAAGGATATCCATTGGTCTGAACCAAATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCTCAC ATGGACTTCAACCATGACCAATAACATAAATTATCGTTGCAACTATAAGAACGTCTTTGT AGTATTTACCCTGGTCTAAACCAGAAAAGGAGACCTCCCCGAGACTTCAAGGAAGAAGCA CTTCACCATCAACACAAGCTGAAATTCAAACTATTCCTTG Dasno [Dasypus novemcinctus (nine-banded armadillo) # Y11832] GTCAACGTAGCTTAAGCGAGGCACTAATGCCTAAACGAATCGATTCCGCAGACACAAAGT GTAGCTTAAGCATCCGGCTACCCAGAAGACTTCAGCTGACCACTTTGAGTTAAGATGGCA GTTGCATAAGACTACCTTTATTACCAGAGGTTCAAATCCTCTTCTTAACAAGGAATATGT CTGAAGAATTACTTTAGAGTAAATAATAGAGGCCTCTTATTCCTACTAGAGTCGCAGGAA TTGAACCTCCACTTGAGAACTAAATCTCCGTGCTACCACACCACACTCTAAGTAAGGTCA GCTAACAAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTAGGCCTTCCCGTACTAAGGGATTTAGG TTGACCAAGAGCCTAAGCCCTTAGCAAGTATACTTAATCCCTGTAAGGACTGCAAGATTT AGCCCCACATCTCCTGAACAATCAGGCACTTTAATTAAGCTAAGTCCTCCTAGACTGGTG GGCTCCAACCCCACGAAATTTTAGTTAGCTAAATACCATGGCTTCAATCTAAAGCCCTGG CAGAGCTGCTTCTCTGAACTAATTCAAA----------CAAGGCTTGGTAAAAAAAGGCC TTTGTCTTTAGATTAGTCTAATGCTTCAGCCATTTTACCCAAGAAAGGAAGG-AATCGAA CCCCCAAAAACTAGTTAGCCAGCTCCATATCTATGACTTTCTCAAGGTATTAATAATTAT ATAACTTTAAAGTTAAATTATAGGCCTTTATACCTTTCCTTGAGATGCTATAGCATTAAC CTAAGTTAAAGACTGAGAGCTCTCCTCAATGAGCTCTATTAGTATGTACAGTTGACTAAT CAACTAGATTCGGCCGAAATAGAGCATAGTAGCTAGTTTAAATAATTGATTACTCAATAG ACTATGATCATAGCTACCAAGTGGACATAGTTTAAACTCTAGATTAATCTAGCAACAGAA C-TTCTTGTTCACCAAGAAAGCAGGAACTAACTCTTCCATATATGGCTTTCTTAACTTTT ATAGGATATCCACTGGTCTGAACCAGCTTGGTGCAAATCCAAATAAAAGTATGTTCCAGC ATGG-AGCTAACCACGACCAATGATATAAACCATCGTTGCAACTACAAGAACGTCCCAGT AGTATTTACCATGGTCTAAACCATAAATGAAGA-CTTCCTAGGACATCAAGGAGAGGATA CCCCACCATCAACACAAGCTGACATTCAAACTACTCCTTG Loxaf [Loxodonta africana # Hauf et al. submitted] GTTAATGTAGCTTAAGCAAGGTACTAATACCTAGACGAGTAAACTCCATAAACACAAAGT GTAGCTTAAGCATCTGGCTACCTAGAAGACCTCATATGATCACTTTGAGTTAAGATAGCA ACTGCATAAAACTGCTTTTACTCACGGAGGTTCAACTCCTCTTCTTAACAAGAAATATGT CTGAAGAATTACTTTAGAGTAAATTATAGAGGCCTCTTATTTCTACTAGAATTATAGGAA TCGAACCTAAACTCGAGAATTAAATCTCAGTGCTACCACACCACGTTCTAAGTAAGGTCA GCTAAATAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTCGGCCCTCCCATACTAAGGAATTTAGG TTGACCAAGAGCCTAAGCCCCAAGTAAGTATACTTAACTCCTGTAAGGACTGCAAGATAC TATCTTACATCAACTGAATAATCAGACGCTTTAACTAAACTAAGCCCTTCTAGATTGGAG GGCTTCAATCCCACAAATTCTTAGTTAACTAAACACCCTGGCTTCAATCTAAAGCCCCGG CAGAGCTGCTTCTTCGAATTAGTTCGACATGTACACTTCAAGGCCTGGCAAAAAGAGATC TCTGTGGTTAGATTAGTCTAATGCCTCAGCCATTTTACCCGAGAAGGGAAGG-AATCGAA CCTCCAACAGTTAGTTAGCCAACTCTATATTTATGCCTTCCCCGGAATTTTAGTAATTAC ATAGCCTTAAAGCTAAGCTACAGGCCCGTAAATTTCTCATTAAGAAGCTATAGCACTAAC CTAAGTTAGAGTATGAGAATTCTCCTTAATGAATTTCTTTAGTATGTATAACTAACTAAT TAGTAGGCTTTGGCCAAAAAGAAATATGGTACTTAGTTTAAACAAATGATTACTCATTAA ACTATGATCATAATTACCAAGCAGACATAGTTTAAACATTAGGTTGACCTATAAATAAGA ACTCTTTGTCTACCAAGAAAGAAGGAACTAATCCCTCCTCATGTGGCTTTCTTAACTTTT AAAGGGTACCCATTGGTCTGCACCAAACTGGTGCAACTCCAGATAAAAGTATACTTCCAC ATGGACTCCTACCATGACTAATGATCTAAACCATCGTTGCAACTATAGAAATACCCCTAT AGTATTTACAATGGTCTAAGCCATAAATGAAAGTTTTCTAAGGGTATCAGGGAAGAGGTA CCTCGCTATCAATACAAACTGAAATTCAAACTATTCCCTG Homsa [Homo sapiens (human) # D38112] GTTTATGTAGCTTAAGCAATACACTAATGTTTAGACGGGCTCACCCCATAAACACAGAGT GTAGCTTAAGCACCCAACTACTTAGGAGATTTCAATTGACCGCTCTGAGTTAAGATGGCA GTCGCATAAAACTAACTTTACAGTCAGAGGTTCAATTCCTCTTCTTAACAAGAAATATGT CTGAAGAGTTACTTTAGAGTAAATAATAGGAGCCCCTTATTTCTACTAGGACTATGAGAA TCGAACCCATCCCTGAGAATCAATTCTCCGTGCCACCACACCCCATCCTAAGTAAGGTCA GCTAAATAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCGTACTAAGAAATTTAGG TTGACCAAGAGCCTAAGCCCTCAGTAAGTTTACTTAATTTCTGTAAGGACTGCAAAACCC CACTCTGCATCAACTGAACAATCAGCCACTTTAATTAAGCTAAGCCCTTCTAGACCAATG GGACTTAAACCCACAAACACTTAGTTAGCTAAGCACCCTGGCTTCAATCTAAAGCCCCGG CAGGGCTGCTTCTTCGAATTAATTCAATATGATCACCTCGGAGCTTGGTAAAAAGAGGCC CCTGTCTTTAGATTAGTCCAATGCTTCAGCCATTTTACCACAAAAAAGGAAGGAATCGAA CCCCCCAAAGCTGGTTAGCCAACCCCATGCATGACTTTTTCAAAAGGTATTAGAAATTTC ATAACTTTAAAGTTAAATTATAGGCCTATATATCTTACACTGTAAAGCTATAGCATTAAC CTAAGTTAAAGATTAAGAGCTCTTTACAGTGAACTCTTTTAGTATGTACCGTTAACTAAT TAACTAGTTTTGATCAAAAAAGAGTATGGTATATAGTTTAAACGAATGATTACTCATTAA ATTATGATCATATTTACCAAGTAAATATAGTTTAAACATCAGATTAATCTGACAACAGAG GCCCCTTATTTACCGAGAAAGCAAGAACTAACTCATCCATGCATGGCTTTCTCAACTTTT AAAGGATATCCATTGGTCTGCCCCAATTTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCTCGC ACGGACTACAACCACGACCAATGATATAAACCATCGTTGCAACTACAAGAACGTCCTTGT AGTATATACACCAGTCTAAACCGGAGATGAAAATTTTCCAAGGACATCAGAGAAAAAGTA CTCCACCATTAGCACAAGCTAAGATTCAAACTATTCTCTG Pantr [Pan troglodytes (chimpanzee) # D38113] GTTTATGTAGCTTAAGCAATACACTAATGTTTCGACGGGTTCACCCCATAAACACAGAGT GTAGCTTAAGCACCCAACTACTTAGGAGATTTCAATTGACCACTCTGAGTTAAGATGGCA GTTGCATAAAACTAACTTTACAATCAGAGGTTCAATTCCTCTTCTTGACAAGAAATATGT CTGAAGAATTACTTTAGAGTAAATAATAGGAGCCCCTTATTTCTACTAGGACTATAAGAA TCGAACTCATCCCTGAGAATCAATTCTCCGTGCCACCACACCCCATCCTAAGTAAGGTCA GCTAAATAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCGTACTAAGAAATTTAGG TTGACCAAGAGCCTAAGCCCTCAGCAAGTTTACTTAATTTCTGTAAGGACTGCAAAACCC CACTCTGCATCAACTGAACAATCAGCCACTTTAATTAAGCTAAGCCCTTCTAGATTAATG GGACTTAAACCCACAAACATTTAGTTAGCTAAACACCCTGGCTTCAATCTAAAGCCCCGG CAGGGCTGCTTCTTCGAATTAATTCAATATGATCACCTCAGAGCTTGGTAAAAAGAGGCC CCTGTCTTTAGATTAGTCCAATGCTTCAGCCATTTTACCACAAAAAAGGAAGGAATCGAA CCCCCTAAAGCTGGTTAGCCAACCCCATGCATGACTTTTTCAAAAGATATTAGAAATTTC ATAACTTTAAAGTTAAATTACAGGCCCGTATATCTTACACTGTAAAGCTATAGCATTAAC CTAAGTTAAAGATTAAGAGCTCTTTACAGTGAACTCTTTTAGTATGTACCGTTAACTAAT TAACTAGTTTTGATCAAAAAAGAGTATGGTATATAGTTTAAACGAATGATTACTCATTAA ATTATGATCATATTTACCAAGTAAATATAGTTTAAACATCAGATTAATCTGACAACAGAG GCCCCTTATTTACCGAGAAAGTAAGAACTAACTCGTCCATGCATGGCTTTCTCAACTTTT AAAGGATATCCATTGGTCTGCCCCAATTTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCTCGC ACGGACTACAACCACGACCAATGATATAAACCATCGTTGCAACTACAAGAACGCCCTTGT AGTATATACACCGGTCTAAACCGGAAACGAAAATCTTCCAAGGACATCAGAGAAAAAGTA CTTCACCATCAGCACAAGCTAAGATTCAAACTATTCTCTG Panpa [Pan paniscus (bonobo) # D38116] GTTTATGTAGCTTAAGCAATACACTAATGTTTCGACGGGTTCACCCCATAAACACAGAGT GTAGCTTAAGCACCCAACTACTTAGGAGATTTCAATTGACCACTCTGAGTTAAGATGGCA GTCGCATAAAACTAACTTTACAATCAGAGGTTCAATTCCTCTTCTTAACAAGAAATATGT CTGAAGAATTACTTTAGAGTAAATAATAGGAGCCCCTTATTTCTACTAGGACTATGAGAG TCGAACCCATCCCTGAGAATCAATTCTCCGTGCCACCACACCCCATCCTAAGTAAGGTCA GCTAAATAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGTTGGCCTTCCCGTACTAAGAAATTTAGG TTGACCAAGAGCCTAAGCTCTCAGTAAGTTTACTTAATTTCTGTAAGGACTGCAAAACCC CACTCTGCATCAACTGAACAATCAGCCACTTTAATTAAGCTAAGCCCTTCTAGATTAATG GGACTTAAACCCACAAACATTTAGTTAGCTAAACACCCTGGCTTCAATCTAAAGCCCCGG CAGGGCTGCTTCTTTGAATTAATTCAATATGATCACCTCAGAGCTTGGTAAAAAGAGGCC CCTGTCTTTAGATTAGTCCAATGCTTCAGCCATTTTACCACAAAAAAGGAAGGAATCGAA CCCCCTAAAGCTGGTTAGCCAACCCCATGCATGACTTTTTCAAAAGATATTAGAAATTTC ATAACTTTAAAGTTAAATTACAGGCCCGTATATCTTACACTGTAAAGCTATAGCATTAAC CTAAGTTAAAGATTAAGAGCTCTTTACAGTGAACTCTTTTAGTATGTACCGTTAACTAAT TAACTAGTTTTGATCAAAAAAGAGTATGGTACATAGTTTAAACGAATGATTACTCATTAG ATTATGATCATATTTACCAAGTAAATATAGTTTAAACATCAGATTAATCTGACAACAGAG GCCCCTTATTTACCGAGAAAGTAAGAACTAATTCATCCATGCATGGCTTTCTCAACTTTT AAAGGATATCCGTTGGTCTGCCCCAATTTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTATATTCTCGC ACGGACTACAACCACGACCAATGATATAAACCATCGTTGCAACTACAAGAACGCCCTTGT AGTATATACACCGGTCTAAACCGGAAACGAAAATATTCCAAGGACATCAGAGAAAAAGTA CTCCACCATCAGCACAAGCTAAGATTCAAACTATTCTCTG Gorgo [Gorilla gorilla (gorilla) # 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Y12025] GTCCTTATAGCTTAAGCATGGCACTGATGCCAAGATGGTATATCCCTAAGGACACAAGAC GTAGCTAAAGCACTCAGCTACCTGAGAGATGTCTAAGGACCGTCTTGAGCTAGCGTGGCA GGTGCAAAAGGCTGCCCTTTATTC-AGAGGTTCAAATCCTCTCCCTAGCTGGAAATGTGC CTGAAGGGTCACTATAAAGTGAAC-ATAGAGGCCTCTCATTTCCTTTAGAAAAGCAGGAA TCGAACCTGCACAAAAGAGATAACTCCTCATACTTCCATATTATTTTCTAAGTAAGGTCA GCTAATTAAGCTATCGGGCCACCCCGAAAATGATGGCCTTCCCCTACTAAGAAACTTAGG ATAACCAAAGGCCTAAGCCTTAAATAAGAGCTCTTAGTTTCTGTAAGACCAACAGGACAT TAACCTGTATCCTCTGAACAATCAGATGCTTTAATTAAGCTAAGGCCTTCTAGACAGATG GGCCTCGATCCCATAATAGTCTAGTTAGCTAGATGCCTAGGCCTCTGTCTAAGGCCCCGA CACGCGTGCATCAATGAGTTAACTCAACATGATCACTACGGGACCCGATAAGAAGAGGCC TCTGTAAAAAGGACAGCCTAACGCTTCAGCCATCTTACCCAAGAAAGGAAGG-AATCGAA CCTCCTCACGTTGGTTAGCCAACTGCACTTATGCTTCTTTCTCGAGAAGTTAGTAATTAC ATAGCCTTAAGACTAAATCACAGGCCTGTACATCTCACATTAAGAAGCTACAGCACTAGC CTAAGCTAGAGAAAGAGGACCCTCCTTAATGAGCTCTTCTAGTATTTACAATTGACTAAT CTCTAAAATCTGGCCAGAGAAGAGCAAGAAAGTTAGTCTAGACAGCTGATTGCTCAGCAA ATTATAGCTATAACTTTCTTGCAAATATAGTTTAAACATTAGACTATTCTAAAAATAGAA GCTTCTTATTTGCCGAGGGGTCAAGAACTAATTCCTCTGAGCTCAGCCCCCTTAACTTTT AAAGGATATCCACTGGTCTGAACCACCTTGGTGCAACTCCAAGTAAAAGTAAATTTCTAC TCGGATATTACCCGAGACCTACAGTCTAAACTGTCGTTGCAACTATAGAAACACTCTAAT AGTTTAAACATTGGTCTAAACCAAAGAAGAAGACCTTCTTAGAGTATCAGAAAGAGAGGC CTCCGCCTCCAGCTCAAGCTGATATTCAAACTACCTTCTG Galga [Gallus gallus (domestic chicken) # 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U62532] GCTAGTGTAGCTTAAGCATAACACTAATGTTAAGACGGACCAGTCCCACAAGCACAAAAT GTAGCTTAAGTATCTCCCTACTGAGATGAAGTCTGCAGACCATTTTGAGTTAGAGTGGCA GTTGCATGAGACCACCCTCAATCCCAGGGGTTCAACCCCCCTCTTTAACTGGCCCTATGC CCGAAGGACTACTTTAGAGTAGAAAATAGGGGCCCCTTAGTGCCTCTAGGAAAGAAGGAC TTGAACCTCCACTAAAAAGATAACTTTCAGTGCTTCCACACCATCTCCTAAGTAAGGTCA GCTGATTAAGCTTTTGGGCCACCCCAAATATGTTGGCCTTCCCCTACTAAGGAGTTTAGA TTAACCAAAAGCCTAAGCTTTAGACAGAGGCCTCTAACTCCTGTAGGATTTGCAGGACTT TATCCCACATCTTATGAATACTCAAACACTTTAATTAAGCTAAAACCCTCTAGATGAGTA GGCCTCGATCCTACATACGTTTAGTTAGCTAAAAGCTTAAGCTTCCACCTAAAGCCCCGG CAGGCCTACGTCTCAGGATTAATCCTGCATGCACACTACAAGGCTTGATAAGAGAAGGCC TTCCTTTACAGGGCAACCTGCCACTTCAGTCATCTTACCCGAGAAAGGAAGG-AATTGAA CCCCCTTAAATCGGTTAGCCGACTGCATATCTGCCACTTTCTTGAGATATTAGTTATAAC ATTGCCTTAAGGCAAAATTACAGGCCTGTATATCTTACATTAAGAAGCTATAGCATTAGC CTAAGCTAAAAATAGGTGACCACCCTTAATGAATTTTTCTAGTATGTACAAATGACTAAT CATTTAGTCTTGGCCAAGGAAAGATAAAGTCTCTAGTCCAGATTATTAATTGCTTAATAG ATTGTGGCCACAGAGACTTAGTTAATATAGTCTAGACATTAGATTATTCTAATAATAGAA GCTTCTTATTGACCGAGAGATCAAGAACTAATTCTTCCTTGCAAGGATCACTCGGCTTTC AAAGGATATCCATTGGTCTGAACCAACTTGGTGCAAATCCAAGTGAAAGCTAATTCTTGC CAGGACTTTAACCAGGACTAATGACTTAAATCACCGTTGCAACTACAAAAATGCCCTAGT AACTTAAGTGTCGGTCTAAACCGAACATGATGGCCATCCTTGGGCTTCAAAGAGAAGAGC TCCTGCCTTTAACTCAAGCTAAAATTCAAACTACTCTTTG Musma [Mustelus manazo (gummy shark) # AB015962] GCTAGTGTAGCTTAAGCATGGCACTGATGCTAAGATGAGAATTTTCCGCGGGCACAAAAT GTGGCTAAAGCACCTCCCTACCGAGGAGATACCCATGGGTCATTTTGAGTTGAGGTGGCA GTTGCAAAAGACCGTCCTTTAATCCAGAGGTTCAAATCCTCTCCTCAACTGGAAGCGTGC CTGAAGGACCACTTTAGAGTGGATAATGAGAGCTCCCCACTTCCTCTAGAAAAATAGGAC TTGAACCTACATCTAAGAGATAACCCTCCGTGTTTCCACACCATATTCTAAGTAGAGTCA GCTAATAAAGCTTTTGGGCCACCCCAACCATGTTGGCCTTCCTTTACTAAGGAATTTAGG TTGACCAAAAGCCTAAGCTTTAAGTAGAAGCTTCTAATTTCTGTAAGATTTGCAAGACTC TATCTCACATCTTCTGAATACCCAGATACTTTCATTAAGCTAAAACCTTCTAGATAAACA GGCCTTGATCCTGTAAAAACTTAATTAGCTAAGCGTTCGAACTTCTATCTAAAGCCCCGG GAGGCCTCCGTCTTTGGATTAATCCAATGTATCTACTTCGGGGCTTGGCAAGAAGAGGCC TCTGTGCACGGAGCAATCCGCCGCTTCAGCCATCTTACCCAAGAAAGGAAGG-AATTGAA CCCCCATATGCTGGTTAGCCAGCCACATCTCTGTCACTTTCTTAAGATACTAGTAATTAC ACTGCCTTAGGGCAGAATTGTGAGCCCGCGTATCTTACATTAAGAAGCTATAGCATTAGC CTAAGCTAACTATTGGTGACCACCCTTAATGAACTTTTCTAGTATGTACAAGTGATTAAT TATTAAATCTTGGCCAAGGAGGAGTAAGATGTTTAGTCCAGACCACTAATTGCTTAGTAA ATTATGGCCATAAACATCTTGTATTTATAGTTTAAATATTAGATTGTTCTAAAGACAAAA GCTTTTTATTTACCGAGAGAGCGAGATCTAATTCTTTCATGCATGGCTCACTCGGCCCTT GAAAGATATCTATTGGTCTGAACCAACTTGGTGCAC-TCCAAGCAAGAGCTTATTCTTAC CTGGGCTTTAACCAAGACCAATAACTTAAACTATCGTTGCAACTATAAGAACGTTTTGGT AGCTTAAGCGTCGACCTAAGTCGAAGATGAGGGCCCTTCCAAAACATCAGGGGAAGGAGC TCCTGCCCTTGGCTCAAGCCAAGATTCAAACTGCCCCCTG Petma [Petromyzon marinus (sea lamprey) # U11880] GTCCAGAGTGCTTAAGCAGAGCACTGCTGCTCAAATGGTTTCAACCCCTTGACACAGAAG ATAGCTTAAGCATTTCCCTACCGAAAATATTCTTGCAAGATCTTCTGAATTTGGATGGCA GTTGCACAAGGTTGCCCTTATACC-AGAGGTGCAAATCCTCTTCCAAATAGGAAGTATGT CCGAGGAACCACTTTAGAGTGGCTACAGGGGACCCCTTTCTTCCTTTAGTATGAAAGGAT TCGAACCTTAATCTGAGAGACAACCCTCCGTGTTTCCACACCACATCCTAGGTAAGATAA GCTAATAAAGCTTTTGGGCCACCCCAAATATGATGCACATCTCTTACTAAGAAATTTAAG TTGACTCTAAGCCTAAGCTTACAGTAAGGGCCCTTAATTTCTGTAAAATTTGCAAGATAT C--CTCACATCTTCTGAACAATCAGATGCTTAAATTAAGCTAAAATTTTCTAGACCAGCA AGCATTATACTTACAACCTCTTAGTTAGCTAAGCGCTATAGCTTTGATCTAAGACCTCAA CAGATCTATATCTTCAGATTAATCTAACATGATCACCATAAGGTCTGATAGGAAGAGATC TCTGTAAGCGGGTCAGCCCACCACCTCGGCCATCCTACCCAAGAAAAGAGGG-ATTCGAA CCCCCCTACGCTGGTTAGCCAGGTGCATAATCTGCCATTTTCTAAGATACTAGTAATTAC ACTACCTTAAGGTAATATTATGAGCTCATGTATCTTGCACTAAGAAGCTATAGCATCAGC CTAAGCTGAAGATGGGCGATCTCCCTTAGTGAGCCTTTTTAATACATATAGTTGGGTAAC CAACCAAACCTGGCCAAGAAAAGGCAGGGGTTT-AGTCTAGACAATTGATTGCTCAATTA ATCTGAATTCAGGAACACCTGCACGCATAGTTTAAACATTAGATTAGTCTAATAAAGAAG GCCCTCTGCCTGCCGAGAGGGTAAGAACTAATTCTTCTGAGCACAGCCCTCTCGGCTTCT AAAGGATATCCGCTGGCCTGTGCCACCTTGGTGCAAATCCAAGTAGAAGCTTATTCTCAT TAAGACTTTAACTTAAACCAGCGACTTAAACCACCGTTGCAACTATAAGAACGCTTTAAT AGCTTAAGCACTGGTCTAAACCAGCGACGAAGATCTTCTTAAAGCATCAAAGGAAGGGGC CCCTATAACTAGCCCAAGCTAGTATCTAAATTATCCTCTG ; end;